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公开(公告)号：CN117711485A
公开(公告)日：2024-03-15
申请号：CN202311397671.1
申请日：2023-10-24
Applicant: 华中农业大学
Abstract: 本发明公开了猪80K功能位点基因芯片及其应用，首次在利用猪基因组启动子、增强子、编码区关键突变等信息设计基因芯片，基于大规模多组学高通量测序数据，对功能位点按照重要性进行分类，开发以功能位点为主的功能位点基因芯片，打破了连锁依赖理论，解决了现有商业化芯片由于不同群体间因连锁程度不同，在不同群体间的通用性较差的问题。本芯片还具有捕获特性高、成本低、灵活，适用于不同品种猪种遗传育种研究及选种选配等商业化应用。
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公开(公告)号：CN115948363B
公开(公告)日：2024-02-27
申请号：CN202211045564.8
申请日：2022-08-26
Applicant: 武汉影子基因科技有限公司 , 华中农业大学
Abstract: 转座酶片段化位点基本无偏好性，无宿主污染，本发明公开了Tn5转座酶突变体及其制备方 更好地满足了高通量建库要求。法和应用，对Tn5转座酶的402和403位点的氨基酸进行突变，第402位的半胱氨酸突变为色氨酸，第403位的谷氨酰胺突变为赖氨酸，与野生型Tn5(56)对比文件Jiangang Hu 等.“Identification ofnovel biofilm genes in avian pathogenicEscherichia coli by Tn5 transposon mutantlibrary”《.World J Microbiol Biotechnol》.2022,第38卷(第8期),doi: 10.1007/s11274-022-03314-4.唐江涛 等.“细菌转座子 Tn5 转座机理的研究进展”《.广西农业生物科学》.2003,(第4期),第316-321页.
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公开(公告)号：CN117577194A
公开(公告)日：2024-02-20
申请号：CN202311362179.0
申请日：2023-10-18
Applicant: 华中农业大学
IPC: G16B40/20 , G16B20/20 , G16B25/10 , G06F18/213 , G06F18/243 , G06F18/27 , G06N20/20
Abstract: 本发明公开了一种快速高效的基因型与表型的监督降维方法，该方法融合梯度提升决策树（Gradient Boosted Decision Tree）策略与相关分量回归（Correlated Component Regression,CCR）方法，通过对损失函数的拟合减少协变量的逐层累加，在不损失更多信息、保留CCR尺度不变性优势的同时以线性模式提升降维效率，并优化了确定压缩分量的标准，实现了最终压缩分量的可自动确定。本发明所述的方法采用线性算法，计算复杂度低，计算速度在现有基因组降维技术中最快，通过结合梯度提升策略以及采用相关组分的收敛方法，使降维后的数据具备原始数据近似或更佳的预测性能。
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公开(公告)号：CN117551788A
公开(公告)日：2024-02-13
申请号：CN202311729664.7
申请日：2023-12-15
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本申请涉及猪NDUFAF6基因相关肉质性状分子标记及应用。该分子标记包括猪肉肉质性状的分子标记，包括猪NDUFAF6基因第一外显子g4:41657299处发生单核苷酸突变G>A形成的核苷酸序列。利用该分子标记设计引物，对包含该SNP位点的核苷酸序列进行PCR扩增的，能够够在较短的时间内鉴别NDUFAF6基因的多态性，从而检测猪肉肉质性状的差异，以为猪肉品种的选育提供指导，且不需要昂贵的设备。
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公开(公告)号：CN116410955B
公开(公告)日：2023-12-19
申请号：CN202310247616.8
申请日：2023-03-10
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12N9/22 , C12N15/55 , C12Q1/6818 , C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明公开了两种CRISPR/Cas系统的新型核酸内切酶及其应用，具体地，本发明首次提供了两种结合宏基因组学与实验手段挖掘到的新型CRISPR/Cas12a系统家族新成员Gs12‑3、Gs12‑5，特别是新发现的Gs12‑3与已知Cas12a蛋白相比具有覆盖靶标位点范围更广的基因组编辑能力，还建立了基于CRISPR/Gs12‑3系统介导的核酸可视化检测技术。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN116904477A
公开(公告)日：2023-10-20
申请号：CN202311069870.X
申请日：2023-08-23
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12N15/12 , C07K14/47 , C12N15/113 , C12N9/22 , C12N5/10 , C12N15/85 , C12N15/867 , A01K67/027 , A61K48/00 , A61P31/14
Abstract: 本发明公开了利用单碱基编辑饱和点突变文库筛选并鉴定的CALR基因突变体及其在猪抗乙型脑炎病毒中的应用，利用piggyBac转座系统构建了ancBE4max核酸酶稳定表达的猪源PK‑15细胞，并制备了覆盖CALR基因全部外显子和内含子的碱基突变细胞库，通过接种JEV诱导细胞死亡进行表型筛选，鉴定到CALR基因第764‑767位碱基由GGGG连续突变为AAAA能抑制JEV复制但是不影响CALR基因自身蛋白表达，该突变位点可作为抑制JEV感染的有效抗病靶点，在猪的抗病育种和药物治疗方面具有较大的推广应用价值。
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公开(公告)号：CN114196745B
公开(公告)日：2023-09-15
申请号：CN202111558508.X
申请日：2021-12-17
Applicant: 中华人民共和国洋山海关 , 华中农业大学
IPC: C12Q1/6876 , C12Q1/6844 , C12N15/11 , C12N15/113
Abstract: 本发明提供了一种基于等温扩增结合CRISPR‑Cas12a系统的可视化检测鱼粉中牛源成分的试剂盒及方法，所述的试剂盒包含LAMP引物组合、Cas12a蛋白、crRNA以及荧光标记的单链DNA报告分子，本发明所述的方法具有特异性强、灵敏度高和设备要求低的优点，可检测鱼粉中是否含有牛源成分，能有效提高海关进出口鱼粉掺杂查验效率。
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公开(公告)号：CN114717329B
公开(公告)日：2023-09-01
申请号：CN202210316469.0
申请日：2022-03-25
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于猪分子标记技术领域，具体涉及与母猪产死胎性状相关的SNP分子标记及其应用。本发明利用基因芯片技术进行基因分型，基于SNP分子标记进行全基因组关联分析，该分析筛选出6个与大白猪母猪产死胎性状相关的SNP分子标记位点。所述SNP分子标记位点分别位于母猪15号染色体的SLC4A10基因片段。本发明为母猪产死胎性状提供了新的SNP分子标记资源，并可在母猪遗传育种的标记辅助选择中应用。
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公开(公告)号：CN112195233B
公开(公告)日：2023-09-01
申请号：CN202011074475.7
申请日：2020-10-09
Applicant: 广西扬翔股份有限公司 , 华中农业大学
IPC: C12Q1/6883 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开一种与猪脐疝性状相关的SNP分子标记及筛选方法和应用。所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在序列的第101位碱基处的R是T或C，该突变导致上述序列的核苷酸多态性。如此，可通过在体外采用基因芯片技术检测猪的基因型，作为非诊断目的的评判猪是否具有脐疝性状，与目前的PCR‑RFLP等方法相比，本发明具有简单、快捷、灵敏度高和特异性好等突出优点。
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公开(公告)号：CN114182025B
公开(公告)日：2023-03-14
申请号：CN202111527919.2
申请日：2021-12-14
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本申请公开了与猪饲料转化率相关的SNP分子标记及其应用。该SNP分子标记位于国际猪参考基因组Ensembl Sscrofa11.1版本猪7号染色体7990990bp位置，表现为A/C的多态性。本申请验证了其对饲料转化率性状的影响效应，并建立高效准确的分子标记辅助育种技术，以将其应用于种猪饲料转化率性质遗传改良中，能够为降低猪饲料转化率和猪肉品质提高帮助。
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