公开(公告)号：CN108315446B

公开(公告)日：2021-07-20

申请号：CN201810452325.1

申请日：2018-05-12

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 刘向东 ,  南九红 ,  马官军 ,  赵书红 ,  李新云 ,  刘小磊 ,  尹立林 ,  唐振双 ,  叶灯灯 ,  许月园

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于动物分子标记制备筛选技术领域，具体涉及一种与母猪肢蹄骨密度相关的SNP分子标记。该分子标记克隆自登陆号为MARC0002557的基因片段，通过基因芯片技术对该基因进行分型，筛选得到一种与母猪肢蹄骨密度相关的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第51位的碱基处存在一个C/T的等位基因突变，且当SEQ ID NO：1上的第51位核苷酸为T时，则证明母猪的肢蹄具有更高的骨密度。本发明还公开了与母猪肢蹄骨密度相关分子标记的制备方法及其关联分析方法的应用。本发明为猪肢蹄结实度性状尤其是骨密度的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记。

公开(公告)号：CN109680078A

公开(公告)日：2019-04-26

申请号：CN201910135038.2

申请日：2019-02-22

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 马云龙 ,  谢胜松 ,  南九红 ,  张赛仙 ,  张凯丽 ,  朱猛进 ,  余梅 ,  李新云 ,  赵书红

IPC: C12Q1/6888 ,  G16B20/00

CPC classification number: C12Q1/6888 ,  C12Q2600/124 ,  C12Q2600/156

Abstract: 本发明属于分子标记鉴定技术领域，具体涉及一种利用SNP分子标记数据定位畜禽重要经济性状基因组关联区域，并用于评估畜禽品种经济性状候选基因的方法。所述的方法针对120个以上具有代表性样本数目的群体，围绕具有连续变异的经济性状，通过人工制造群体表型梯度变化，并利用群体间选择信号检测方法，再计算SNP位点的梯度变化指数来评估经济性状的功能候选基因。该方法缩减了样本基因分型与表型测定成本，相比于传统的选择信号分析，能够具体解释目标表型的潜在候选区域，提高了选择信号分析的针对性，解决了传统选择信号分析无法直接与具体表型关联的技术问题。

公开(公告)号：CN108998543B

公开(公告)日：2021-03-16

申请号：CN201811017261.9

申请日：2018-08-31

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 刘向东 ,  蒋贝加 ,  赵书红 ,  杜小勇 ,  李新云 ,  南九红 ,  尹立林 ,  赵志超 ,  朱猛进 ,  张杰

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与猪红细胞数目性状相关的SNP分子标记。该分子标记克隆自登陆号为ASGA0068286的基因，通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与猪红细胞数目性状相关的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第101位的碱基处存在一个T/C的等位基因突变，且当SEQ ID NO：1上的第101位核苷酸为C时，则猪具有更高的红细胞数目。公开了筛选与猪红细胞数目性状相关分子标记的方法及其关联分析方法的应用。本发明为猪免疫性状尤其是红细胞数目性状的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记资源。

公开(公告)号：CN108866211B

公开(公告)日：2021-02-02

申请号：CN201811017200.2

申请日：2018-08-31

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 刘向东 ,  李信颉 ,  赵书红 ,  李新云 ,  南九红 ,  尹立林 ,  唐振双 ,  杜小勇 ,  朱猛进 ,  张杰

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选领域，涉及一种影响猪红细胞数目的SNP分子标记。该分子标记尤其与80日龄猪红细胞数性状SNP分子标记相关，克隆自登陆号为MARC0065518基因，通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与聚肌胞感染后猪红细胞数目相关的分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第101位碱基处有一个T/C的等位基因突变,该突变使SEQ ID NO：1序列产生了多态性。且当SEQ ID NO：1上的第101位核苷酸为C时，表明猪具有更高的红细胞数目。本发明公开了筛选分子标记的方法及其关联分析的应用。本发明为猪免疫性状尤其是红细胞数目的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记。

公开(公告)号：CN111979335A

公开(公告)日：2020-11-24

申请号：CN201910438307.2

申请日：2019-05-23

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 李世军 ,  南九红 ,  彭秀丽 ,  刘华珍 ,  牟春燕 ,  赛义德.阿里.阿自木 ,  龚炎长 ,  俸艳萍 ,  盛哲雅 ,  朱桂玉 ,  莫长欢 ,  周鑫 ,  周慧敏

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供了一种用于选择母鸡储精能力期间受精率的SNP分子标记及其应用，通过全基因组关联分析（GWAS）和限制性内切酶长度多态性（PCR-RFLP）技术方法，首次在母鸡基因组3号染色体上筛选到6个与母鸡储精能力期间受精率相关联的SNP分子标记，这些SNP位点的多态性与母鸡的储精能力期间的受精率（授精一次至母鸡产出最后一枚受精蛋之间受精蛋个数所占产蛋个数的百分率）显著关联，所述的SNP分子标记可以分别单独用于选择和改良母鸡的受精率。

公开(公告)号：CN111979332A

公开(公告)日：2020-11-24

申请号：CN201910433599.0

申请日：2019-05-22

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 李世军 ,  南九红 ,  赛义德.阿里.阿自木 ,  彭秀丽 ,  龚炎长 ,  俸艳萍 ,  盛哲雅 ,  朱桂玉 ,  莫长欢 ,  周鑫 ,  周慧敏

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供了一种用于选择母鸡储精能力期间受精率的SNP分子标记及其应用，通过全基因组关联分析（GWAS）和限制性内切酶长度多态性（PCR-RFLP）技术方法，首次在母鸡基因组3号染色体上筛选到6个与母鸡储精能力期间受精率相关联的SNP分子标记，这些SNP位点的多态性与母鸡的储精能力期间的受精率（授精一次至母鸡产出最后一枚受精蛋之间受精蛋个数所占产蛋个数的百分率）显著关联，所述的SNP分子标记可以分别单独用于选择和改良母鸡的受精率。

公开(公告)号：CN109371143B

公开(公告)日：2021-05-07

申请号：CN201811537946.6

申请日：2018-12-16

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 赵书红 ,  唐振双 ,  李新云 ,  尹立林 ,  南九红 ,  许婧雅 ,  梅全顺 ,  彭潇 ,  余梅 ,  刘小磊 ,  项涛

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于猪分子标记制备技术领域，具体涉及与猪生长性状相关联的SNP分子标记。所述的猪生长性状包括校正100KG日增重性状和校正100KG日龄性状。该分子标记克隆自登陆号为Affx‑114707063的基因片段，通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与猪生长性状相关的分子标记，其序列如SEQ ID NO：1所示，在序列的第51位碱基处存在一个A/T的等位基因突变；导致SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列产生多态性，且当该片段第51位核苷酸为A时，表明猪具有更快的生长速度。还公开了筛选与猪生长性状相关分子标记的方法及其关联分析的应用。为猪生长性状的辅助选择提供了新的标记资源。

公开(公告)号：CN111979331A

公开(公告)日：2020-11-24

申请号：CN201910433598.6

申请日：2019-05-22

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 李世军 ,  南九红 ,  赛义德.阿里.阿自木 ,  彭秀丽 ,  龚炎长 ,  俸艳萍 ,  盛哲雅 ,  朱桂玉 ,  莫长欢 ,  周鑫 ,  周慧敏

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供了一种与母鸡储精能力期间受精率相关的 SNP分子标记及其应用，通过全基因组关联分析（GWAS）和限制性内切酶长度多态性（PCR-RFLP）技术方法，首次在母鸡基因组13号染色体上筛选到6个与母鸡储精能力期间受精率相关联的SNP分子标记，这些SNP位点的多态性与母鸡的储精能力期间的受精率（授精一次至母鸡产出最后一枚受精蛋之间受精蛋个数所占产蛋个数的百分率）显著关联，所述的SNP分子标记可以分别单独用于选择和改良母鸡的受精率。

公开(公告)号：CN108998543A

公开(公告)日：2018-12-14

申请号：CN201811017261.9

申请日：2018-08-31

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 刘向东 ,  蒋贝加 ,  赵书红 ,  杜小勇 ,  李新云 ,  南九红 ,  尹立林 ,  赵志超 ,  朱猛进 ,  张杰

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与猪红细胞数目性状相关的SNP分子标记。该分子标记克隆自登陆号为ASGA0068286的基因，通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与猪红细胞数目性状相关的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第101位的碱基处存在一个T/C的等位基因突变，且当SEQ ID NO：1上的第101位核苷酸为C时，则猪具有更高的红细胞数目。公开了筛选与猪红细胞数目性状相关分子标记的方法及其关联分析方法的应用。本发明为猪免疫性状尤其是红细胞数目性状的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记资源。

公开(公告)号：CN108504746A

公开(公告)日：2018-09-07

申请号：CN201810266967.2

申请日：2018-03-29

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 刘向东 ,  南九红 ,  赵书红 ,  李新云 ,  赵志超 ,  张杰 ,  朱猛进 ,  许月园 ,  胡明阳 ,  王昇

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6837 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于猪分子标记制备技术领域，具体涉及聚肌胞感染后猪红细胞数目性状相关的SNP分子标记。该分子标记克隆自登陆号为DIAS0002844的CTTNBP2基因，通过PorcineSNP60  技术对该基因进行分型筛选得到一种聚肌胞感染后猪红细胞数目相关SNP的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第222位的碱基处存在一个A/G的等位基因突变，该突变导致PorcineSNP60 分型多态性。公开了筛选分子标记的方法及其关联分析方法的应用。本发明为猪免疫性状尤其是红细胞数目的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记。