公开(公告)号：CN109762911B

公开(公告)日：2020-12-01

申请号：CN201910130696.2

申请日：2019-02-21

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 朱猛进 ,  吴雅兰 ,  张伟 ,  周光亮 ,  王道远 ,  陈逸俊 ,  安美景 ,  赵书红

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选领域，具体涉及PTPRJ基因作为猪免疫相关性状的分子标记及其应用。本发明的分子标记克隆自PTPRJ基因的一个片段。其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第134碱基位处发生一个等位基因突变，即T/G突变。该基因的SNP突变位点获得的分子标记与猪的免疫相关性状相关。对该分子标记进行了关联分析，发现此多态位点与猪的T淋巴细胞亚型含量、嗜碱性粒细胞数、中性粒细胞百分比、嗜碱性粒细胞百分比、白介素‑10含量、80日龄体重这六个性状呈极显著相关。本发明的分子标记可作为检测猪免疫性状的相关标记，可用于猪的标记辅助育种上。

公开(公告)号：CN117577194A

公开(公告)日：2024-02-20

申请号：CN202311362179.0

申请日：2023-10-18

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 朱猛进 ,  车兆轩 ,  周光亮 ,  乔嘉坤 ,  许方军 ,  韩萍萍 ,  代翔毓 ,  苗娜 ,  赵书红 ,  李新云

IPC: G16B40/20 ,  G16B20/20 ,  G16B25/10 ,  G06F18/213 ,  G06F18/243 ,  G06F18/27 ,  G06N20/20

Abstract: 本发明公开了一种快速高效的基因型与表型的监督降维方法，该方法融合梯度提升决策树（Gradient Boosted Decision Tree）策略与相关分量回归（Correlated Component Regression,CCR）方法，通过对损失函数的拟合减少协变量的逐层累加，在不损失更多信息、保留CCR尺度不变性优势的同时以线性模式提升降维效率，并优化了确定压缩分量的标准，实现了最终压缩分量的可自动确定。本发明所述的方法采用线性算法，计算复杂度低，计算速度在现有基因组降维技术中最快，通过结合梯度提升策略以及采用相关组分的收敛方法，使降维后的数据具备原始数据近似或更佳的预测性能。

公开(公告)号：CN107557477B

公开(公告)日：2021-04-02

申请号：CN201710829547.6

申请日：2017-09-14

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 朱猛进 ,  周光亮 ,  张玲妮 ,  张巧霞 ,  陶加栋 ,  赵书红

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及猪CLIC4基因作为免疫性状相关的分子标记及应用。本发明的分子标记克隆自CLIC4基因的一个片段。其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第116位碱基处发生一个等位基因突变(T/C突变)，该突变导致BstuI‑RFLP多态性。由该基因的SNP突变位点获得的分子标记与猪的免疫性状相关。对该分子标记进行了关联分析，发现此多态位点与猪的免疫性状，嗜碱性细胞数百分比呈现极显著相关关系。本发明的分子标记可作为非诊断目的的猪免疫性状的检测应用中。

公开(公告)号：CN109762911A

公开(公告)日：2019-05-17

申请号：CN201910130696.2

申请日：2019-02-21

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 朱猛进 ,  吴雅兰 ,  张伟 ,  周光亮 ,  王道远 ,  陈逸俊 ,  安美景 ,  赵书红

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选领域，具体涉及PTPRJ基因作为猪免疫相关性状的分子标记及其应用。本发明的分子标记克隆自PTPRJ基因的一个片段。其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第134碱基位处发生一个等位基因突变，即T/G突变。该基因的SNP突变位点获得的分子标记与猪的免疫相关性状相关。对该分子标记进行了关联分析，发现此多态位点与猪的T淋巴细胞亚型含量、嗜碱性粒细胞数、中性粒细胞百分比、嗜碱性粒细胞百分比、白介素-10含量、80日龄体重这六个性状呈极显著相关。本发明的分子标记可作为检测猪免疫性状的相关标记，可用于猪的标记辅助育种上。

公开(公告)号：CN107557477A

公开(公告)日：2018-01-09

申请号：CN201710829547.6

申请日：2017-09-14

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 朱猛进 ,  周光亮 ,  张玲妮 ,  张巧霞 ,  陶加栋 ,  赵书红

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及猪CLIC4基因作为免疫性状相关的分子标记及应用。本发明的分子标记克隆自CLIC4基因的一个片段。其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第116位碱基处发生一个等位基因突变(T/C突变)，该突变导致BstuI-RFLP多态性。由该基因的SNP突变位点获得的分子标记与猪的免疫性状相关。对该分子标记进行了关联分析，发现此多态位点与猪的免疫性状，嗜碱性细胞数百分比呈现极显著相关关系。本发明的分子标记可作为非诊断目的的猪免疫性状的检测应用中。