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公开(公告)号:CN107164566B
公开(公告)日:2020-09-29
申请号:CN201710590225.0
申请日:2017-07-19
Applicant: 上海市农业科学院
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12N15/11
Abstract: 一种检测百合斑驳病毒的LAMP引物组、试剂盒及检测方法,根据Genbank中查找到LMoV的CP序列进行引物设计,该LAMP引物组包括内引物FIP和BIP,外引物F3和B3,该LAMP引物组特异性强,与常见侵染百合的7种病毒无交叉,灵敏度高,可在模板纯度只有101拷贝数下进行扩增,建立的百合斑驳病毒的LAMP诊断方法,具有反应条件简单、操作简便快速、结果判定方便、准确等优点,可用于环介导逆转录等温扩增,直接检验百合样品总RNA,减少实验假阴性或假阳性实验结果发生,在保证实验结果准确性的同时,更加经济节约,高效,非常易于临床推广。
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公开(公告)号:CN105296639B
公开(公告)日:2018-10-02
申请号:CN201510785854.X
申请日:2015-11-16
Applicant: 上海市农业科学院
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一个猪6号染色体上用于溯源的SNP分子标记及其应用,所述的SNP分子标记是通过NCBI数据库序列比对获得的,该SNP分子标记由HinfI限制性内切酶识别,共570bp,第403位碱基处有一个碱基替换,为403T或403G,其序列如SEQ ID NO.1所示。通过在包括10个猪品种或品系的试验群体中分析SNP分子标记在试验群体中等位基因的分布情况,发现本发明的SNP分子标记在不同的品种或品系中的等位基因频率接近,多态性丰富,品种或品系间等位基因频率分布差异小,并且杂合度都大于0.3,该SNP标记可用作猪肉产品DNA溯源。
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公开(公告)号:CN108315493A
公开(公告)日:2018-07-24
申请号:CN201810365523.4
申请日:2018-04-23
Applicant: 上海市农业科学院
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12N15/11
Abstract: 一种用于检测大麦黄花叶病毒的LAMP引物组及检测方法,根据Genbank中查找到的BaYMV基因的CP序列进行引物设计,获得LAMP引物组,其包括外引物F3和B3,内引物FIP和BIP,该LAMP引物组特异性强,减少了非靶标序列的影响,可以识别目的序列上6个不同的区域,具有高度的选择性,灵敏度高,检测方法具有反应条件简单、操作简便快速、结果判定方便、准确等优点,可用于环介导逆转录等温扩增,通过添加显色剂用肉眼来直接观察检测结果,在保证实验结果准确性的同时,更加经济节约,高效,易于推广。
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公开(公告)号:CN107723346A
公开(公告)日:2018-02-23
申请号:CN201711210493.1
申请日:2017-11-28
Applicant: 上海市农业科学院
IPC: C12Q1/686 , C12Q1/6895 , C12N15/11
CPC classification number: C12Q1/686 , C12Q1/6895 , C12Q2537/143 , C12Q2563/159 , C12Q2565/125
Abstract: 一种用于转基因玉米多重检测的微滴PCR偶联DGGE分析方法,首先,针对待测样品分别设计PCR特异性引物对,进行微滴PCR扩增,扩增产物经纯化后进行DGGE电泳,并进行SYBRGreen染色,在紫外光下显影观察,来检测转基因玉米基因组的多重DNA分子。该方法可以实现高通量分析多个DNA目标核酸分子,且灵敏度高,内标基因的稳定性也很好。因此,本发明利用微滴PCR偶联DGGE技术实现了生物基因定性、高通量检测。
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公开(公告)号:CN106011314A
公开(公告)日:2016-10-12
申请号:CN201610613054.4
申请日:2016-07-29
Applicant: 上海佳牧生物制品有限公司 , 上海市农业科学院
CPC classification number: C12Q1/701 , C12Q1/6844 , C12Q2531/119 , C12Q2545/113 , C12Q2563/107
Abstract: 一种用于检测猪细小病毒的LAMP引物组、试剂盒及检测方法,该LAMP引物组序列分别为引物F3:5’‑ACGGAGGTAAAATTGGACA‑3’;引物B3:5’‑TCCCTTTAGCTTTTTTTTTAGC‑3’;FIP:5’‑GAGATGTAGTTGGTGAGTCTGTTTTTTTTTCTTCAGAGCAAAGCGTG‑3’;引物BIP:5’‑CAACCAGAGGTAAGAAGATCGCTTTTAAAAATATGTCTTGGAGCAGGT‑3’。本发明还提供了含有上述引物组的检测试剂盒及检测方法,通过向LAMP反应产物中加入荧光染料后的颜色变化来判断被测样品是否含有PPV,实现了可视化,反应结果易判定,非常易于临床推广。
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公开(公告)号:CN103725795A
公开(公告)日:2014-04-16
申请号:CN201310461343.3
申请日:2013-09-30
Applicant: 上海佳牧生物制品有限公司 , 上海市农业科学院
CPC classification number: C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12Q2531/119
Abstract: 本发明公开了一种猪圆环病毒2型环介导等温扩增(LAMP)检测方法,包括以下步骤:1)首先设计并合成特异性引物;2)从细胞提取病毒DNA模板;3)目的片段的获得:分别配制LAMP和PCR反应体系,按照LAMP和PCR反应程序进行反应得到目的片段;4)定性LAMP和PCR检测。本发明的检测方法简单、快速、灵敏度高、特异性强、重复性好,并且检测的检测极限极低,灵敏度高,可准确定性检测出猪圆环病毒2型,达到预防和控制猪圆环病毒2型流行的作用。
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公开(公告)号:CN101705304B
公开(公告)日:2013-12-04
申请号:CN200910250218.1
申请日:2009-12-08
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 适合转基因康乃馨外源基因检测的内标准基因,本发明依据内标准基因的种内非特异性、种间特异性、单拷贝或低拷贝数三个标准,通过生物信息学分析和分子生物学实验验证,在康乃馨中寻找到了符合上述标准ANS基因作为转基因康乃馨定性、定量PCR检测的内标准基因。定性PCR引物为ANS-F1/ANS-R1,定量PCR引物为ANS-F2/ANS-R2,定量PCR探针为ANS-probe。ANS基因作为转基因康乃馨定性、定量PCR检测及拷贝数分析的内标准基因。
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公开(公告)号:CN101717770B
公开(公告)日:2012-01-04
申请号:CN200910200681.5
申请日:2009-12-24
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明公开一种提取苏云金芽胞杆菌大质粒DNA的方法,包括以下步骤:1)菌体的培养与收集;2)原生体的制备;3)细胞的裂解和质粒的提取;4)质粒的纯化。应用该方法得到的质粒DNA可直接用来限制性内切酶消化、PCR扩增等多种分子生物学实验。本发明操作简便、安全、质量高,可同时适用于多种革兰氏阳性细菌质粒DNA的提取,因此具有广泛的适用性。
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公开(公告)号:CN102268078A
公开(公告)日:2011-12-07
申请号:CN201110208371.5
申请日:2009-04-01
Applicant: 上海市农业科学院
IPC: C07K14/08 , G01N33/576 , A61K39/29 , A61P31/14 , A61P1/16
Abstract: 本发明公开了一种猪戊型肝炎病毒抗原表位及其应用,所述猪戊型肝炎病毒抗原表位序列如SEQ ID No:5所示。通过计算机软件筛选和实验验证得到的猪戊肝病毒的抗原表位,一方面可以将其应用于快速特异猪戊肝诊断试剂盒,用于猪戊肝的快速诊断,特别是研制疫苗免疫抗体和自然隐性感染抗体的鉴别诊断技术用于猪戊肝流行的监控;另一方面也可以设计特异、安全和高效的猪戊肝疫苗用于猪戊肝的预防、控制猪戊肝的流行和阻断戊肝由猪向人传播。
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公开(公告)号:CN101550182B
公开(公告)日:2011-09-14
申请号:CN200910048702.6
申请日:2009-04-01
Applicant: 上海市农业科学院
IPC: C07K14/08 , G01N33/576 , A61K39/12 , A61P31/14
Abstract: 一种猪戊型肝炎病毒抗原表位,如SEQ ID No:1-8所示。通过计算机软件筛选和实验验证得到的猪戊肝病毒的抗原表位,一方面可以将其单独或组合应用于快速特异猪戊肝诊断试剂盒,用于猪戊肝的快速诊断,特别是研制疫苗免疫抗体和自然隐性感染抗体的鉴别诊断技术用于猪戊肝流行的监控;另一方面也可以设计特异、安全和高效的猪戊肝疫苗用于猪戊肝的预防、控制猪戊肝的流行和阻断戊肝由猪向人传播。
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