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公开(公告)号：CN118957096A
公开(公告)日：2024-11-15
申请号：CN202411240393.3
申请日：2024-09-04
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种猪泌乳力相关SNP分子标记及其应用，所述分子标记的SNP位点位于X染色体，RS号为rs331986593，相比于携带CC基因型的母猪，携带CT、TT基因型的母猪泌乳力更高。利用该分子标记可准确预测不同基因型群体母猪之间泌乳力性状的差别，准确、高效地选育出母猪泌乳性能佳的优良猪品种，具有简单、快捷、灵敏度高和特异性好等突出优点。在猪育种工作中，该分子标记可作为泌乳力性状的可靠标记，便于进行早期选择，从而缩短世代间隔，提高选择强度，提高选种效率和准确性。
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公开(公告)号：CN117577194A
公开(公告)日：2024-02-20
申请号：CN202311362179.0
申请日：2023-10-18
Applicant: 华中农业大学
IPC: G16B40/20 , G16B20/20 , G16B25/10 , G06F18/213 , G06F18/243 , G06F18/27 , G06N20/20
Abstract: 本发明公开了一种快速高效的基因型与表型的监督降维方法，该方法融合梯度提升决策树（Gradient Boosted Decision Tree）策略与相关分量回归（Correlated Component Regression,CCR）方法，通过对损失函数的拟合减少协变量的逐层累加，在不损失更多信息、保留CCR尺度不变性优势的同时以线性模式提升降维效率，并优化了确定压缩分量的标准，实现了最终压缩分量的可自动确定。本发明所述的方法采用线性算法，计算复杂度低，计算速度在现有基因组降维技术中最快，通过结合梯度提升策略以及采用相关组分的收敛方法，使降维后的数据具备原始数据近似或更佳的预测性能。
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公开(公告)号：CN111304335B
公开(公告)日：2022-07-29
申请号：CN202010092413.2
申请日：2020-02-14
Applicant: 广西扬翔股份有限公司 , 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明提出了与仔猪死亡率相关的SNP标记，所述SNP标记选自SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列的第404位核苷酸，为碱基C或T。利用该分子标记可准确预测不同基因型群体猪之间死亡率性状的差别，准确、高效地选育出母猪繁殖能力佳的优良猪品种，具有简单、快捷、灵敏度高和特异性好等突出优点。在猪育种工作中，该分子标记可作为死亡率性状的可靠标记，便于进行早期选择，从而缩短世代间隔，提高选择强度，提高选种效率和准确性。
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公开(公告)号：CN109112218B
公开(公告)日：2021-08-24
申请号：CN201710829488.2
申请日：2017-09-14
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及IL1R1基因片段作为猪免疫性状的分子标记及应用。所述的分子标记由猪IL1R1基因中克隆得到。本发明筛选得到一种与猪免疫性状相关的分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第36位的碱基处存在一个A/G的等位基因突变，该突变导致SequenomSNP分型多态性。本发明还公开了筛选分子标记的方法及其在关联分析中的应用。本发明为猪免疫性状的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记。
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公开(公告)号：CN111118177B
公开(公告)日：2021-07-02
申请号：CN202010075877.2
申请日：2020-01-22
Applicant: 广西扬翔股份有限公司 , 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与猪性成熟期性状相关SNP分子标记。通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所公开的58个品种的469头猪的重测序数据，对比猪参考基因组序列获得基因分型数据，筛选得到一种与猪性成熟期相关的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第51位碱基处存在一个A/C的等位基因突变,当序列第51位核苷酸为C时，有利于猪拥有更长的性成熟期。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110273011B
公开(公告)日：2021-06-11
申请号：CN201910705906.6
申请日：2019-07-24
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与猪体长相关的InDel分子标记。通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所中公开的包含58个品种的469头猪的重测序数据，对比猪参考基因组序列获得基因分型数据，得到一种与猪体长性状相关的分子标记，该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，在该序列的第51‑52位碱基处存在一个AT/A的碱基缺失。当个体拥有该InDel时，具有更小的体长。本发明公开了筛选与猪体长相关分子标记的方法及其关联分析方法的应用。为猪体长的标记辅助选择提供了一个新的InDel分子标记资源。
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公开(公告)号：CN107828894B
公开(公告)日：2021-06-08
申请号：CN201711099615.4
申请日：2017-11-09
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及IGF1R基因片段作为猪免疫性状和生长性状的分子标记及应用。所述的分子标记由猪IGF1R基因中克隆得到。本发明筛选得到一种与猪免疫性状和生长性状相关的分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第33位的碱基处存在一个G/A的等位基因突变，该突变导致SequenomSNP分型多态性。本发明公开了筛选分子标记的方法及其与猪免疫性状和生长性状关联分析的应用。本发明为用于非诊断目的的猪免疫性状和生长性状的标记辅助选择提供了新的SNP分子标记资源。
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公开(公告)号：CN107557477B
公开(公告)日：2021-04-02
申请号：CN201710829547.6
申请日：2017-09-14
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及猪CLIC4基因作为免疫性状相关的分子标记及应用。本发明的分子标记克隆自CLIC4基因的一个片段。其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第116位碱基处发生一个等位基因突变(T/C突变)，该突变导致BstuI‑RFLP多态性。由该基因的SNP突变位点获得的分子标记与猪的免疫性状相关。对该分子标记进行了关联分析，发现此多态位点与猪的免疫性状，嗜碱性细胞数百分比呈现极显著相关关系。本发明的分子标记可作为非诊断目的的猪免疫性状的检测应用中。
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公开(公告)号：CN108998543B
公开(公告)日：2021-03-16
申请号：CN201811017261.9
申请日：2018-08-31
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与猪红细胞数目性状相关的SNP分子标记。该分子标记克隆自登陆号为ASGA0068286的基因，通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与猪红细胞数目性状相关的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第101位的碱基处存在一个T/C的等位基因突变，且当SEQ ID NO：1上的第101位核苷酸为C时，则猪具有更高的红细胞数目。公开了筛选与猪红细胞数目性状相关分子标记的方法及其关联分析方法的应用。本发明为猪免疫性状尤其是红细胞数目性状的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记资源。
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公开(公告)号：CN108950021B
公开(公告)日：2021-03-16
申请号：CN201811013595.9
申请日：2018-08-31
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及猪9号染色体基因间区单核苷酸多态作为猪红细胞数目性状的分子标记。通过基因芯片技术对登陆号为ASGA0082606基因进行分型，筛选得到一种与猪33日龄红细胞数目性状相关的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第101位的碱基处存在一个C/T的等位基因突变。当SEQ ID NO：1所示序列上的第101位核苷酸为T时，表明猪具有更高的红细胞数目。本发明为猪免疫性状尤其是红细胞数目的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记。
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