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公开(公告)号：CN112501267B
公开(公告)日：2022-08-26
申请号：CN202011289612.9
申请日：2020-11-17
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 一种RNA外切酶‑纳米孔复合体及其制备方法和应用。该应用为RNA的测序方法，包括以下步骤：采用RNA外切酶‑纳米孔复合体，先利用RNA外切酶将测序样品从一端开始，依次切下单个核苷酸并通过纳米孔，再利用核苷酸通过纳米孔的特征，进行基础核苷酸和修饰核苷酸判定；如判定结果为基础核苷酸，则记录其AUCG的种类及顺序；如判定结果为修饰核苷酸，则记录其位置，并通过其他谱学特征检测其化学修饰的种类；通过上述过程，得到测序样品的核苷酸及其化学修饰的序列信息，实现RNA序列的直读。RNA外切酶‑纳米孔复合体包括：纳米孔结构；固定在纳米孔结构内的RNA外切酶。该RNA外切酶‑纳米孔复合体能够用于RNA直测，测序速度快且能够保障各种修饰核苷酸都能够被测定。
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公开(公告)号：CN114672484A
公开(公告)日：2022-06-28
申请号：CN202210262671.X
申请日：2022-03-17
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: C12N15/11 , C12Q1/682 , C12Q1/6834
Abstract: 本发明涉及核酸分子检测技术领域，尤其涉及探针组合及其应用。本发明通过与微球连接的核酸链之间发生的趾托介导的链置换(TMSD，Toehold‑mediated strand displacement)反应，使微球形成凝集块，至肉眼可见。该方法不需要复杂的操作或昂贵的设备，无需生物酶参与，无需扩增待测靶标，能够作为分子检测试剂提供快速、现场的定性及半定量检测。实验表明，本发明设计的探针组合，在对样品进行检测的过程中，能够准确识别含有靶标和不含有靶标的样品，灵敏度可达到100fM。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN116676394A
公开(公告)日：2023-09-01
申请号：CN202310827357.6
申请日：2023-07-06
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11 , A61K45/00 , A61P35/00
Abstract: 本发明涉及生物检测领域，尤其涉及SNP rs62065444位点作为靶点在制备检测和/或治疗卵巢癌的产品中的应用。本发明在人高级别浆液性卵巢癌细胞中转染lncRNA CRHR1‑IT1，并上调其表达，观察不同转染浓度处理的细胞的生长和凋亡情况，并对各组细胞状态进行实时荧光监测和RNA‑Seq转录组测序，探究随lncRNA CRHR1‑IT1表达水平变化而显著改变的差异基因及其功能，构建共表达网络，挖掘lncRNA CRHR1‑IT1所影响的蛋白编码基因和调控网路，从而解释HGSOC风险位点通过调控lncRNA CRHR1‑IT1的表达水平而影响的中间的生物学过程和可能的分子机制。
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公开(公告)号：CN114807342A
公开(公告)日：2022-07-29
申请号：CN202210281910.6
申请日：2022-03-22
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/689 , C12Q1/6888 , G01N33/68 , C12N15/11 , C12R1/46 , C12R1/92
Abstract: 本发明提供了标志物及其检测试剂在制备筛查和/或辅助诊断ASD的试剂盒中的应用。本发明研究发现口腔链球菌Streptococcaceae(科)丰度、口腔链球菌噬菌体(Streptococcalphages)丰度以及所携带的毒力因子(virulence factors，VFs)丰度，在ASD与正常儿童口腔中有显著差异，且与ADOS评分和语言交流评分等临床表现的严重程度密切相关，在平行的肠道菌群取样中未观察到这些变化，这表明ASD发病机制与链球菌噬菌体过度富集之间存在一种前所未有的口腔特异性关联，并且与疾病严重程度密切相关。
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公开(公告)号：CN114574484A
公开(公告)日：2022-06-03
申请号：CN202210262743.0
申请日：2022-03-17
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: C12N15/11 , C12Q1/6834 , C12Q1/682
Abstract: 本发明涉及核酸检测技术领域，尤其涉及核酸检测试剂及其应用。通过与微球连接的DNA链之间发生的趾托介导的链置换(TMSD)反应，使微球形成凝集块，至肉眼可见，实现无需设备的现场结果判读和检测，且显著降低成本。该方法中联合使用检测靶标的捕获、催化探针簇放大，以及多级TMSD反应，和微球凝集反应，实现样品信号106‑8倍放大以及结果的肉眼直接判读。本发明所开发的传感系统具有高灵敏度和高特异性，由于该方法不需要复杂的操作或昂贵的设备，无需生物酶参与，无需扩增待测靶标，成本低廉，是一种在检测条件受限的现场条件下的简单有效的、高灵敏、高特异性的定性及半定量检测手段，具有广泛的用途。
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公开(公告)号：CN112501267A
公开(公告)日：2021-03-16
申请号：CN202011289612.9
申请日：2020-11-17
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 一种RNA外切酶‑纳米孔复合体及其制备方法和应用。该应用为RNA的测序方法，包括以下步骤：采用RNA外切酶‑纳米孔复合体，先利用RNA外切酶将测序样品从一端开始，依次切下单个核苷酸并通过纳米孔，再利用核苷酸通过纳米孔的特征，进行基础核苷酸和修饰核苷酸判定；如判定结果为基础核苷酸，则记录其AUCG的种类及顺序；如判定结果为修饰核苷酸，则记录其位置，并通过其他谱学特征检测其化学修饰的种类；通过上述过程，得到测序样品的核苷酸及其化学修饰的序列信息，实现RNA序列的直读。RNA外切酶‑纳米孔复合体包括：纳米孔结构；固定在纳米孔结构内的RNA外切酶。该RNA外切酶‑纳米孔复合体能够用于RNA直测，测序速度快且能够保障各种修饰核苷酸都能够被测定。
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公开(公告)号：CN111663009A
公开(公告)日：2020-09-15
申请号：CN202010733451.1
申请日：2020-07-27
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
Abstract: 本发明公开了病毒适应人类宿主的突变位点的预测方法及其应用。具体涉及与病毒适应人体宿主的适应性突变及其作为药物靶标和生物标志物的应用。本发明首次发现动物宿主冠状病毒存在被人肺组织miRNA攻击的靶点，人冠状病毒通过适应性突变丢失这些基因组上的靶点而获得在人类宿主中传播的能力。本发明提供的冠状病毒适应性突变的位点可以用于治疗或预防冠状病毒感染的药物设计靶标，以及检查冠状病毒宿主范围的生物标志物。同时，本发明提供的预测病毒基因组上受宿主miRNA攻击靶点的算法可以用于预测各种病毒的RNAi敏感靶点，开发治疗和预防相应的病毒感染的药物设计靶标以及宿主范围检查生物标志物。
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