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公开(公告)号:CN105378106B
公开(公告)日:2019-08-13
申请号:CN201480026495.3
申请日:2014-03-03
申请人: 阿瑞奥萨诊断公司
IPC分类号: C12Q1/6837
CPC分类号: C12Q1/6883 , C12Q1/6809 , C12Q1/6827 , C12Q1/6862 , C12Q2600/156 , C12Q2600/16 , C12Q2525/155 , C12Q2525/161 , C12Q2533/107 , C12Q2535/131 , C12Q2565/514 , C12Q2565/543 , C12Q2561/125
摘要: 本发明提供用于检测样品中的遗传变体的分析系统和方法,所述遗传变体包括拷贝数变异和单核苷酸多态性。优选地,本发明采用串联连接的技术,联合利用阵列杂交的具体的基因组区域的水平的检测,所述串联连接的技术例如,两个或更多个固定序列寡核苷酸和与固定序列寡核苷酸之间的区域互补的一个或更多个桥接寡核苷酸的连接。
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公开(公告)号:CN108611398A
公开(公告)日:2018-10-02
申请号:CN201810396192.0
申请日:2013-01-11
申请人: DATA生物有限公司
发明人: 帕特里克·S·施纳布尔 , 刘三震 , 吴薇
IPC分类号: C12Q1/6806 , C12Q1/683 , C12Q1/6869 , C12Q1/6874 , C12N15/10
CPC分类号: C12Q1/6874 , C12N15/1065 , C12Q1/6806 , C12Q1/683 , C12Q1/6869 , C12Q2521/301 , C12Q2525/155 , C12Q2525/191 , C12Q2535/122 , C12Q2537/159 , C12Q2565/514
摘要: 本发明涉及通过新一代测序进行基因分型。本文提供与基因分型有关的技术并且特别但不仅仅是通过基因组测序对一种或多种有机体进行基因分型的方法。在所述技术的一些实施方案中,使用两种限制性内切酶以在所消化片段的每个末端产生具有不同突出端的两个位点。一个位点与条形码寡核苷酸连接以允许样本在分析(例如测序)期间的多重化。另一个位点与不具有条形码的寡核苷酸连接。通过设计和选择与非条形码位点互补的扩增引物来进一步减少靶向于分析的位点数目。
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公开(公告)号:CN108474026A
公开(公告)日:2018-08-31
申请号:CN201780008365.0
申请日:2017-01-26
申请人: 豪夫迈·罗氏有限公司
发明人: D.克拉斯
IPC分类号: C12Q1/6806 , C12Q1/6855 , C12Q1/6869
CPC分类号: C12Q1/6869 , C12N15/1065 , C12Q1/6806 , C12Q1/6855 , C12Q2525/155 , C12Q2525/191 , C12Q2535/119 , C12Q2563/179 , C12Q2535/122 , C12Q2565/514
摘要: 本发明是用于以减少的误差率对核酸进行测序的新的Y形(叉状)衔接子,其包含引物结合位点和每个单链部分中的条形码。
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公开(公告)号:CN107532219A
公开(公告)日:2018-01-02
申请号:CN201680027356.1
申请日:2016-03-29
申请人: 爱克瑟拉有限公司
发明人: 大卫·弗雷德里克·恩格勒特 , 凯利·凯·音·塞托
CPC分类号: C12Q1/6806 , C12N15/1006 , C12N15/1013 , C12Q1/6837 , C12Q1/6844 , C12Q1/6846 , C12Q1/686 , C12Q2521/101 , C12Q2531/119 , C12Q2533/101 , C12Q2525/161 , C12Q2525/197 , C12Q2531/113 , C12Q2565/518 , C12Q2525/155 , C12Q2549/119 , C12Q2537/137
摘要: 一种方法和试剂盒,其用于在固体支持物上用亲和捕获探针从样品中捕获和纯化特异性核酸以及用链置换聚合酶复制所述核酸,从而与不同于捕获探针结合的序列的各个靶核酸中的序列互补的第二引物也与靶核酸结合,并且各个靶标上的引物之一的延伸实现复制的核酸链与固体支持物的分离。通用核酸序列在其复制期间的并入使能够以最少的假象产生来同时地且高度特异性地扩增多种核酸靶序列。
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公开(公告)号:CN107532205A
公开(公告)日:2018-01-02
申请号:CN201680017668.4
申请日:2016-03-30
申请人: 伊卢米纳剑桥有限公司
发明人: J.M.鲍特尔
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/6874 , C12N15/10 , C12N15/64 , C12Q1/6806 , C12Q1/6853 , C12Q2525/155 , C12Q2533/101 , C12Q2535/122 , C12Q2565/537 , C12Q2565/543
摘要: 本文中呈现了用于在桥接扩增过程期间串联模板链的方法和组合物。所述方法可用于以改善的密度进行表面扩增。本文中提供的方法和组合物实现簇的创建,所述簇是较亮的,但是与目前使用标准簇扩增实现的密度为相同的密度。
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公开(公告)号:CN107083444A
公开(公告)日:2017-08-22
申请号:CN201710458145.X
申请日:2009-12-22
申请人: 犹他大学研究基金会
发明人: R·M·考森
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/6851 , C12Q1/686 , C12Q2563/173 , C12Q2545/101 , C12Q2525/155 , C12Q2537/143 , C12Q2527/107
摘要: 本文公开了用于用单一检测标记在单个反应孔中测定相比于第二靶核酸拷贝数的第一靶核酸拷贝数的方法和组合物。例如,本文公开了用于用单一检测标记在单个反应孔中通过单色多重定量PCR(MMQPCR)测定相比于第二靶核酸拷贝数的第一靶核酸拷贝数的方法和组合物。
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公开(公告)号:CN106661631A
公开(公告)日:2017-05-10
申请号:CN201580042765.4
申请日:2015-06-08
申请人: 康奈尔大学
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/6874 , C12N15/1068 , C12Q1/6806 , C12Q1/6809 , C12Q1/6816 , C12Q1/6844 , C12Q1/6848 , C12Q1/6855 , C12Q1/6869 , C12Q2531/125 , C12Q2535/122 , C12Q2537/143 , C12Q2565/501 , C12Q2521/319 , C12Q2521/325 , C12Q2521/331 , C12Q2521/501 , C12Q2525/155 , C12Q2525/161 , C12Q2525/179 , C12Q2525/191 , C12Q2525/307 , C12Q2563/179
摘要: 本发明涉及一种用于从血液(即,从无细胞循环DNA、外来体、微RNA、循环肿瘤细胞或总血细胞)高度特异性地靶向捕获人类基因组和转录组的区域的方法,以允许使用组合的核酸酶、连接、聚合酶和大规模并行测序反应的高度灵敏地检测突变、表达、拷贝数、易位、可变剪接和甲基化变化。所述方法产生适于在多个平台上测序的不同环状嵌合单链核酸构建体的集合。在一些实施方案中,所述集合的每个构建体包含来自宿主生物体的原始基因组DNA的第一单链区段和连接至所述第一单链区段且包含对所述宿主生物体而言为外源性的核苷酸序列的第二单链合成核酸区段。这些嵌合构建体适用于识别和枚举突变、拷贝变化、易位和甲基化变化。在其它实施方案中,输入mRNA、IncRNA或miRNA用来生成反映特异性mRNA、IncRNA的拼接位点变体、易位和miRNA的存在和拷贝数的环状DNA产物。
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公开(公告)号:CN103898199B
公开(公告)日:2016-12-28
申请号:CN201210581830.9
申请日:2012-12-27
申请人: 上海天昊生物科技有限公司 , 天昊生物医药科技(苏州)有限公司
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/6827 , C12Q2525/155 , C12Q2525/161 , C12Q2535/131
摘要: 本发明涉及一种高通量基因分析方法及其应用,具体地,包括步骤:对于待分析的n种目的核酸片段,针对每个目的核酸片段,提供结合于所述目的核酸片段的不同结合区的至少2个特异探针,所述的各特异探针具有特异结合区和通用序列区,并且所述的特异结合区的序列与目的核酸片段的结合区的序列互补,而所述通用序列区的序列对应于高通量单分子或单分子扩增簇测序平台的测序引物序列,其中n为≥40的正整数;将含待分析的目的核酸片段的核酸样本与所述探针杂交,并连接所述探针,从而获得探针连接产物的混合物;用所述测序引物对探针连接产物混合物或其扩增产物进行测序,并进行分析,从而实现高通量目的基因片段的定量分析的目的。
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公开(公告)号:CN103827317B
公开(公告)日:2016-09-07
申请号:CN201280034508.2
申请日:2012-05-17
申请人: 德克斯特里蒂诊断公司
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/6813 , C12Q1/6809 , C12Q1/6834 , C12Q1/6855 , C12Q1/6862 , C12Q2523/109 , C12Q2525/155 , C12Q2525/161 , C12Q2525/197 , C12Q2525/204 , C12Q2533/107 , C12Q2537/143 , C12Q2563/131 , C12Q2563/179 , C12Q2565/125 , C12Q2525/15
摘要: 本发明提供用于检测存在于样品中的一个或多个核酸目标的组合物、设备和方法。本发明的方法包括利用两个或更多个接合探针,这些接合探针以可逆方式彼此紧密结合目标核酸并且具有互补的反应性接合部分。当这些探针已经按适当定向结合到目标上时,其能够经历自发化学接合反应,得到接合产物,对这种接合产物直接进行检测,或扩增这种接合产物以产生扩增子,然后对这些扩增子进行检测。本发明还提供用以稳定样品RNA以使得降解不会显著影响分析结果的方法。
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公开(公告)号:CN105899683A
公开(公告)日:2016-08-24
申请号:CN201480072947.1
申请日:2014-12-11
申请人: 凯杰有限公司
发明人: 约安娜·安德里欧 , 方南 , 德科·洛斐尔特 , 安尼卡·彼得罗夫斯基
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/6806 , C12Q1/6853 , C12Q1/686 , C12Q1/6876 , C40B30/00 , C40B40/08 , C12Q2525/155 , C12Q2525/191 , C12Q2535/122
摘要: 本发明涉及用于产生靶DNA的带标签DNA片段和与其相关的核酸分子的新方法、试剂盒和用途。
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