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公开(公告)号：CN107619857A
公开(公告)日：2018-01-23
申请号：CN201711003896.9
申请日：2017-10-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测肉牛KLF8基因CNV标记的方法及其应用：以肉牛品种郏县牛的血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增其KLF8基因CNV区域和内参基因BTF3，根据2*log2 2-ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型，鉴定其KLF8基因的拷贝数变异。与郏县牛生产数据的关联分析显示，KLF8不同拷贝数对郏县牛的生长发育有显著影响，其中缺失型个体的胸宽显著高于插入型和正常型个体。本发明在DNA水平上检测与肉牛生产性状密切相关的CNV，可作为肉牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记，快速建立遗传资源优良的肉牛种群。
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公开(公告)号：CN107523643A
公开(公告)日：2017-12-29
申请号：CN201710985278.2
申请日：2017-10-20
Applicant: 西北农林科技大学
Abstract: 本发明公开了一种黄牛KCNJ12基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其专用试剂盒：基于实时荧光定量PCR技术，以郏县红牛的血液全基因组DNA为模板，利用特异引物P1扩增牛KCNJ12基因的拷贝数变异区域，同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增郏县红牛BTF3基因作为对照，然后利用2-ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在郏县红牛KCNJ12基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN104498610B
公开(公告)日：2017-01-11
申请号：CN201410810292.5
申请日：2014-12-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛MEF2C基因SNP位点的RFLP方法及试剂盒，该方法是以黄牛基因组DNA或包含MEF2C基因序列的DNA为模板，进行PCR扩增，然后利用限制性内切酶Hind Ш消化PCR扩增产物，再对酶切后片段进行琼脂糖凝胶电泳，鉴定黄牛NEF2C基因单核苷酸多态性。由于MEF2C基因在肌肉发育过程中起着重要的调节作用，与黄牛生长和肉质性状密切相关，而且该SNP与黄牛多种重要经济性状相关，所以，本发明提供的检测方法可用于黄牛肉用生长性状的标记辅助选择，而且该方法操作简单、快速，成本低，检测精确度高，在建立遗传资源优良的黄牛种群方面非常有优势。
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公开(公告)号：CN101871006B
公开(公告)日：2014-07-02
申请号：CN201010003635.9
申请日：2010-01-05
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种奶山羊weaver基因的单核苷酸多态性及其检测方法，其基因多态性包括：在奶山羊的weaver基因第99045位为T或C的碱基多态性；在奶山羊的weaver基因第99116位为T或C的碱基多态性。上述奶山羊weaver基因的单核苷酸多态性为：以包含weaver基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增奶山羊weaver基因；用限制性内切酶消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳，根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定奶山羊的单核苷酸多态性。该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与奶山羊泌乳性状密切相关的分子遗传标记，可用于奶山羊的分子育种。
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公开(公告)号：CN103146809A
公开(公告)日：2013-06-12
申请号：CN201210549050.6
申请日：2012-12-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛生长性状的基因诊断试剂盒，是一种LHX3基因检测黄牛生长性状的方法，该方法以包含LHX3基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增黄牛LHX3基因；通过DNA测序和PCR-SSCP技术进行基因多态性的检测与快速分型。该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与秦川牛生长性状密切相关的分子遗传标记，故本发明提供的检测方法可用于秦川牛肉用和生长性状的分子标记辅助选择，进而快速建立遗传资源优良的黄牛种群。本发明检测方法简单、成本低，检测结果直接、可靠，适用于对LHX3基因第10385位突变的大规模的筛查和诊断。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN103060439A
公开(公告)日：2013-04-24
申请号：CN201210532766.5
申请日：2012-12-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛生长性状的基因诊断试剂盒，是一种BMP7基因检测黄牛生长性状的方法，该方法以包含BMP7基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增黄牛BMP7基因；通过DNA测序和PCR-SSCP技术进行基因多态性的检测与快速分型，该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与黄牛生长性状密切相关的分子遗传标记，故本发明提供的检测方法可用于黄牛生长性状的分子标记辅助选择，进而快速建立遗传资源优良的黄牛种群。本发明检测方法简单、成本低，检测结果直接、可靠，适用于对黄牛BMP7基因突变位点的大规模的筛查和诊断。
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公开(公告)号：CN103031376A
公开(公告)日：2013-04-10
申请号：CN201210528854.8
申请日：2012-12-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测中外不同牛群体的基因诊断试剂盒，属于分子遗传学领域。一种GLI3基因检测中外不同牛群体的方法，包括以引物对P为引物，PCR扩增黄牛GLI3基因；进行DNA测序和SSCP多态性的检测及其不同基因型与经济性状的关联分析。该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与中外不同牛群体中特异分子遗传标记，故本发明提供的检测方法可用于区分中外不同牛群体，进而快速建立遗传资源优良的黄牛种群。本发明的优点是：首次提供了在3个中国黄牛群体中GLI3基因存在一种突变，并且该突变在国外牛品种中不存在多态性。本发明检测方法简单、成本低，检测结果直接、可靠，适用于中外不同牛群体GLI3基因大规模的筛查和诊断。
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公开(公告)号：CN101899500B
公开(公告)日：2012-10-17
申请号：CN201010108118.8
申请日：2010-02-09
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛KLF7基因单核苷酸多态性的方法，以包含KLF7基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P1、P2、P3等摩尔比的混合物为引物，PCR扩增黄牛KLF7基因；用限制性内切酶TaqI消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛KLF7基因第41401、42025、42075位的单核苷酸多态性。本发明对KLF7基因的SNPs进行了基因分型和基因频率分析，以及与南阳牛不同生长阶段的生长性状之间进行了性状关联分析；结果表明：KLF7基因尤其是P2检测SNP位点可用作黄牛生长性状早期选择(6月龄和12月龄)的分子标记。
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公开(公告)号：CN101671725B
公开(公告)日：2011-12-28
申请号：CN200910024136.5
申请日：2009-09-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68 , G01N27/447
Abstract: 本发明公开了一种黄牛NPM1基因插入突变多态性的检测方法，包括以下步骤：1)以包含NPM1基因的待测黄牛基因组为模版，以引物P为引物进行PCR扩增；2)将PCR扩增后的片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳检测，200V电压电泳50～60min后EB染色；3)根据聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果对NPM1基因插入突变多态性进行分型。本发明提供一种与经济性状关联的黄牛NPM1基因多态性检测方法，针对NPM1基因编码区位点上存在的12bp的插入突变导致编码蛋白构象发生变化的基因多态性，通过设定特定引物PCR扩增后，根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果对其基因型分型，为检测中国地方黄牛NPM1基因遗传变异提供了技术支持。
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公开(公告)号：CN102206706A
公开(公告)日：2011-10-05
申请号：CN201110062694.8
申请日：2011-03-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛Dapper1基因单核苷酸多态性的方法，以包含Dapper1基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P(P1、P2、P3、P4)为引物，PCR扩增黄牛Dapper1基因；用限制性内切酶MspI、HindII、NcoI、HhaI分别消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳，根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛Dapper1基因第8344位、第8428位、第10513位、第10765位的单核苷酸多态性。本发明提供的检测方法为Dapper1基因的单核苷酸多态性与生长性状关系的建立奠定了基础，以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS)，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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