一种快速检测黄牛FLII基因SNP的RFLP方法及其应用

    公开(公告)号:CN105349673A

    公开(公告)日:2016-02-24

    申请号:CN201510866870.1

    申请日:2015-11-30

    Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛FLII基因SNP的RFLP方法及其应用:分别以黄牛基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛FLII基因内含子22区,用限制性内切酶Sac II消化PCR扩增产物,再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛FLII基因内含子22区单核苷酸多态性,并且该SNP位点与黄牛的生长发育性状显著相关,可作为DNA水平上筛查和检测与黄牛生长性状密切相关的分子遗传标记,并应用于黄牛肉用生长性状的标记辅助选择,以便快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种检测黄牛ACVR1基因单核苷酸多态性的方法及其应用

    公开(公告)号:CN107574234B

    公开(公告)日:2020-05-29

    申请号:CN201711015960.5

    申请日:2017-10-26

    Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛ACVR1基因单核苷酸多态性的方法及其应用。以包含ACVR1基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对1F为引物,PCR扩增黄牛ACVR1基因,其包括在黄牛ACVR1基因第41793位为C或T的碱基多态性;用限制性内切酶消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛ACVR1基因第41793位的单核苷酸多态性;由于该方法是一种在DNA水平上筛查和检测到与黄牛生产性状密切相关的分子遗传标记,因此,可以用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种检测南阳牛MAPK10基因CNV标记的方法及其应用

    公开(公告)号:CN105506111B

    公开(公告)日:2020-02-07

    申请号:CN201511030253.4

    申请日:2015-12-31

    Abstract: 本发明公开了一种检测南阳牛MAPK10基因CNV标记的方法及其应用:以南阳牛的血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR方法分别扩增南阳牛MAPK10基因CNV区域和内参基因BTF3,根据log22‑ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型,鉴定南阳牛MAPK10基因的拷贝数变异。与南阳牛生产数据的关联分析显示,MAPK10不同拷贝数对南阳牛的生长发育有显著影响,其中正常型个体的初生重、18月龄体高和24月龄体重和日增重均显著高于插入型和缺失型个体。本发明在DNA水平上检测与南阳牛生产性状密切相关的CNV标记,可作为中国南阳牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记。

    一种快速检测黄牛FLII基因SNP的RFLP方法及其应用

    公开(公告)号:CN105349673B

    公开(公告)日:2020-01-21

    申请号:CN201510866870.1

    申请日:2015-11-30

    Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛FLII基因SNP的RFLP方法及其应用:分别以黄牛基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛FLII基因内含子22区,用限制性内切酶Sac II消化PCR扩增产物,再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛FLII基因内含子22区单核苷酸多态性,并且该SNP位点与黄牛的生长发育性状显著相关,可作为DNA水平上筛查和检测与黄牛生长性状密切相关的分子遗传标记,并应用于黄牛肉用生长性状的标记辅助选择,以便快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种与秦川牛生长相关的CNV标记的检测方法与应用

    公开(公告)号:CN105349674B

    公开(公告)日:2019-05-17

    申请号:CN201510867756.0

    申请日:2015-11-30

    Abstract: 本发明公开了一种与秦川牛生长相关的CNV标记的检测方法与应用:所述的CNV标记是指牛SHH基因候选区域Chr 4:118264951‑118267170的拷贝数变异,该检测方法是以秦川牛的基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过实时荧光定量PCR分别扩增秦川牛SHH基因CNV区域和内参基因BTF3,根据log22‑ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定秦川牛SHH基因的拷贝数变异。本发明可在DNA水平上检测与秦川牛生产性状密切相关的CNV标记,可作为秦川牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记。

    一种检测黄牛ACVR1基因单核苷酸多态性的方法及其应用

    公开(公告)号:CN107574234A

    公开(公告)日:2018-01-12

    申请号:CN201711015960.5

    申请日:2017-10-26

    Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛ACVR1基因单核苷酸多态性的方法及其应用。以包含ACVR1基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对1F为引物,PCR扩增黄牛ACVR1基因,其包括在黄牛ACVR1基因第41793位为C或T的碱基多态性;用限制性内切酶消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛ACVR1基因第41793位的单核苷酸多态性;由于该方法是一种在DNA水平上筛查和检测到与黄牛生产性状密切相关的分子遗传标记,因此,可以用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种检测秦川牛GBP2基因CNV标记的方法及其应用

    公开(公告)号:CN107119117A

    公开(公告)日:2017-09-01

    申请号:CN201710284523.7

    申请日:2017-04-25

    Abstract: 本发明公开了一种检测秦川牛GBP2基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以秦川牛的血液全基因组DNA为模板,利用两对特异引物GBP2‑CNV1和GBP2‑CNV2分别扩增牛GBP2基因的两个拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增秦川牛BTF3基因作为对照,然后利用2‑ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在秦川牛GBP2基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上,有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。

    一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法及其应用

    公开(公告)号:CN105543352A

    公开(公告)日:2016-05-04

    申请号:CN201511030627.2

    申请日:2015-12-31

    Abstract: 本发明公开了一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法及其应用:基于实时定量PCR,以秦川牛基因组DNA为模板,利用一对特异性PCR引物扩增牛FGF13基因的拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛通用转录因子3基因作为对照,最后利用2-ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立秦川牛FGF13基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单,快速,便于推广应用。

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