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公开(公告)号：CN119360986A
公开(公告)日：2025-01-24
申请号：CN202411519074.6
申请日：2024-10-29
IPC: G16B50/10
Abstract: 公开了一种利用大规模基因组注释信息提高猪复杂性状基因组选择准确性的方法，包括整合参考群猪只基因组的多个功能注释及其位置信息；提取多个功能注释区域的SNPs数据并构建功能注释的基因组亲缘关系矩阵A；估计每个基因组亲缘关系矩阵A的方差组分，基于方差组分对多个功能注释进行排序，合并多个功能注释并得到功能注释集；删除功能注释集中的重复SNPs数据并构建功能注释集的基因组亲缘关系矩阵B，计算功能注释集的随机遗传效应值以得到猪估计的基因组育种值。本申请通过提取猪复杂性状的多种基因组功能注释，通过拟合包含多个随机遗传效应的混合线性模型得到基因组育种值，提高了猪基因组育种值预测的准确性和时效性。
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公开(公告)号：CN109371143B
公开(公告)日：2021-05-07
申请号：CN201811537946.6
申请日：2018-12-16
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于猪分子标记制备技术领域，具体涉及与猪生长性状相关联的SNP分子标记。所述的猪生长性状包括校正100KG日增重性状和校正100KG日龄性状。该分子标记克隆自登陆号为Affx‑114707063的基因片段，通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与猪生长性状相关的分子标记，其序列如SEQ ID NO：1所示，在序列的第51位碱基处存在一个A/T的等位基因突变；导致SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列产生多态性，且当该片段第51位核苷酸为A时，表明猪具有更快的生长速度。还公开了筛选与猪生长性状相关分子标记的方法及其关联分析的应用。为猪生长性状的辅助选择提供了新的标记资源。
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公开(公告)号：CN108359735B
公开(公告)日：2020-12-25
申请号：CN201810483694.7
申请日：2018-05-19
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于动物遗传标记筛选领域，具体涉及与母猪肢蹄骨密度相关的VTCN1基因的SNP遗传标记。该标记克隆自Ensemble数据库登录号为ALGA0027556的序列，其位于VTCN1基因的外显子区域。利用基因芯片技术对VTCN1基因进行分型，筛选得到一种与母猪肢蹄骨密度相关的标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，该序列的第101位的碱基处存在一个A/G的等位基因突变，导致多态性，当SEQ ID NO：1上的第101位的核苷酸为A时，判定母猪的肢蹄具有更高的骨密度。公开了筛选与母猪肢蹄骨密度相关遗传标记的方法及关联分析，为猪肢蹄结实度性状尤其是骨密度的标记辅助选择提供了新的SNP标记。
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公开(公告)号：CN110512006A
公开(公告)日：2019-11-29
申请号：CN201910719200.5
申请日：2019-08-01
Applicant: 广西扬翔股份有限公司 , 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与猪毛色性状相关的SNP分子标记。该SNP分子标记的基因片段的登陆号为rs339614828，通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所公开的包含58个品种的469头猪的重测序数据，对比猪参考基因组序列获得基因分型数据，得到一种与猪毛色性状相关的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第51位的碱基处存在一个G/A的等位基因突变，导致所示序列的核苷酸产生多态性，当SEQ ID NO：1上的第51位核苷酸为A时，有利于猪拥有较浅的毛色。
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公开(公告)号：CN109524059A
公开(公告)日：2019-03-26
申请号：CN201811620927.X
申请日：2018-12-28
Applicant: 华中农业大学 , 广州影子科技有限公司
IPC: G16B20/00
Abstract: 本发明提供一种快速稳定的动物个体基因组育种值评估方法，涉及动物育种技术领域。该方法采用HIBLUP使用表型、基因型和谱系信息进行基因组育种值的预测，最终输出中包括估计的个体遗传价值、每个个体的加性效应和显性效应值以及用于基因分型芯片中的每个遗传标记效应的反向解析值。本发明全面利用谱系、表型和基因型信息来预测每个动物的遗传(加性和显性效应)价值以及每个SNP标记位点的效应值，实现最先进的基因组育种值的预测和方差组分估计算法而实现基因组选择。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN108998543A
公开(公告)日：2018-12-14
申请号：CN201811017261.9
申请日：2018-08-31
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与猪红细胞数目性状相关的SNP分子标记。该分子标记克隆自登陆号为ASGA0068286的基因，通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与猪红细胞数目性状相关的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第101位的碱基处存在一个T/C的等位基因突变，且当SEQ ID NO：1上的第101位核苷酸为C时，则猪具有更高的红细胞数目。公开了筛选与猪红细胞数目性状相关分子标记的方法及其关联分析方法的应用。本发明为猪免疫性状尤其是红细胞数目性状的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记资源。
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公开(公告)号：CN108411004A
公开(公告)日：2018-08-17
申请号：CN201810518448.0
申请日：2018-05-27
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于动物分子标记筛选技术领域，具体涉及检测母猪肢蹄骨密度的SNP遗传标记该遗传标记克隆自ENSSSCG00000031404基因片段。通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与母猪肢蹄骨密度相关的遗传标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，该序列的第51位的碱基处存在一个C/T的等位基因突变，导致该序列多态性；当SEQ ID NO：1上的第51位核苷酸为T时，判定母猪的肢蹄具有更高的骨密度。本发明公开了筛选与母猪肢蹄骨密度相关遗传标记的方法及其应用。为猪肢蹄结实度性状尤其是骨密度的标记辅助选择提供了一个新的SNP遗传标记。
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公开(公告)号：CN108359735A
公开(公告)日：2018-08-03
申请号：CN201810483694.7
申请日：2018-05-19
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明属于动物遗传标记筛选领域，具体涉及与母猪肢蹄骨密度相关的VTCN1基因的SNP遗传标记。该标记克隆自Ensemble数据库登录号为ALGA0027556的序列，其位于VTCN1基因的外显子区域。利用基因芯片技术对VTCN1基因进行分型，筛选得到一种与母猪肢蹄骨密度相关的标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，该序列的第101位的碱基处存在一个A/G的等位基因突变，导致多态性，当SEQ ID NO：1上的第101位的核苷酸为A时，判定母猪的肢蹄具有更高的骨密度。公开了筛选与母猪肢蹄骨密度相关遗传标记的方法及关联分析，为猪肢蹄结实度性状尤其是骨密度的标记辅助选择提供了新的SNP标记。
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公开(公告)号：CN108315446B
公开(公告)日：2021-07-20
申请号：CN201810452325.1
申请日：2018-05-12
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于动物分子标记制备筛选技术领域，具体涉及一种与母猪肢蹄骨密度相关的SNP分子标记。该分子标记克隆自登陆号为MARC0002557的基因片段，通过基因芯片技术对该基因进行分型，筛选得到一种与母猪肢蹄骨密度相关的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第51位的碱基处存在一个C/T的等位基因突变，且当SEQ ID NO：1上的第51位核苷酸为T时，则证明母猪的肢蹄具有更高的骨密度。本发明还公开了与母猪肢蹄骨密度相关分子标记的制备方法及其关联分析方法的应用。本发明为猪肢蹄结实度性状尤其是骨密度的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记。
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公开(公告)号：CN108411004B
公开(公告)日：2021-03-16
申请号：CN201810518448.0
申请日：2018-05-27
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于动物分子标记筛选技术领域，具体涉及检测母猪肢蹄骨密度的SNP遗传标记该遗传标记克隆自ENSSSCG00000031404基因片段。通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与母猪肢蹄骨密度相关的遗传标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，该序列的第51位的碱基处存在一个C/T的等位基因突变，导致该序列多态性；当SEQ ID NO：1上的第51位核苷酸为T时，判定母猪的肢蹄具有更高的骨密度。本发明公开了筛选与母猪肢蹄骨密度相关遗传标记的方法及其应用。为猪肢蹄结实度性状尤其是骨密度的标记辅助选择提供了一个新的SNP遗传标记。
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