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公开(公告)号：CN114974412A
公开(公告)日：2022-08-30
申请号：CN202210794329.4
申请日：2022-07-05
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司 , 上海至本医学检验所有限公司
Abstract: 本发明涉及一种生成目标对象的肿瘤检测报告数据的方法、设备和介质。该方法包括：获取关于多个目标对象的临床信息和关于多个目标对象的待测样本的测序下机数据，用以生成比对结果数据；基于比对结果数据，生成关于待测样本的多种变异的阳性结果信息；基于多种变异的阳性结果信息和所获取的对照关系数据，生成关于待测样本的变异结果的临床注释信息表，临床注释信息表包括多个字段；以及基于所生成的临床注释信息表、检测报告模板和关于检测报告模板的操作信息，生成目标对象的肿瘤检测报告数据，检测报告模板至少包括多个注释标识和对应变量值。本发明能够灵活兼容不同测序仪器对输出数据的固有差异化设置而实现肿瘤检测数据的按需生成。
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公开(公告)号：CN110706749B
公开(公告)日：2022-06-10
申请号：CN201910852801.3
申请日：2019-09-10
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司
Abstract: 本发明提供了一种基于组织器官分化层次关系的癌症类型预测系统和方法。该方法包括：获取多个癌症类型中的每种癌症的转录组基因表达量数据作为训练集；将不同的癌症类型按照组织器官分化关系分成第一等级和第二等级；基于组织器官分化层次关系进行特征选取，即对于每个等级的每种组织器官类型或癌症类型，选取该种癌症类型和训练集中其它所有癌症类型相比较为差异表达基因并且是高表达的基因，得到所选取的基因的每个的表达量的值作为特征值；对上述特征值进行归一化处理；将上述归一化处理的特征值输入机器学习算法以构建双层机器学习分类模型；以及对将处理后的待检测样本数据输入到双层机器学习分类模型中进行预测。
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公开(公告)号：CN110853705B
公开(公告)日：2022-04-22
申请号：CN201911088666.6
申请日：2019-11-08
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司
IPC: G16B20/20
Abstract: 本发明提供了一种能提高对肿瘤细胞含量评估的准确性的肿瘤细胞含量评估方法、装置、系统以及计算机可读介质，其中的肿瘤细胞含量评估方法包括以下步骤：逐一获取满足预定突变条件的突变位点的平均样本突变频率和对照突变频率，并计算得到与该突变位点对应的单个肿瘤细胞含量；一旦得到所有满足预定突变条件的突变位点对应的所有单个肿瘤细胞含量，就获取该所有单个肿瘤细胞含量并计算得到检测样本中的肿瘤细胞含量；根据预定评估规则对计算得到的检测样本中的肿瘤细胞含量评估得到评估后检测样本中的肿瘤细胞含量。
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公开(公告)号：CN112768089A
公开(公告)日：2021-05-07
申请号：CN202110380471.X
申请日：2021-04-09
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司 , 上海至本医学检验所有限公司
Abstract: 本公开涉及一种用于预测药物敏感状态的方法、计算设备和存储介质。该方法包括：获取待测样本的基因变异信息和有关药物的药物信息；获取关于细胞与对应药物的细胞活性试验而确定的药物敏感状态数据；针对基因变异信息、药物信息进行预处理，以便生成多种基因变异表征数据和多种药物表征数据，以用于组合成多组输入样本集；基于第一神经网络模型生成基因变异特征；基于第二神经网络模型生成药物特征；基于第三神经网络模型，提取经融合的基因变异特征和药物特征的特征，以用于预测待测样本针对对应药物的药物敏感状态。本公开能够准确预测药物敏感性并具有较好的泛用性。
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公开(公告)号：CN111933214A
公开(公告)日：2020-11-13
申请号：CN202011028770.9
申请日：2020-09-27
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司
Abstract: 本公开涉及一种用于检测RNA水平的体细胞基因变异的方法、计算设备和计算机存储介质。该方法包括：生成关于待测组织样本的RNA对比结果数据，以用于确定候选变异；生成所述RNA对比结果数据中和待测血液样本的DNA比对结果数据中的支持所述候选变异的读长的统计信息；确定候选变异所在位置的参考基因组序列的重复序列特征，以便确定预定过滤阈值；基于所述reads的统计信息和所述预定过滤阈值，获得阳性候选变异；以及将包含所述阳性候选变异的测序序列与人类参考基因组和预定RNA变异数据集进行比对，以便确定体细胞变异结果数据。本公开能够准确并高效率地检测RNA水平体细胞基因变异。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN111534585A
公开(公告)日：2020-08-14
申请号：CN202010205764.X
申请日：2020-03-23
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明属于免疫疗法预后的技术领域，尤其涉及一种非小细胞肺癌(NSCLC)患者免疫疗法预后的方法。本发明以基因NFE2L2和/或KEAP1作为生物标志物，检测所述生物标志物的是否发生突变，从而对非小细胞肺癌患者对免疫疗法，尤其是采用免疫检查点抑制剂(ICIs)的免疫疗法的敏感性进行预后。此外，本发明还提供了包括生物标志物检测试剂的试剂盒及其应用。采用本发明的方法或试剂盒可以准确预测NFE2L2和/或KEAP1突变的NSCLC患者中对ICIs免疫治疗敏感的群体，从而提高该类患者的免疫治疗的有效性临床获益。
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公开(公告)号：CN111402951A
公开(公告)日：2020-07-10
申请号：CN202010185580.1
申请日：2020-03-17
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司
Abstract: 本申请涉及一种拷贝数变异预测方法、装置、计算机设备和存储介质。所述方法包括：接收输入的待测样本及对照样本对应的基因序列文件；对基因序列文件进行分析得到单核苷酸多态性位点；根据预设输入参数计算逻辑，计算所得到的单核苷酸多态性位点对应的模型输入参数；将模型输入参数输入至位点拷贝数变异识别模型中，得到每个单核苷酸多态性位点对应的拷贝数状态及分割点位置；将每个单核苷酸多态性位点对应的拷贝数状态及分割点位置输入至染色体拷贝数变异识别模型中，得到待测样本对应的拷贝数变异状态及对应每一拷贝数变异状态的百分比，染色体拷贝数变异识别模型是根据长短期记忆网络训练模型得到的。采用本方法能够提高预测准确性。
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公开(公告)号：CN110853705A
公开(公告)日：2020-02-28
申请号：CN201911088666.6
申请日：2019-11-08
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司
IPC: G16B20/20
Abstract: 本发明提供了一种能提高对肿瘤细胞含量评估的准确性的肿瘤细胞含量评估方法、装置、系统以及计算机可读介质，其中的肿瘤细胞含量评估方法包括以下步骤：逐一获取满足预定突变条件的突变位点的平均样本突变频率和对照突变频率，并计算得到与该突变位点对应的单个肿瘤细胞含量；一旦得到所有满足预定突变条件的突变位点对应的所有单个肿瘤细胞含量，就获取该所有单个肿瘤细胞含量并计算得到检测样本中的肿瘤细胞含量；根据预定评估规则对计算得到的检测样本中的肿瘤细胞含量评估得到评估后检测样本中的肿瘤细胞含量。
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公开(公告)号：CN110689921B
公开(公告)日：2020-02-28
申请号：CN201911255067.9
申请日：2019-12-10
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司
Abstract: 本发明涉及一种能够提高结果准确性的微卫星不稳定性检测装置、计算机设备及计算机存储介质。该微卫星不稳定性检测装置根据已有的敏感MS位点数据，从筛选出的可信的MS位点中筛选出与所述已有的敏感MS位点数据中一致的敏感MS位点；对筛选出所述敏感MS位点进行过滤，筛选出不稳定MS位点；对肿瘤样本的所述不稳定MS位点进行打分分析。该微卫星不稳定性检测方法充分考虑传统技术存在的问题，根据前期建立的敏感MS位点数据为基础，利用较低的测序数据量，即可得到更为准确的结果，由于数据量少，整个处理流程更快，效率更高，并且可以有效降低假阳性和假阴性结果的出现。
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公开(公告)号：CN119601162A
公开(公告)日：2025-03-11
申请号：CN202411549078.9
申请日：2024-10-31
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司 , 上海至本医学检验所有限公司
Abstract: 本发明涉及一种用于预测免疫治疗获益率的方法、计算设备和计算机存储介质。该方法包括：基于所获取临床数据、血常规信息、与肿瘤相关基因突变数据，生成多种输入特征子集和预测指标数据集；基于多种输入特征子集中的每种输入特征子集和预测指标数据集，分别训练多个预测模型，以便针对每种输入特征子集确定匹配的候选预测模型；基于用户的临床数据、免疫治疗前的血常规信息、测序数据和用户的输入操作，在候选预测模型中选择目标预测模型，并且构建用户输入特征；以及基于所构建的用户输入特征，经由目标预测模型，生成关于用户的免疫治疗获益率的预测结果。本发明能够针对不同癌种，进行客观和准确预测免疫治疗获益率。
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