-
公开(公告)号：CN107142269B
公开(公告)日：2020-09-22
申请号：CN201710423493.3
申请日：2017-06-07
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种改造的质粒复制子及其应用。本发明提供的质粒复制子是经典的低拷贝复制子pSC101的RepA蛋白93位谷氨酸突变为脯氨酸的突变体；编码该脯氨酸的密码子为CCG。携带本发明的人工改造的质粒复制子(pSC101‑RepA‑E93P)的质粒，其在大肠杆菌中复制后，在体外抽提的产量约为携带野生型pSC101复制子的质粒的12倍，约为携带CorEI/pMB1/pBR322类型高拷贝复制子的质粒pUC57的2倍。同时，在大肠杆菌中，携带本发明的人工改造的质粒复制子的质粒能够与携带CorEI/pMB1/pBR322类型高拷贝复制子的质粒几乎同等比例地共同复制。
-
公开(公告)号：CN107974448A
公开(公告)日：2018-05-01
申请号：CN201610920370.6
申请日：2016-10-21
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
IPC: C12N15/10
CPC classification number: C12N15/10 , C12Q2521/301 , C12Q2521/501 , C12Q2525/131 , C12Q2525/191
Abstract: 本发明公开了一种序列复杂基因的合成方法。本发明方法包括：1)利用本发明提供的基因分段和单链寡核苷酸设计规则，设计一系列包含基因正，负链序列的30bp-150bp的单链寡核苷酸序列，2)挑选1中获得的单链寡核苷酸片段，根据正，负链互补配对的原则，利用本发明设计的退火程序，每对正，负链单链寡核苷酸片段单独退火成双链寡核苷酸片段，并装载到目标载体上，测序，验证；3)利用“识别序列外切割”的核酸内切酶，基于2中获得的双链寡核苷酸片段，经过1-3轮的体外连接组装，克隆，验证，完成100bp-20kb序列复杂基因的合成组装。本发明提供的方法，能够有效的合成传统方法无法合成或者合成起来困难的序列复杂基因。
-
公开(公告)号：CN107760742B
公开(公告)日：2022-10-11
申请号：CN201610707981.2
申请日：2016-08-23
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
IPC: C12P19/34
Abstract: 本发明公开了一种富含AT或者GC基因的合成方法。该方法包括：1)将基因的两条链分别分割成多个寡核苷酸片段，一条链寡核苷酸片段和对应的另外一条链寡核苷酸片段能够互补配对产生带有粘性末端的双链寡核苷酸片段；相邻两个双链寡核苷酸片段的相邻粘性末端能互补配对，且粘性末端长度依照基因的序列顺序，依次为4，6，…2(n+1)个碱基；2)合成寡核苷酸片段；3)将寡核苷酸链分段慢退火形成双链寡核苷酸片段；4)双链寡核苷酸片段磷酸化；5)将各双链寡核苷酸片段连接成完整的基因。该方法实现了富含AT或者GC基因的有效组装。
-
公开(公告)号：CN107142269A
公开(公告)日：2017-09-08
申请号：CN201710423493.3
申请日：2017-06-07
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
CPC classification number: C07K14/245 , C12N15/70
Abstract: 本发明公开了一种改造的质粒复制子及其应用。本发明提供的质粒复制子是经典的低拷贝复制子pSC101的RepA蛋白93位谷氨酸突变为脯氨酸的突变体；编码该脯氨酸的密码子为CCG。携带本发明的人工改造的质粒复制子(pSC101‑RepA‑E93P)的质粒，其在大肠杆菌中复制后，在体外抽提的产量约为携带野生型pSC101复制子的质粒的12倍，约为携带CorEI/pMB1/pBR322类型高拷贝复制子的质粒pUC57的2倍。同时，在大肠杆菌中，携带本发明的人工改造的质粒复制子的质粒能够与携带CorEI/pMB1/pBR322类型高拷贝复制子的质粒几乎同等比例地共同复制。
-
Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110070913A
公开(公告)日：2019-07-30
申请号：CN201710611752.5
申请日：2017-07-25
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
Abstract: 一种基于免疫算法的密码子优化方法,其特征在于先后使用免疫算法和遗传算法分别对蛋白质编码序列进行局部多目标优化和全局多目标优化，再用穷举法对序列进行微调优化，从而最大限度的搜索到最优表达序列。本发明既保留了遗传算法随机全局并行搜索的特点，又在相当大程度上避免未成熟收敛，确保快速收敛于全局最优解。本发明第一次结合利用免疫算法与遗传算法的准确度和效率的优势，通过分步流程（依次分别是局部优化、全局优化、微调优化）进行密码子优化，并通过实例测试证明该算法进行密码子优化的高效性。
-
公开(公告)号：CN107760742A
公开(公告)日：2018-03-06
申请号：CN201610707981.2
申请日：2016-08-23
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
IPC: C12P19/34
CPC classification number: C12P19/34
Abstract: 本发明公开了一种富含AT或者GC基因的合成方法。该方法包括：1)将基因的两条链分别分割成多个寡核苷酸片段，一条链寡核苷酸片段和对应的另外一条链寡核苷酸片段能够互补配对产生带有粘性末端的双链寡核苷酸片段；相邻两个双链寡核苷酸片段的相邻粘性末端能互补配对，且粘性末端长度依照基因的序列顺序，依次为4，6，…2(n+1)个碱基；2)合成寡核苷酸片段；3)将寡核苷酸链分段慢退火形成双链寡核苷酸片段；4)双链寡核苷酸片段磷酸化；5)将各双链寡核苷酸片段连接成完整的基因。该方法实现了富含AT或者GC基因的有效组装。
-
公开(公告)号：CN107142272A
公开(公告)日：2017-09-08
申请号：CN201710413737.X
申请日：2017-06-05
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
CPC classification number: C12N15/70 , C12N9/22 , C12N2810/10
Abstract: 本发明公开了一种控制大肠杆菌中质粒复制的方法。本发明设计开发的质粒调控方法基于Crispr/Cas9系统；其利用表达的dCas9蛋白以及转录的针对于质粒复制区靶序列的gRNA，有效的实现了质粒复制的调控抑制，该方法尚未见其它文献和专利报道，是一种全新的方法。该方法中使用的针对复制区的靶序列，可以有多种选择，保证了利用不同的dCas9/gRNA对，实现不同程度的质粒复制调控的目的。该方法能够有效的降低质粒复制后产量2‑34倍，相比以前专利报道的方法，具有调控范围更广，调控能力更强的特点。总之，该方法设计新颖，能够有效实现对质粒复制不同程度的调控。
-
公开(公告)号：CN110070913B
公开(公告)日：2023-06-27
申请号：CN201710611752.5
申请日：2017-07-25
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
Abstract: 一种基于免疫算法的密码子优化方法,其特征在于先后使用免疫算法和遗传算法分别对蛋白质编码序列进行局部多目标优化和全局多目标优化，再用穷举法对序列进行微调优化，从而最大限度的搜索到最优表达序列。本发明既保留了遗传算法随机全局并行搜索的特点，又在相当大程度上避免未成熟收敛，确保快速收敛于全局最优解。本发明第一次结合利用免疫算法与遗传算法的准确度和效率的优势，通过分步流程（依次分别是局部优化、全局优化、微调优化）进行密码子优化，并通过实例测试证明该算法进行密码子优化的高效性。
-
公开(公告)号：CN107974448B
公开(公告)日：2023-04-14
申请号：CN201610920370.6
申请日：2016-10-21
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明公开了一种序列复杂基因的合成方法。本发明方法包括：1)利用本发明提供的基因分段和单链寡核苷酸设计规则，设计一系列包含基因正，负链序列的30bp‑150bp的单链寡核苷酸序列，2)挑选1中获得的单链寡核苷酸片段，根据正，负链互补配对的原则，利用本发明设计的退火程序，每对正，负链单链寡核苷酸片段单独退火成双链寡核苷酸片段，并装载到目标载体上，测序，验证；3)利用“识别序列外切割”的核酸内切酶，基于2中获得的双链寡核苷酸片段，经过1‑3轮的体外连接组装，克隆，验证，完成100bp‑20kb序列复杂基因的合成组装。本发明提供的方法，能够有效的合成传统方法无法合成或者合成起来困难的序列复杂基因。
-
-
-
-
-
-
-
-
Search Results
9
records
(took 0.026 seconds)
