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公开(公告)号:CN112735530B
公开(公告)日:2025-03-11
申请号:CN202110090838.4
申请日:2021-01-22
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: G16B30/10 , G16B25/10 , G06F16/36 , G06F16/906
Abstract: 本发明提供了一种基于菌群结构进行样品溯源的方法,属于微生物分析技术领域。本发明通过16S序列扩增、宏基因组以及大数据获取大量样本的菌群结构,通过判断待测样品的香农指数以及菌群结构的相似性,从而确定某一确定来源的菌群图谱,并依据菌群图谱进行样品来源的溯源。本发明所述的样品溯源的方法高效、准确、快速,且操作简便。
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公开(公告)号:CN119380809A
公开(公告)日:2025-01-28
申请号:CN202411406825.3
申请日:2024-10-10
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
Abstract: 本申请提供一种单体型网络的构建方法、装置、电子设备及介质,涉及生物信息学领域,该方法包括:将各新增基因组序列和/或各历史基因组序列进行组合,确定多个当前单体型;根据目标历史单体型和目标历史单体型的历史父辈祖先对应的历史单体型分别在历史单体型数组中的位置,确定当前单体型的当前单体型指数和祖先指数;根据当前单体型指数、祖先指数和各当前突变集合,确定该当前单体型的目标父辈祖先对应的目标当前单体型;基于各当前单体型、各目标当前单体型和边信息,确定基于最小树形图的目标单体型网络。本申请通过先前已推测出的历史单体型之间的演化关系,对现有单体型网络进行更新,在保证运算精度的同时,提高单体型网络的运算效率。
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公开(公告)号:CN119375487A
公开(公告)日:2025-01-28
申请号:CN202411018359.1
申请日:2024-07-26
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心) , 中国科学院动物研究所 , 衢州市人民医院(衢州中心医院)
Abstract: 本发明提供了衰老相关蛋白用于评估受试者的生物学年龄、受试者的衰老程度、衰老干预手段效果、受试者患衰老相关疾病的风险和/或衰老相关疾病的治疗效果、年龄相关凝血系统的衰老程度,并涉及延缓或逆转衰老的产品、治疗衰老相关疾病、治疗衰老相关凝血系统疾病的产品的制备。此外,本发明还涉及衰老相关蛋白作为延缓或逆转衰老、预防和/或治疗衰老相关疾病的的靶点,用于筛选延缓或逆转衰老、预防和/或治疗衰老相关疾病的药物。
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公开(公告)号:CN119339933A
公开(公告)日:2025-01-21
申请号:CN202310878549.X
申请日:2023-07-17
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心) , 中国科学院动物研究所 , 衢州市人民医院
IPC: G16H50/30 , A61B5/00 , G16H10/40 , G16B25/00 , G16B40/00 , G06F18/23213 , G06N20/00 , G06N5/02 , C12Q1/6869 , G01N30/02 , G01N30/72
Abstract: 本发明涉及一种基于多维数据的年龄估算方法,具体涉及一种建立数据集的方法、年龄估算模型的训练方法、年龄估算方法、年龄估算模型或装置、电子设备、非易失性计算机可读存储介质及其用途。本发明能够更加准确估算亚洲人群,尤其是东亚或东南亚人群年龄,可用于衰老相关信息的评估。
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公开(公告)号:CN119324054A
公开(公告)日:2025-01-17
申请号:CN202310878759.9
申请日:2023-07-17
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心) , 中国科学院动物研究所 , 衢州市人民医院
Abstract: 本发明涉及一种基于表型数据的年龄估算方法,具体涉及一种建立数据集的方法、年龄估算模型的训练方法、年龄估算方法、年龄估算模型或装置、电子设备、非易失性计算机可读存储介质及其用途。本发明能够更加准确估算亚洲人群,尤其是东亚或东南亚人群年龄,可用于衰老相关信息的评估。
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公开(公告)号:CN119324052A
公开(公告)日:2025-01-17
申请号:CN202310876513.8
申请日:2023-07-17
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心) , 中国科学院动物研究所 , 衢州市人民医院
Abstract: 本发明属于生物医学领域,具体涉及一种基于蛋白组数据的年龄估算方法,更具体地,本发明涉及一种建立数据集的方法、年龄估算模型的训练方法、年龄估算方法、年龄估算模型或装置、电子设备、非易失性计算机可读存储介质,以及其用于评估受试者的生物学年龄、受试者的衰老程度或速率、受试者特定组织/器官衰老程度或速率、衰老干预手段效果、受试者患衰老相关疾病的风险和/或衰老相关疾病的治疗效果。
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公开(公告)号:CN119236053A
公开(公告)日:2025-01-03
申请号:CN202310851879.X
申请日:2023-07-12
Applicant: 中国科学院动物研究所 , 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: A61K38/17 , A61K45/00 , A61K31/7105 , A61P39/06 , C12N5/10 , C12N15/113 , C12N9/22
Abstract: 本发明公开了MAVS作为线粒体稳定剂在延缓衰老中的应用。实验证明,MAVS蛋白的缺失加速了人间充质干细胞的衰老;MAVS可以与OPA1互作来维持线粒体功能,从而延缓人间充质干细胞的衰老。本发明阐述了MAVS‑OPA1‑线粒体轴线在调控人间充质干细胞衰老过程中的重要作用。本发明具有重要的应用价值。
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公开(公告)号:CN119120647A
公开(公告)日:2024-12-13
申请号:CN202310689562.0
申请日:2023-06-12
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6804 , C40B50/06 , C40B40/08 , C40B40/06
Abstract: 本申请具体涉及一种单细胞内m7G修饰的分析方法,还涉及一种获得带有修饰的RNA的方法,以及一种用于分析RNA带有的修饰信息的文库。本申请还涉及一种同时分析转录组RNA和其中包含的带有修饰的RNA的方法。
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公开(公告)号:CN111833963B
公开(公告)日:2024-06-11
申请号:CN201910374094.1
申请日:2019-05-07
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心) , 北京大学第一医院(北京大学第一临床医学院)
Abstract: 本发明属于基因组学和生物信息学领域,涉及一种cfDNA分类方法、装置和用途。具体地,本发明涉及一种cfDNA分类方法,包括:计算目标样本中的cfDNA的拷贝数变异数据;计算目标cfDNA拷贝数变异数据与各分类标签的cfDNA拷贝数变异数据的相似度;根据所述相似度,利用分类器模型确定所述目标cfDNA所属的分类。本发明能够实现一次性完成多达3种泌尿生殖系统肿瘤的诊断,具有较高的敏感性和特异性。特别是在尿路上皮癌的诊断和动态监测的方面的敏感性和特异性高于了目前临床使用的检测方法。
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公开(公告)号:CN111833965B
公开(公告)日:2024-06-04
申请号:CN201911088433.6
申请日:2019-11-08
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心) , 北京大学第一医院(北京大学第一临床医学院)
IPC: G16B30/00 , C12Q1/6886
Abstract: 本发明属于基因组学和生物信息学领域,涉及一种尿沉渣基因组DNA的分类方法、装置和用途。具体地,本发明涉及一种DNA分类方法,包括:计算目标样本的DNA甲基化单倍型区域的MHL值和/或DNA的拷贝数变异数据;计算目标样本DNA的DNA甲基化单倍型区域的MHL值与各分类标签的DNA甲基化单倍型区域的MHL值的相似度,和/或目标样本DNA的拷贝数变异数据与各分类标签的DNA拷贝数变异数据的相似度;根据所述相似度,利用分类器模型确定所述目标样本DNA所属的分类。本发明提供了一种新的泌尿生殖系统肿瘤的检测手段,具有良好的特异性和敏感性。
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