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公开(公告)号:CN107760742B
公开(公告)日:2022-10-11
申请号:CN201610707981.2
申请日:2016-08-23
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
IPC: C12P19/34
Abstract: 本发明公开了一种富含AT或者GC基因的合成方法。该方法包括:1)将基因的两条链分别分割成多个寡核苷酸片段,一条链寡核苷酸片段和对应的另外一条链寡核苷酸片段能够互补配对产生带有粘性末端的双链寡核苷酸片段;相邻两个双链寡核苷酸片段的相邻粘性末端能互补配对,且粘性末端长度依照基因的序列顺序,依次为4,6,…2(n+1)个碱基;2)合成寡核苷酸片段;3)将寡核苷酸链分段慢退火形成双链寡核苷酸片段;4)双链寡核苷酸片段磷酸化;5)将各双链寡核苷酸片段连接成完整的基因。该方法实现了富含AT或者GC基因的有效组装。
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公开(公告)号:CN109300508B
公开(公告)日:2020-08-11
申请号:CN201710611123.2
申请日:2017-07-25
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
Abstract: 一种DNA数据存储的编码解码方法,它包括数据编码和数据解码,其特征是所述的数据编码包含以下步骤:数据压缩,即先将一个或多个电子文档打包成单个文件。数据转码,即压缩文件以二进制形式读取,然后将二进制数据转成整数型数值串。数据加冗余,即利用RS编码系统进行纠错编码,生成数据冗余增加的整数型数值串。数据第二次转码,即将加冗余后的整数型数值串转码成可以用于芯片合成的DNA序列集。数据读取为数据编码的反向过程。与其他算法相比,该框架通过全新的5比特编码框架更好的对接CustomArray高通量合成平台,其编码潜力(Coding potential)为1.67;同时该算法利用TAR和LZMA压缩算法以及RS编码系统的联合使用策略,在降低数据冗余和增加纠错能力之间保持好平衡。
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公开(公告)号:CN107142269A
公开(公告)日:2017-09-08
申请号:CN201710423493.3
申请日:2017-06-07
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
CPC classification number: C07K14/245 , C12N15/70
Abstract: 本发明公开了一种改造的质粒复制子及其应用。本发明提供的质粒复制子是经典的低拷贝复制子pSC101的RepA蛋白93位谷氨酸突变为脯氨酸的突变体;编码该脯氨酸的密码子为CCG。携带本发明的人工改造的质粒复制子(pSC101‑RepA‑E93P)的质粒,其在大肠杆菌中复制后,在体外抽提的产量约为携带野生型pSC101复制子的质粒的12倍,约为携带CorEI/pMB1/pBR322类型高拷贝复制子的质粒pUC57的2倍。同时,在大肠杆菌中,携带本发明的人工改造的质粒复制子的质粒能够与携带CorEI/pMB1/pBR322类型高拷贝复制子的质粒几乎同等比例地共同复制。
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公开(公告)号:CN111527109B
公开(公告)日:2024-11-01
申请号:CN201880084110.7
申请日:2018-12-26
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
IPC: C07K19/00 , C12N15/62 , A61K39/395 , A61P35/00
Abstract: 提供了一种以抗体Fc区为骨架的融合蛋白二聚体,包括第一和第二多肽链,其中所述第一多肽链包括第一抗体Fc区和与所述第一抗体Fc区融合的一个或多个单域抗体;所述第二多肽链包括第二抗体Fc区和与所述第二抗体Fc区融合的一个或多个单域抗体;所述第一多肽链和/或第二多肽链还包括与各自抗体Fc区融合的细胞因子。还提供了该融合蛋白二聚体在制备治疗肿瘤的免疫治疗药物中的应用。所述Fc融合蛋白异源二聚体,不仅提升了单域抗体的活性,而且明显改善了细胞因子的生物学活性;并利用抗体的靶向特异性,有效增强了细胞因子的靶向运输,减弱了细胞毒性,从而具有更佳的抗肿瘤潜力。
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公开(公告)号:CN107142269B
公开(公告)日:2020-09-22
申请号:CN201710423493.3
申请日:2017-06-07
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种改造的质粒复制子及其应用。本发明提供的质粒复制子是经典的低拷贝复制子pSC101的RepA蛋白93位谷氨酸突变为脯氨酸的突变体;编码该脯氨酸的密码子为CCG。携带本发明的人工改造的质粒复制子(pSC101‑RepA‑E93P)的质粒,其在大肠杆菌中复制后,在体外抽提的产量约为携带野生型pSC101复制子的质粒的12倍,约为携带CorEI/pMB1/pBR322类型高拷贝复制子的质粒pUC57的2倍。同时,在大肠杆菌中,携带本发明的人工改造的质粒复制子的质粒能够与携带CorEI/pMB1/pBR322类型高拷贝复制子的质粒几乎同等比例地共同复制。
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公开(公告)号:CN109300508A
公开(公告)日:2019-02-01
申请号:CN201710611123.2
申请日:2017-07-25
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
Abstract: 一种DNA数据存储的编码解码方法,它包括数据编码和数据解码,其特征是所述的数据编码包含以下步骤:数据压缩,即先将一个或多个电子文档打包成单个文件。数据转码,即压缩文件以二进制形式读取,然后将二进制数据转成整数型数值串。数据加冗余,即利用RS编码系统进行纠错编码,生成数据冗余增加的整数型数值串。数据第二次转码,即将加冗余后的整数型数值串转码成可以用于芯片合成的DNA序列集。数据读取为数据编码的反向过程。与其他算法相比,该框架通过全新的5比特编码框架更好的对接CustomArray高通量合成平台,其编码潜力(Coding potential)为1.67;同时该算法利用TAR和LZMA压缩算法以及RS编码系统的联合使用策略,在降低数据冗余和增加纠错能力之间保持好平衡。
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公开(公告)号:CN107974448A
公开(公告)日:2018-05-01
申请号:CN201610920370.6
申请日:2016-10-21
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
IPC: C12N15/10
CPC classification number: C12N15/10 , C12Q2521/301 , C12Q2521/501 , C12Q2525/131 , C12Q2525/191
Abstract: 本发明公开了一种序列复杂基因的合成方法。本发明方法包括:1)利用本发明提供的基因分段和单链寡核苷酸设计规则,设计一系列包含基因正,负链序列的30bp-150bp的单链寡核苷酸序列,2)挑选1中获得的单链寡核苷酸片段,根据正,负链互补配对的原则,利用本发明设计的退火程序,每对正,负链单链寡核苷酸片段单独退火成双链寡核苷酸片段,并装载到目标载体上,测序,验证;3)利用“识别序列外切割”的核酸内切酶,基于2中获得的双链寡核苷酸片段,经过1-3轮的体外连接组装,克隆,验证,完成100bp-20kb序列复杂基因的合成组装。本发明提供的方法,能够有效的合成传统方法无法合成或者合成起来困难的序列复杂基因。
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公开(公告)号:CN111527109A
公开(公告)日:2020-08-11
申请号:CN201880084110.7
申请日:2018-12-26
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
IPC: C07K19/00 , C12N15/62 , A61K39/395 , A61P35/00
Abstract: 提供了一种以抗体Fc区为骨架的融合蛋白二聚体,包括第一和第二多肽链,其中所述第一多肽链包括第一抗体Fc区和与所述第一抗体Fc区融合的一个或多个单域抗体;所述第二多肽链包括第二抗体Fc区和与所述第二抗体Fc区融合的一个或多个单域抗体;所述第一多肽链和/或第二多肽链还包括与各自抗体Fc区融合的细胞因子。还提供了该融合蛋白二聚体在制备治疗肿瘤的免疫治疗药物中的应用。所述Fc融合蛋白异源二聚体,不仅提升了单域抗体的活性,而且明显改善了细胞因子的生物学活性;并利用抗体的靶向特异性,有效增强了细胞因子的靶向运输,减弱了细胞毒性,从而具有更佳的抗肿瘤潜力。
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公开(公告)号:CN108531471A
公开(公告)日:2018-09-14
申请号:CN201710116019.6
申请日:2017-03-01
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
IPC: C12N15/10
CPC classification number: C12N15/10 , C12Q2521/313 , C12Q2531/137 , C12Q2531/113
Abstract: 本发明公开了一种长基因合成方法。一种长基因合成方法,包含以下步骤:1)按照基因片段内部的typeIIs酶切位点对长基因进行两级分段;2)通过传统的基因合成获得二级片段;3)由二级片段利用Golden Gate拼接成一级片段;4)由一级片段利用酶切-LCR的方法,或者PCR-LCR的方法拼接成全长基因。此方法使用typeIIs酶切位点对大片段基因进行分段,typeIIs酶切位点有很多可供选择,因此方法适用于绝大部分的序列特征。本方法能够快速的将短片段拼接成长片段。由二级片段拼接成全长可以在五天内实现。整个技术方案流程化,可以利用软件进行自动化设计,同时可以使用自动化平台进行生产。
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公开(公告)号:CN107287228A
公开(公告)日:2017-10-24
申请号:CN201610222505.1
申请日:2016-04-11
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
CPC classification number: C12N15/65 , C12N15/102 , C12N15/75 , C12N2800/101 , C12N2800/40 , C12Q2531/113
Abstract: 本发明公开一种构建基因组编辑正负筛选标记模板的方法及其应用,包括以下步骤:(1)将毒性基因从中间分成两部分:前半部分毒性基因和后半部分毒性基因,并分别克隆入克隆载体;(2)将上下游同源臂分别克隆入克隆载体;(3)将步骤(1)制备的载体质粒和步骤(2)制备的载体质粒混合在一起,利用金门组装反应将两部分毒性基因片段和上下游同源臂共四个片段拼接在一起;(4)将拼接产物做为PCR模板,扩增基因组编辑正负筛选标记模板的全长。本发明方法仅需要一个金门组装反应和一个PCR反应就可以扩增出可以直接转化的正负筛选标记模板。避免了克隆毒性基因的困难和多重PCR过程引入的突变和造成的不便。
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