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公开(公告)号：CN103589716B
公开(公告)日：2015-11-11
申请号：CN201210296711.9
申请日：2012-08-17
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明公开了一种猪SNCG基因的一个可用于溯源的SNP分子标记及其检测方法。所述的SNP分子标记是通过DNA池(pool)测序获得的，共1599bp，其包含部分第三内含子序列，第986位碱基处有一个碱基突变986C-986T，其序列如SEQ ID NO.1所示。在包括11个猪品种或品系的试验群体中，分析该SNP分子标记在试验群体中等位基因的分布情况，发现该分子标记在不同的品种或品系中的等位基因频率接近，多态性丰富，品种或品系间等位基因频率分布差异小，并且杂合度都大于0.3，初步判定该SNP标记可用作猪肉产品DNA溯源。
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公开(公告)号：CN102276700B
公开(公告)日：2013-04-24
申请号：CN201110208356.0
申请日：2009-04-01
Applicant: 上海市农业科学院
IPC: C07K14/08 , G01N33/576 , A61K39/29 , A61P31/14
Abstract: 本发明公开了一种猪戊型肝炎病毒抗原表位及它的应用，所述猪戊型肝炎病毒抗原表位序列如SEQ ID No：8所示。通过计算机软件筛选和实验验证得到的猪戊肝病毒的抗原表位，一方面可以将其应用于快速特异猪戊肝诊断试剂盒，用于猪戊肝的快速诊断，特别是研制疫苗免疫抗体和自然隐性感染抗体的鉴别诊断技术用于猪戊肝流行的监控；另一方面也可以设计特异、安全和高效的猪戊肝疫苗用于猪戊肝的预防、控制猪戊肝的流行和阻断戊肝由猪向人传播。
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公开(公告)号：CN102978198A
公开(公告)日：2013-03-20
申请号：CN201210499673.7
申请日：2012-11-29
Applicant: 上海市农业科学院
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明涉及一种用于评价动物肠道微生物群落多样性的微生物基因组DNA间接提取方法。该方法在细胞裂解以前先对样品进行前处理，将微生物细胞从它们粪便样品中分离出来，避免了纯化步骤存在污染物去除困难和DNA回收率低的问题。本发明提取过程不使用酚、氯仿，减少了对实验人员的身体健康伤害。所提取的肠道微生物DNA的OD260/OD230及OD260/OD280接近标准值，可直接应用于分子操作，以评价动物肠道微生物群落多样性。
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公开(公告)号：CN101717771B
公开(公告)日：2012-05-02
申请号：CN200910200685.3
申请日：2009-12-24
Applicant: 上海市农业科学院
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明公开了一种用于评价植物根系微生物群落多样性的土壤DNA间接提取方法。利用细菌的平均密度远小于土壤矿物质的平均密度，在细胞裂解以前对样品进行前处理，将微生物细胞从它们土壤样品中分离出来，避免了纯化步骤存在腐殖质去除困难和DNA回收率低的问题。本发明提取过程不使用酚、氯仿，减少了对实验人员的身体健康伤害、所获DNA完整，分子片段大于10kb，产量高。所提取的土壤微生物DNA的OD260/OD230及OD260/OD280接近标准值，可直接应用于分子操作，以评价植物根系微生物群落多样件。
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公开(公告)号：CN101709298B
公开(公告)日：2012-05-02
申请号：CN200910201072.1
申请日：2009-12-14
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明公开了一种用于评价植物根系土壤微生物群落多样性的微生物基因组DNA提取方法，在细胞裂解以前对样品进行前处理，将胞外DNA及腐殖质进行去除，避免了纯化步骤存在腐殖质去除困难和DNA回收率低的问题。本发明提取过程不使用酚、氯仿，减少了对实验人员的身体健康伤害、所获DNA完整，分子片段大于10kb，产量高。所提取的土壤微生物DNA的OD260/OD230及OD260/OD280接近标准值，可直接应用于分子操作，以评价植物根系微生物群落多样性。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN102399775A
公开(公告)日：2012-04-04
申请号：CN201010282912.4
申请日：2010-09-16
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明涉及一种猪PSMA1基因中一个可用于溯源的SNP分子标记及其检测方法。所述的SNP分子标记是通过DNA池(pool)测序获得，其序列如SEQ ID NO 3所示，其编码的氨基酸序列如SEQ ID NO 4所示。所述的SNP分子标记位于序列如SEQ ID NO 1所示，其编码的氨基酸序列如SEQ ID NO2所示是猪PSMA1基因的DNA片段中。在包括9个猪品种/品系的试验群体中，分析本发明的SNP分子标记在试验群体中等位基因的分布情况，发现该分子标记在不同的品种或品系中的等位基因频率接近，多态性丰富，品种或品系间等位基因频率分布差异小，并且杂合度都大于0.3，由此初步判定本发明的SNP分子标记可用作猪肉产品的DNA溯源。
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公开(公告)号：CN102382900A
公开(公告)日：2012-03-21
申请号：CN201010271159.9
申请日：2010-08-31
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明公开了一种猪圆环病毒2型实时荧光定量PCR检测方法，包括以下步骤：1)首先设计并合成特异性引物和探针；2)目的片段的获得：配制PCR反应体系，按照PCR反应程序进行反应得到目的片段；3)配制连接反应液；4)转化并提取质粒模板；5)定性PCR检测；6)定量PCR检测。本发明的检测方法简单、快速、灵敏度高、特性性强、重复性好，并且检测的定量极限和检测极限极低，灵敏度高，可准确定量检测出猪圆环病毒2型，达到预防和控制猪圆环病毒2型流行的作用。
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公开(公告)号：CN102276700A
公开(公告)日：2011-12-14
申请号：CN201110208356.0
申请日：2009-04-01
Applicant: 上海市农业科学院
IPC: C07K14/08 , G01N33/576 , A61K39/29 , A61P31/14
Abstract: 本发明公开了一种猪戊型肝炎病毒抗原表位及它的应用，所述猪戊型肝炎病毒抗原表位序列如SEQ ID No：8所示。通过计算机软件筛选和实验验证得到的猪戊肝病毒的抗原表位，一方面可以将其应用于快速特异猪戊肝诊断试剂盒，用于猪戊肝的快速诊断，特别是研制疫苗免疫抗体和自然隐性感染抗体的鉴别诊断技术用于猪戊肝流行的监控；另一方面也可以设计特异、安全和高效的猪戊肝疫苗用于猪戊肝的预防、控制猪戊肝的流行和阻断戊肝由猪向人传播。
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公开(公告)号：CN102243222A
公开(公告)日：2011-11-16
申请号：CN201010173745.X
申请日：2010-05-13
Applicant: 上海市农业科学院
IPC: G01N33/00
Abstract: 本发明公开了一种入侵植物互花米草的空中凋落物的研究方法，分别采用凋落物袋法和原位分解法研究互花米草凋落物的分解动态，研究该两种方法在互花米草空中凋落物分解过程中是否具有差异性，进而比较这两种方法的凋落物分解速率，碳、氮元素以及木质素的变化差异。本发明通过采用不同方法对互花米草凋落物的研究，可以对湿地生态系统内凋落物的研究提供一些方法上的帮助，进一步从理论上阐明互花米草入侵对凋落物库的影响，有助于大家更加深入认识植物入侵如何影响生态系统功能和过程。
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公开(公告)号：CN102094038A
公开(公告)日：2011-06-15
申请号：CN201010578268.5
申请日：2010-12-08
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明公开了一种转基因水稻Bt蛋白crylc的原核表达及纯化方法，包括以下步骤：1)根据华中农业大学测序好的crylc的基因，以及所要连接的载体PMD18-T的多克隆位点设计正、反向引物，进行PCR扩增和回收，并对PCR回收物进行DNA连接反应；2)大肠杆菌感受态细胞DH5α的制备和转化；3)表达质粒的重组构建、重组菌的诱导表达；4)表达蛋白Ni-NTA亲和层析纯化。采用本发明方法得到的目的蛋白纯度达到90％以上，同时利用本发明制备的高纯度转基因水稻Bt蛋白crylc可获得抗体，并可制作成胶体金免疫层析试纸条，以便在转基因植物检测中快速、准确的检测出Bt基因。
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