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公开(公告)号：CN117153253B
公开(公告)日：2024-05-07
申请号：CN202311160298.8
申请日：2023-09-08
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司 , 上海金斯康生物科技有限公司
Abstract: 本说明书实施例提供一种设计人源化抗体序列的方法，该方法包括确定初始抗体的可变区和CDR区；基于所述初始抗体的所述可变区的序列，从含有多个人源可变区序列的数据库中获取人源可变区序列模板；将所述人源可变区序列模板中的CDR区的序列替换为所述初始抗体的CDR区的序列，以获得目标可变区序列模板；基于所述目标可变区序列模板，使用遗传算法执行迭代模拟进化，确定多个候选可变区序列；基于所述多个候选可变区序列，确定多个候选人源化抗体序列和/或多个候选人源化抗体功能片段序列；从所述多个候选人源化抗体序列和/或多个候选人源化抗体功能片段序列中确定一个或多个目标人源化抗体序列和/或目标人源化抗体功能片段序列。
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公开(公告)号：CN110070913B
公开(公告)日：2023-06-27
申请号：CN201710611752.5
申请日：2017-07-25
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
Abstract: 一种基于免疫算法的密码子优化方法,其特征在于先后使用免疫算法和遗传算法分别对蛋白质编码序列进行局部多目标优化和全局多目标优化，再用穷举法对序列进行微调优化，从而最大限度的搜索到最优表达序列。本发明既保留了遗传算法随机全局并行搜索的特点，又在相当大程度上避免未成熟收敛，确保快速收敛于全局最优解。本发明第一次结合利用免疫算法与遗传算法的准确度和效率的优势，通过分步流程（依次分别是局部优化、全局优化、微调优化）进行密码子优化，并通过实例测试证明该算法进行密码子优化的高效性。
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公开(公告)号：CN114901828A
公开(公告)日：2022-08-12
申请号：CN202080090809.1
申请日：2020-12-30
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
IPC: C12N15/85 , C12N15/113
Abstract: 提供了一种哺乳动物表达系统使用的高表达载体，其包括1)hCMV增强子序列；2)hFerl启动子序列；3)chEF1a 5'非翻译区序列；以及4)SV40多聚腺苷酸化信号序列。还提供了筛选最佳表达调控元件组合的方法。
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公开(公告)号：CN119810612A
公开(公告)日：2025-04-11
申请号：CN202411397719.3
申请日：2024-10-09
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司 , 上海金斯康生物科技有限公司
Abstract: 本公开涉及利用人工智能识别和分析胶图。本公开的方案基于人工智能视觉处理技术和图像处理技术，对质粒、产物、标尺泳道进行识别，并确定相应泳道及条带在图像中的具体位置，可以感知相似胶图之间的细微差距，进行胶图中产物条带大小、基因组条带的分析等。对分析结果的判定不受个人主观因素的影响，从而提高了分析结果准确性和稳定性。
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公开(公告)号：CN119032398A
公开(公告)日：2024-11-26
申请号：CN202480002202.1
申请日：2024-04-03
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司 , 上海金斯康生物科技有限公司
IPC: G16B15/30
Abstract: 本公开提供了一种用于抗体药物开发的黏度预测方法。该黏度预测方法基于空间电荷图(SCM)与机器学习模型，包括如下步骤：基于SCM值对抗体进行特征提取；将提取的特征输入到基于机器学习的抗体黏度预测模型中，得到抗体黏度的预测值。本方法例如以随机森林(RF)作为机器学习预测模型，通过AlphaFold2快速构建抗体的静态3D结构模型，提取氨基酸残基的SCM值作为预测模型的输入。在预测模型训练过程中，通过训练样本的黏度值来对RF模型的参数进行优化。根据本方法，只需提供抗体的可变区氨基酸序列，就可以快速、准确、廉价的通过计算得到该抗体的黏度值，以供抗体药物开发早期有针对性的做黏度筛选，节约试错成本。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN118382706A
公开(公告)日：2024-07-23
申请号：CN202280083286.7
申请日：2022-12-15
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6844 , C12Q1/6869 , C12N9/22
Abstract: 一种整合位点的检测方法。所述方法包括a)将含有经修饰核酸的宿主DNA片段化得到线性核酸片段；b)将所述线性核酸片段环化得到双链环化产物，除去未环化的线性核酸片段；c)以所述双链环化产物为模板，用特异性结合所述经修饰核酸的引物进行滚环扩增；d)将扩增产物片段化并建立测序文库；e)对所述测序文库进行上机测序，得到测序结果；和f)将测序结果与所述宿主DNA的原始序列进行比对，以确定所述经修饰核酸在所述宿主DNA中的整合位点。
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公开(公告)号：CN109971833B
公开(公告)日：2020-11-20
申请号：CN201711462509.8
申请日：2017-12-28
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6844 , C40B50/06 , C12Q1/6869
Abstract: 本申请提供了一种快速均一化环状DNA样本的方法，包括对各样本中的环状DNA实施滚环扩增，从而使各样本中环状DNA的浓度均一化。
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公开(公告)号：CN109971833A
公开(公告)日：2019-07-05
申请号：CN201711462509.8
申请日：2017-12-28
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6844 , C40B50/06 , C12Q1/6869
Abstract: 本申请提供了一种快速均一化环状DNA样本的方法，包括对各样本中的环状DNA实施滚环扩增，从而使各样本中环状DNA的浓度均一化。
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公开(公告)号：CN109971825A
公开(公告)日：2019-07-05
申请号：CN201711460204.3
申请日：2017-12-28
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869
Abstract: 本申请提供了一种快速制备桑格测序模板的方法，包括：对包含环状DNA样本进行变性处理；对变性产物进行滚环扩增；用通过碱性磷酸酶处理滚环扩增产物去除其中残余的dNTP。
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公开(公告)号：CN119213122A
公开(公告)日：2024-12-27
申请号：CN202380040658.2
申请日：2023-05-17
Applicant: 南京金斯瑞生物科技有限公司
Abstract: 涉及分子生物学技术领域，具体而言，涉及sgRNA测序接头及其应用。sgRNA测序3′接头从5′端至3′端依次包含以下区段：第一非随机区、第一随机区、第二非随机区、成环DNA区以及第三非随机区；其中，所述第一非随机区用于与sgRNA的3′端连接；所述第一随机区包含3～12个碱基；所述第二非随机区与所述第三非随机区反向互补，以配合所述成环DNA区形成颈环结构，所述第三非随机区用于作为sgRNA逆转录复制的引物；所述成环DNA从5′端至3′端由第一成环区以及第二成环区组成；所述第三非随机区与所述第二成环区能够与第一测序接头引物序列互补配对结合。
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