一种精确分辨tRNA来源片段末端单个核苷酸差异的检测方法

    公开(公告)号:CN108796048A

    公开(公告)日:2018-11-13

    申请号:CN201810663764.7

    申请日:2018-06-25

    CPC classification number: C12Q1/6851 C12Q2561/101 C12Q2531/113 C12Q2525/191

    Abstract: 本发明公开了一种精确分辨tRNA来源片段末端单个核苷酸差异的检测方法,包括以下步骤:(1)特异性接头序列、特异性逆转录引物与检测探针和引物序列的设计;(2)接头连接:在RNA中加入步骤(1)中设计的特异性接头序列,经过变性、退火、连接三步形成特异性末端环状发夹结构;(3)步骤(2)所述接头RNA与步骤(1)所述特异性逆转录引物混合进行逆转录;(4)TaqMan qPCR检测。本发明基于TaqMan qPCR方法,为生物体内tRF的研究提供了一种有效且便捷的可精确分辨不同tRF变体的方法,分辨率可精确至单个核苷酸差异,这对于全面深入研究tRF的生物学功能和作用机制具有有重要意义。

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