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公开(公告)号:CN111811939A
公开(公告)日:2020-10-23
申请号:CN202010714529.5
申请日:2020-07-21
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种超低温环境下的高精度纳米力学检测系统,包括低温系统单元,用于提供稳定的常压非真空低温清洁环境;壳体,置于罐体和低温液体的液面围成的上部空间中;探针,固定于壳体中,且探针上设有微悬臂;光学检测单元,包括激光光路单元和激光探测单元;处理单元,用于将电信号转变成微悬臂的偏折量;反馈与执行单元,包括压电陶瓷管,压电陶瓷管用于调节样品和探针之间的相对位移。本发明将系统保持在低温,利用冷阱作用,降低测量空间污染物,进而对材料或单分子进行稳定的超低温高精度力学测量,拓展了纳米力学测量的温度应用范围。
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公开(公告)号:CN107590798B
公开(公告)日:2020-09-29
申请号:CN201710642640.6
申请日:2017-07-31
Abstract: 本发明公开了一种生物组织三维图像背景去除系统和方法。该系统包括图像提供模块,用于提供目标生物组织的同一断面的多通道荧光图像;归一化处理模块,用于对多通道荧光图像进行窗口分割,并对窗口中的每个像素进行归一化处理;映射窗口计算模块,用于计算多通道一对映射窗口的Dif值;采样模块,用于根据Dif值选择采样点,并获得采样像素;以及结果计算模块,用于将采样模块的采样像素作为背景估计值进行插值,获得整张图像的背景估计值;其中,归一化处理模块与图像提供模块以及映射窗口计算模块连接,采样模块与映射窗口计算模块以及结果计算模块连接。本发明的系统,结构简单,运行速度快,效率高。
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公开(公告)号:CN108424844B
公开(公告)日:2020-07-28
申请号:CN201810307850.4
申请日:2018-04-08
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12M1/34 , C12M1/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种单分子测序芯片及其制备方法,所述芯片包括流道板、基板和盖板,所述流道板设置在基板和盖板之间;所述流道板上设置流通池,所述流通池包括多个平行设置的流道;所述流通池的上方设置盖板、流通池的下方设置基板;所述流道的底部与基板表面连通;与流道板接触的所述基板的表面固定测序引物和定位用荧光标记物。该芯片表面负载有荧光寿命长、荧光强度高,荧光性能稳定的量子点或荧光微球,可以在测序过程中对目标DNA单分子进行定位。由于量子点或荧光微球在经过很多次的激发光照后仍然能够保持较高的荧光强度,解决了定位荧光信号无法长时间保持的问题,显著提高单分子测序读长,降低测序的错误率,并有效降低测序成本。
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公开(公告)号:CN106199075A
公开(公告)日:2016-12-07
申请号:CN201610482237.7
申请日:2016-06-27
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01Q30/20
CPC classification number: G01Q30/20
Abstract: 本发明提出一种用于原子力显微镜表征的样品制备方法,包括下列步骤:步骤一:将大环分子样品溶解于第一溶剂中,形成均匀分散的大环分子单体溶液;步骤二:将基底放入第二溶剂饱和蒸汽环境,在基底表面加入一定量步骤一所配置大环分子单体溶液;步骤三:将带有上述溶液的基底在第二溶剂饱和蒸汽环境放置孵育一定时间,使大环分子在基底表面自组装形成紧密排列的纳米管单层;步骤四:将上述步骤三所得纳米管样品放置于真空中,使基底表面第一溶剂与第二溶剂充分挥发,使表面大环分子停止动态自组装过程。本发明提出的用于原子力显微镜表征的样品制备方法,具有可获得基底表面紧密排列纳米管单层,更加适用于原子力显微镜高分辨结构表征研究的特点。
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公开(公告)号:CN104292117B
公开(公告)日:2016-10-05
申请号:CN201410186697.6
申请日:2014-05-05
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07C217/08 , C07C217/12 , C07C217/10 , C07C213/02 , C07H19/10 , C07H19/14 , C07H1/00 , C08G65/48 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种酸敏感连接单元的合成及其在DNA测序中的用途。该酸敏感连接单元,结构式为:其中R为NH2或N3,m为0~44中任一整数,n为0~44中任一整数;R1,R2均为脂肪族烷基,或R1,R2均为芳香族衍生物,或R1为苯基、萘基、苯基的衍生物、或萘基的衍生物,R2为脂肪族烷基或氢;或R2为苯基、萘基、苯基的衍生物、或萘基的衍生物,R1为脂肪族烷基或氢,或R1、R2构成环己基、环戊基或环丁基。该酸敏感连接单元与核苷酸及荧光素连接得到的可逆终端可用于DNA合成测序。该类可逆终端可用于DNA测序;同时,其合成所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号:CN105535013A
公开(公告)日:2016-05-04
申请号:CN201610082951.7
申请日:2016-02-05
Applicant: 上海交通大学
IPC: A61K31/715 , A61K36/896 , A61K36/90 , C08B37/00 , A61P35/00
CPC classification number: A61K36/90 , A61K31/715 , A61K36/896 , A61K2236/331 , A61K2236/51 , A61K2236/53 , A61K2236/55 , C08B37/006
Abstract: 本发明公开了龙须菜多糖在制备用于诱导细胞中的FADD和GADD基因的表达的制剂中的应用。该龙须菜多糖制剂可以明显诱导肿瘤细胞的凋亡,对人胃癌、肺癌和小鼠黑色素瘤细胞都有诱导凋亡的作用。具体地,该龙须菜多糖制剂可以是凋亡诱导剂。本发明的龙须菜多糖制剂,在抗肿瘤药物或防癌保健品的制备中具有应用前景,也为治疗或预防肿瘤的药物开发提供了新的选择。
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公开(公告)号:CN104003902B
公开(公告)日:2016-05-04
申请号:CN201410203327.9
申请日:2014-05-14
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07C247/10 , C07H19/10 , C07H1/00 , C09K11/06 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种三氮烯连接单元的合成及其在DNA测序中的用途;该三氮烯连接单元结构式如下:其中-CH2OH和-CH2N3分别连接于三氮烯结构的邻位、对位或间位。该酸敏感的三氮烯连接单元与核苷酸及荧光素连接得到的可逆终端可用于DNA合成测序。与现有技术相比,本发明合成了一类新的酸敏感连接单元,并用于合成了基于这种连接单元的可逆终端;该类可逆终端可用于DNA合成测序;同时,其合成所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号:CN103819523B
公开(公告)日:2016-02-10
申请号:CN201410030095.1
申请日:2014-01-22
IPC: C07H19/167 , C07H1/00 , C07H19/173 , C07H19/20
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种7-去氮-7-卤素鸟嘌呤核苷的合成方法;所述方法包括如下步骤:式(III)化合物在碱性条件下去保护基得式(IV1)或(IV2)化合物;进一步去甲基得式(I)化合物,即所述7-去氮-7-卤素鸟嘌呤核苷;其中,R1为H或OH,R2为I、Br或Cl,R3为H或本发明合成的7-去氮-7-卤素-鸟嘌呤核苷是在DNA测序、标记、延伸等生物学领域广泛使用的基本原料,目前其销售价格很高,且合成方法复杂,难以控制;而本发明的合成方法所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号:CN105256003A
公开(公告)日:2016-01-20
申请号:CN201510582998.5
申请日:2015-09-14
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2525/101 , C12Q2563/107
Abstract: 本发明公开了一种基于酸敏感修饰核苷酸的DNA测序方法;所述方法包括:用式(I)所示的酸敏感修饰核苷酸为可逆终止剂,参与DNA链延伸反应以及对所述酸敏感修饰核苷酸中的酸敏感连接单元进行断裂;(I);其中,所述荧光素选自:BODIPY、罗丹明、香豆素、咕吨、花青、芘、酞菁、Alexa、squaring染料、产生能量转移染料,或其组合;所述Base表示选自如下碱基:U、T、C、A、G。与现有技术相比,本发明提供一种准确性高,特别是在模板为连续多个相同碱基时能够具有较高的延伸效率和剪切效率的延伸方法。
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公开(公告)号:CN103087131B
公开(公告)日:2015-07-08
申请号:CN201310015235.3
申请日:2013-01-15
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种可逆终端及其合成和在DNA合成测序中的用途。所述可逆终端的结构式如式(I)所示:其中R1为荧光素,R2为连接单元。本发明的可裂解该可逆终端可用于DNA合成测序;同时,本发明的可逆终端的合成所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用,并且生物学评价结果表明该类可逆终端能完全满足高通量测序的生化反应要求,具备较好的实用前景。
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