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公开(公告)号:CN114807342A
公开(公告)日:2022-07-29
申请号:CN202210281910.6
申请日:2022-03-22
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/689 , C12Q1/6888 , G01N33/68 , C12N15/11 , C12R1/46 , C12R1/92
Abstract: 本发明提供了标志物及其检测试剂在制备筛查和/或辅助诊断ASD的试剂盒中的应用。本发明研究发现口腔链球菌Streptococcaceae(科)丰度、口腔链球菌噬菌体(Streptococcalphages)丰度以及所携带的毒力因子(virulence factors,VFs)丰度,在ASD与正常儿童口腔中有显著差异,且与ADOS评分和语言交流评分等临床表现的严重程度密切相关,在平行的肠道菌群取样中未观察到这些变化,这表明ASD发病机制与链球菌噬菌体过度富集之间存在一种前所未有的口腔特异性关联,并且与疾病严重程度密切相关。
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公开(公告)号:CN114574484A
公开(公告)日:2022-06-03
申请号:CN202210262743.0
申请日:2022-03-17
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: C12N15/11 , C12Q1/6834 , C12Q1/682
Abstract: 本发明涉及核酸检测技术领域,尤其涉及核酸检测试剂及其应用。通过与微球连接的DNA链之间发生的趾托介导的链置换(TMSD)反应,使微球形成凝集块,至肉眼可见,实现无需设备的现场结果判读和检测,且显著降低成本。该方法中联合使用检测靶标的捕获、催化探针簇放大,以及多级TMSD反应,和微球凝集反应,实现样品信号106‑8倍放大以及结果的肉眼直接判读。本发明所开发的传感系统具有高灵敏度和高特异性,由于该方法不需要复杂的操作或昂贵的设备,无需生物酶参与,无需扩增待测靶标,成本低廉,是一种在检测条件受限的现场条件下的简单有效的、高灵敏、高特异性的定性及半定量检测手段,具有广泛的用途。
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公开(公告)号:CN112980790B
公开(公告)日:2021-11-09
申请号:CN202110238919.4
申请日:2021-03-04
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: C12N5/0789 , C12N5/078 , C12Q1/02
Abstract: 本发明公开了一种氧化磷酸化通路缺陷的DBA细胞模型及其构建方法,属于细胞模型构造技术领域。该构建方法包括在红系诱导分化体系中抑制线粒体氧化磷酸化通路的步骤。具体包括以下步骤:对HPCs进行扩增培养;对步骤(1)所得细胞向红系方向进行定向诱导分化,在分化体系中加入氧化磷酸化通路抑制剂,连续培养,即获得所述氧化磷酸化通路缺陷的DBA细胞模型。本发明所建立的DBA细胞模型可用于进一步挖掘DBA的其他遗传学异常。该模型不需要实验动物参与,成本低、操作简便、建模周期短、可重复性高,可以简单快速开展相关实验研究,以及分析药物的治疗贫血功效,有利于贫血药物的研发。
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公开(公告)号:CN113421648A
公开(公告)日:2021-09-21
申请号:CN202110686960.8
申请日:2021-06-21
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
Abstract: 本发明提供了一种预测射血分数保留型心衰风险的模型,所述的模型采集的信息包括以下标志物组合:患者年龄;是否服用利尿剂类药物;BMI;尿白蛋白;血清肌酐;25个甲基化位点的beta值。通过端到端机器学习模型结合多组学数据交互,对所有患者进行临床评估以识别风险,通过控制危险因素、治疗无症状的左心室收缩功能异常等延缓或预防射血分数保留型心衰的发生。本发明提供的模型有很好的临床应用前景。
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公开(公告)号:CN112626245A
公开(公告)日:2021-04-09
申请号:CN202011623704.6
申请日:2020-12-31
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
Abstract: 本发明属于基因检测技术领域,具体涉及一组用于检测丹毒丝菌属相关菌种的引物组合、试剂盒及检测方法。所述的引物组合包括以下核苷酸序列:检测Erysipelothrix rhusiopathiae strFujisawa(firmicutes)的引物对由SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的两条核苷酸序列组成;检测Erysipelothrix rhusiopathiae strNCTC8163的引物对由SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的两条核苷酸序列组成。本发明提供的引物组合能准确检测出上述两种丹毒丝菌株,所述检测方法具有特异性强、准确性好、操作简便、成本低的优点。
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公开(公告)号:CN112501267A
公开(公告)日:2021-03-16
申请号:CN202011289612.9
申请日:2020-11-17
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 一种RNA外切酶‑纳米孔复合体及其制备方法和应用。该应用为RNA的测序方法,包括以下步骤:采用RNA外切酶‑纳米孔复合体,先利用RNA外切酶将测序样品从一端开始,依次切下单个核苷酸并通过纳米孔,再利用核苷酸通过纳米孔的特征,进行基础核苷酸和修饰核苷酸判定;如判定结果为基础核苷酸,则记录其AUCG的种类及顺序;如判定结果为修饰核苷酸,则记录其位置,并通过其他谱学特征检测其化学修饰的种类;通过上述过程,得到测序样品的核苷酸及其化学修饰的序列信息,实现RNA序列的直读。RNA外切酶‑纳米孔复合体包括:纳米孔结构;固定在纳米孔结构内的RNA外切酶。该RNA外切酶‑纳米孔复合体能够用于RNA直测,测序速度快且能够保障各种修饰核苷酸都能够被测定。
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公开(公告)号:CN111663009A
公开(公告)日:2020-09-15
申请号:CN202010733451.1
申请日:2020-07-27
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
Abstract: 本发明公开了病毒适应人类宿主的突变位点的预测方法及其应用。具体涉及与病毒适应人体宿主的适应性突变及其作为药物靶标和生物标志物的应用。本发明首次发现动物宿主冠状病毒存在被人肺组织miRNA攻击的靶点,人冠状病毒通过适应性突变丢失这些基因组上的靶点而获得在人类宿主中传播的能力。本发明提供的冠状病毒适应性突变的位点可以用于治疗或预防冠状病毒感染的药物设计靶标,以及检查冠状病毒宿主范围的生物标志物。同时,本发明提供的预测病毒基因组上受宿主miRNA攻击靶点的算法可以用于预测各种病毒的RNAi敏感靶点,开发治疗和预防相应的病毒感染的药物设计靶标以及宿主范围检查生物标志物。
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公开(公告)号:CN111378757A
公开(公告)日:2020-07-07
申请号:CN202010391223.0
申请日:2020-05-11
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: C12Q1/6886 , G16B20/00 , G16H50/20
Abstract: 本发明提供了一种新的可应用于肝癌检测场景的甲基化检测和分析方法,不仅能在常规测序条件下获得优异的分类性能,而且在低覆盖度的测序条件下,也具有非常良好的表现,克服了现有技术中关于cfDNA进行DNA甲基化分析需要深度测序的偏见,极大地降低了测序成本,扩大了甲基化测序技术的适用范围,可为肝病早筛、肝病诊断、肝病监测、肝病患者分型、肝癌治疗或手术干预有效性评估等临床应用提供基础数据。
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公开(公告)号:CN222383870U
公开(公告)日:2025-01-24
申请号:CN202420875825.7
申请日:2024-04-25
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
Inventor: 隋静茹
IPC: A61M1/02
Abstract: 本实用新型公开了一种血液病输血防凝设备,涉及医疗器械领域,包括:外壳;电机,其固定设于外壳内壁靠近下方位置;转动轮,其与电机的转轴固定相连,转动轮绕中心环设有多个长臂;振动底座,其形状为倒锥形结构,振动底座底部活动适配于转动轮的两个长臂之间的空间内;振动外壳,其固定设于振动底座顶部,振动外壳与外壳之间活动连接;振动外壳内用于放置血袋。本实用新型能够对血袋中的血液持续均匀地晃动防止血液凝集。
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