三氮烯四色荧光可逆终止核苷酸测序试剂及DNA单分子测序系统与测序方法

    公开(公告)号:CN112390839A

    公开(公告)日:2021-02-23

    申请号:CN202011286386.9

    申请日:2020-11-17

    Abstract: 本发明提供了一种三氮烯四色荧光可逆终止核苷酸测序试剂及DNA单分子测序系统及测序方法,所述三氮烯四色荧光可逆终止核苷酸测序试剂包括以下基于三氮烯连接单元的不同荧光素标记四种不同碱基的可逆终止核苷酸:本发明在包含所述三氮烯四色荧光可逆终止核苷酸测序试剂的DNA单分子集成测序系统中,通过前一次DNA链延伸产物的荧光信号图像作为下一次延伸产物的定位荧光,无需额外的定位荧光,并且三氮烯荧光标记核苷酸在断裂反应后,在DNA链上无残基保留,理论上读长无限制。

    Cy系列荧光素的合成方法以及在DNA测序中的应用

    公开(公告)号:CN109320445B

    公开(公告)日:2020-05-08

    申请号:CN201811149807.6

    申请日:2018-09-29

    Inventor: 沈玉梅 汤博为

    Abstract: 本发明公开了一种Cy系列荧光素的合成方法以及在DNA测序中的应用,所述方法包括:A、将反应物与反应物YCH2(CH2)4COOH或者YR回流,得到反应中间体和B、将步骤A所得与反应,生成然后直接加入一锅法生成目标产物;所述各结构式中,Y=Cl,Br,I;R=Me,乙基,丙基;X=O,CH(CH3)2;R1‑R4任选H或者SO3‑、或者R1,R2与苯环共同构成萘环以及衍生物、或者R3,R4与苯环共同构成萘环以及衍生物;n=1,3,5。该方法通过一锅法得到所需不对称结构荧光素,反应选择性好,容易分离纯化,且所需实验条件简单,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。

    Cy系列荧光素的合成方法以及在DNA测序中的应用

    公开(公告)号:CN109320445A

    公开(公告)日:2019-02-12

    申请号:CN201811149807.6

    申请日:2018-09-29

    Inventor: 沈玉梅 汤博为

    Abstract: 本发明公开了一种Cy系列荧光素的合成方法以及在DNA测序中的应用,所述方法包括:A、将反应物与反应物YCH2(CH2)4COOH或者YR回流,得到反应中间体 和B、将步骤A所得 与反应,生成然后直接加入 一锅法生成目标产物;所述各结构式中,Y=Cl,Br,I;R=Me,乙基,丙基;X=O,CH(CH3)2;R1-R4任选H或者SO3-、或者R1,R2与苯环共同构成萘环以及衍生物、或者R3,R4与苯环共同构成萘环以及衍生物;n=1,3,5。该方法通过一锅法得到所需不对称结构荧光素,反应选择性好,容易分离纯化,且所需实验条件简单,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。

    硫代缩酮连接单元及其合成方法、用途

    公开(公告)号:CN106083676B

    公开(公告)日:2019-01-11

    申请号:CN201610402708.9

    申请日:2016-06-07

    Abstract: 本发明公开一种硫代缩酮连接单元及其合成方法、用途;所述硫代缩酮连接单元的结构如式(Ⅰ)所示:其中,R=‑OH或者‑COOH;R1与R2的满足如下条件中的一种:(1)R1=R2=甲基;或,(2)R1=苯基、对甲氧基苯基、2,4,6‑三甲氧基苯基、萘基或对甲氧基萘基,R2=H;或,(3)R1、R2共同构成环己基或环戊基。该单元与核苷酸及荧光素连接得到的荧光素标记核苷酸可用于DNA测序。与现有技术相比,本发明连接单元的可逆终止剂用于DNA测序时,其延伸效率接近100%,并且在模板为连续多个相同碱基时,一次只延伸一个可逆终止剂;其合成所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。

    DNA合成测序方法与测序系统

    公开(公告)号:CN108192957A

    公开(公告)日:2018-06-22

    申请号:CN201711279201.X

    申请日:2017-12-06

    Abstract: 本发明公开了一种DNA合成测序方法和测序系统,所述方法包括:通过水溶性双功能连接单元将引物P1连接于基体表面;在基体表面加入含待测DNA模板的溶液,然后进行等温表面放大反应;再将引物Pe加入基体表面,然后在基体表面加入四种碱基的荧光标记可逆终止剂的延伸反应溶液,进行延伸反应;然后对延伸后的DNA双链进行成像之后,加入相应的化学试剂,使荧光标记可逆终止剂的连接单元断裂。重复DNA链延伸和断裂步骤,完成多次循环测序,即得待测DNA模板核苷酸的碱基序列。本发明测序方法可用于DNA高通量合成测序,在所述测序条件下实验结果其读长至少为73碱基;如果双端测序,其读长至少为146,准确率至少为99.98%。

    基于分子胶的多嵌段共聚物及其胶束

    公开(公告)号:CN105254899A

    公开(公告)日:2016-01-20

    申请号:CN201510666681.X

    申请日:2015-10-15

    Abstract: 本发明提供了一种基于分子胶的PLA-PEG两亲性多嵌段共聚物,其结构如式I所示:其中,n为2~200之间的任意整数,m为2~150之间的任意整数,t为1或2。所述的基于分子胶的PLA-PEG两亲性多嵌段共聚物的制备方法包括如下步骤:分别制备亲水片段化合物S3-PEG-S3和疏水片段化合物Z1-PLA-Z1将所述亲水片段化合物S3-PEG-S3和疏水片段化合物Z1-PLA-Z1进行氧化反应,得到所述PLA-PEG两亲性多嵌段共聚物本发明具有如下的有益效果:使用凝胶色谱技术对该多嵌段共聚物进行分析表征,通过合成基于分子胶的两亲性多嵌段共聚物的表征的对照组共聚物,有效准确地计算每个嵌段在该共聚物中的百分含量。

    四氢呋喃醚衍生物可裂解连接单元及其用途

    公开(公告)号:CN102675262B

    公开(公告)日:2016-01-13

    申请号:CN201210132695.X

    申请日:2012-04-28

    CPC classification number: Y02P20/55

    Abstract: 本发明公开了四氢呋喃醚衍生物可裂解连接单元及其用途;本发明的可裂解连接单元,结构式如下式所示:,其中,n为0~44中的任意一个整数。本发明的四氢呋喃环衍生物中,无论是顺式、反式或二者的混合物都可用于测序,并具有相同的作用;该类化合物合成原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,易于实现大量合成;该类化合物可与核苷酸和荧光素实现高效率的连接;通过研究该类化合物的裂解性能,发现该类化合物在温和的条件下可以实现高效率的裂解,具有应用于DNA测序的价值。

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