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公开(公告)号：CN101705290B
公开(公告)日：2011-12-28
申请号：CN200910219005.2
申请日：2009-11-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种奶山羊SCD基因的单核苷酸多态性及其检测方法，其基因单核苷酸多态性包括：以包含SCD基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增奶山羊SCD基因；用限制性内切酶NdeI消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据电泳结果鉴定奶山羊SCD基因第5001bp的碱基多态性。该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与奶山羊泌乳性状密切相关的分子遗传标记，以用于奶山羊的辅助选择和分子育种，加快奶山羊良种繁育速度。
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公开(公告)号：CN102260734A
公开(公告)日：2011-11-30
申请号：CN201110062692.9
申请日：2011-03-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种快速检测山羊同源异型框6(six6)基因单核苷酸多态性(SNP)的方法，以包含Six6基因的待测山羊全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增山羊Six6基因；用限制性内切酶PstI消化PCR产物后，再进行琼脂糖凝胶电泳；根据电泳结果鉴定山羊Six6基因第232位的基因型(以序列Accession No.NM_001104993.1为参考)；在动物生产实践中，由于Six6基因单核苷酸变异或SNP对形成胚胎、调控生长激素和促进垂体分泌激素等具有重要的作用，故将该位点不同基因型与生长发育性状数据进行关联分析。结果发现：CT基因型个体的管围显著大于CC基因型个体(P＝0.047)，说明CT基因型可以作为一个提高山羊管围的分子遗传标记。故本发明提供的快速检测Six6基因SNP的检测方法，在中国山羊生长性状的标记辅助选择(MAS)育种中，有利于快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号：CN102251038A
公开(公告)日：2011-11-23
申请号：CN201110201229.8
申请日：2011-07-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛TMEM18(transmembrane protein 18)基因单核苷酸多态性的方法，其基因多态性包括：在黄牛TMEM18基因第3843位为A或G的碱基多态性；在黄牛TMEM18基因第3873位为G或A的碱基多态性。上述黄牛TMEM18基因的单核苷酸多态性为：以包含TMEM18基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对1F和2F为引物，PCR扩增黄牛TMEM18基因；分别用限制性内切酶XspI和MluI消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛TMEM18基因第3843位和第3873位的单核苷酸多态性；该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与黄牛生产性状密切相关的分子遗传标记，以便于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS)，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号：CN101955996A
公开(公告)日：2011-01-26
申请号：CN201010211243.1
申请日：2010-06-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种单碱基Indel突变的检测方法，根据基因中已知存在的Indel位点设计引物对Pw和Pm，然后PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳检测判型；提取待测样本的全基因组，并以全基因组为模板，以Pw、Pm为引物分别进行PCR扩增；将PCR扩增获得的产物等体积混合进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳相应条带有无来判定待测样本的目的基因Indel变异发生与否。本方法能够方便、准确的对待测样本目的基因的Indel突变做出检测，有非常大的应用价值。而Indel突变在重要的复杂疾病、分子育种和遗传多样性评价等方面的研究有着重大的理论价值。
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公开(公告)号：CN101921852A
公开(公告)日：2010-12-22
申请号：CN201010255603.8
申请日：2010-08-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛AdPLA基因单核苷酸多态性的方法，以包含AdPLA基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增黄牛AdPLA基因；用限制性内切酶FbaI消化PCR产物后，再进行琼脂糖凝胶电泳；根据电泳结果鉴定黄牛AdPLA基因第23076位的基因型；由于AdPLA基因功能涉及初生重、体重、日增重、体斜长、胸围等生长和体尺性状，基因型数据与这些性状关联分析后发现：18月龄和24月龄TT基因型个体的体斜长显著大于CC基因型个体(P＜0.05)；24月龄时TT基因型个体胸围显著大于CC基因型个体(P＜0.05)。以上说明TT基因型可以作为一个提高黄牛体斜长和胸围的候选分子遗传标记。本发明提供的检测方法可以用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS)，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN101921848A
公开(公告)日：2010-12-22
申请号：CN201010236902.7
申请日：2010-07-26
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测的黄牛MGAT2基因单核苷酸多态性的方法，以包含MGAT2基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增黄牛MGAT2基因；用限制性内切酶HaeIII消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛MGAT2基因第495位的单核苷酸多态性。由于MGAT2基因功能涉及体重、日增重生长等性状，本发明提供的检测方法为MGAT2基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础，以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号：CN101899500A
公开(公告)日：2010-12-01
申请号：CN201010108118.8
申请日：2010-02-09
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛KLF7基因单核苷酸多态性的方法，以包含KLF7基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P1、P2、P3等摩尔比的混合物为引物，PCR扩增黄牛KLF7基因；用限制性内切酶TaqI消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛KLF7基因第41401、42025、42075位的单核苷酸多态性。本发明对KLF7基因的SNPs进行了基因分型和基因频率分析，以及与南阳牛不同生长阶段的生长性状之间进行了性状关联分析；结果表明：KLF7基因尤其是P2检测SNP位点可用作黄牛生长性状早期选择(6月龄和12月龄)的分子标记。
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公开(公告)号：CN101875977A
公开(公告)日：2010-11-03
申请号：CN201010235173.3
申请日：2010-07-23
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛SREBP1c基因单核苷酸多态性的方法，以包含SREBP1c基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增黄牛SREBP1c基因；用限制性内切酶Bgl I消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SREBP1c基因第10914位的单核苷酸多态性。由于SREBP1c基因功能涉及体重、日增重、体斜长和胸围4个重要的生长性状，本发明提供的检测方法为SREBP1c基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础，以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS)，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号：CN101705290A
公开(公告)日：2010-05-12
申请号：CN200910219005.2
申请日：2009-11-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种奶山羊SCD基因的单核苷酸多态性及其检测方法，其基因单核苷酸多态性包括：以包含SCD基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增奶山羊SCD基因；用限制性内切酶NdeI消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据电泳结果鉴定奶山羊SCD基因第5001bp的碱基多态性。该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与奶山羊泌乳性状密切相关的分子遗传标记，以用于奶山羊的辅助选择和分子育种，加快奶山羊良种繁育速度。
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公开(公告)号：CN101705289A
公开(公告)日：2010-05-12
申请号：CN200910219003.3
申请日：2009-11-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了奶山羊GHRHR基因的单核苷酸多态性及其检测方法，其基因单核苷酸多态性包括：在如SEQ ID NO.1所示的奶山羊的GHRHR基因序列表的第231位为C或G的碱基多态性。其检测方法为：以包含GHRHR基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增奶山羊GHRHR基因；用限制性内切酶MspI消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据电泳结果鉴定其多态性。该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与奶山羊泌乳性状密切相关的分子遗传标记，以用于奶山羊的辅助选择和分子育种，加快奶山羊良种繁育速度。
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