公开(公告)号：CN112626245A

公开(公告)日：2021-04-09

申请号：CN202011623704.6

申请日：2020-12-31

Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)

Inventor： 吴森 ,  王绪敏 ,  方向东 ,  单广乐

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/686 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于基因检测技术领域，具体涉及一组用于检测丹毒丝菌属相关菌种的引物组合、试剂盒及检测方法。所述的引物组合包括以下核苷酸序列：检测Erysipelothrix rhusiopathiae strFujisawa(firmicutes)的引物对由SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的两条核苷酸序列组成；检测Erysipelothrix rhusiopathiae strNCTC8163的引物对由SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的两条核苷酸序列组成。本发明提供的引物组合能准确检测出上述两种丹毒丝菌株，所述检测方法具有特异性强、准确性好、操作简便、成本低的优点。

公开(公告)号：CN112735530A

公开(公告)日：2021-04-30

申请号：CN202110090838.4

申请日：2021-01-22

Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)

Inventor： 吴森 ,  王绪敏 ,  方向东 ,  单广乐

IPC: G16B30/10 ,  G16B25/10 ,  G06F16/36 ,  G06F16/906

Abstract: 本发明提供了一种基于菌群结构进行样品溯源的方法，属于微生物分析技术领域。本发明通过16S序列扩增、宏基因组以及大数据获取大量样本的菌群结构，通过判断待测样品的香农指数以及菌群结构的相似性，从而确定某一确定来源的菌群图谱，并依据菌群图谱进行样品来源的溯源。本发明所述的样品溯源的方法高效、准确、快速，且操作简便。

公开(公告)号：CN112735530B

公开(公告)日：2025-03-11

申请号：CN202110090838.4

申请日：2021-01-22

Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)

Inventor： 吴森 ,  王绪敏 ,  方向东 ,  单广乐

IPC: G16B30/10 ,  G16B25/10 ,  G06F16/36 ,  G06F16/906

Abstract: 本发明提供了一种基于菌群结构进行样品溯源的方法，属于微生物分析技术领域。本发明通过16S序列扩增、宏基因组以及大数据获取大量样本的菌群结构，通过判断待测样品的香农指数以及菌群结构的相似性，从而确定某一确定来源的菌群图谱，并依据菌群图谱进行样品来源的溯源。本发明所述的样品溯源的方法高效、准确、快速，且操作简便。

公开(公告)号：CN112646910A

公开(公告)日：2021-04-13

申请号：CN202110090852.4

申请日：2021-01-22

Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)

Inventor： 吴森 ,  王绪敏 ,  方向东 ,  单广乐

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/10 ,  C12N15/11 ,  C12R1/01

Abstract: 本发明属于基因检测技术领域，具体涉及一组用于鉴定志贺菌属相关菌种的引物、试剂盒及检测方法。所述的引物组合包括以下核苷酸序列：检测Shigella boydiistr 80的引物对由SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的两条核苷酸序列组成；检测Shigella boydiistrATCC9210的引物对由SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的两条核苷酸序列组成；所述的引物组合中SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:4的浓度比为1:1:1:1。本发明提供的引物组合能准确检测出上述两种志贺菌株，所述检测方法具有特异性强、准确性好、操作简便、成本低的优点。