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公开(公告)号：CN103601779A
公开(公告)日：2014-02-26
申请号：CN201310489397.0
申请日：2013-10-17
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/173 , C07H19/20 , C07H1/00
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种7-去氮-2’-脱氧-7-卤素取代鸟嘌呤核苷的合成方法；所述方法包括将下式(V)化合物在碱性条件下去甲基得到下式(I)化合物，即所述7-去氮-2’-脱氧-7-卤素取代鸟嘌呤核苷；(I)，(V)，其中R2为I、Br或Cl。本发明合成的7-去氮-7-碘-2’-脱氧鸟嘌呤核苷是在DNA测序、标记、延伸等生物学领域广泛使用的基本原料，目前其销售价格很高，且合成方法复杂；而本发明提供的合成方法所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN103588838A
公开(公告)日：2014-02-19
申请号：CN201310533070.9
申请日：2013-10-30
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/10 , C07H1/00 , C07H19/14 , C07H19/044 , C07C217/10 , C07C213/02 , C07C217/08 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种碱基修饰核苷酸的合成方法及其用途；所述方法包括将各种修饰核苷在磷酸化试剂的作用下，选择性地生成5′-核苷三磷酸；这些磷酸化试剂包括反应过程中原位生成的环状磷酸化试剂以及三氯氧磷和三丁基焦磷酸铵协同作用下的反应产物。本发明合成的碱基修饰核苷酸在DNA测序、标记、延伸等生物学领域广泛使用，目前其销售价格很高，合成方法复杂，反应选择性差，副反应多，不好分离纯化；而本发明提供的合成方法选择性好，副反应少，容易分离纯化，且所需实验条件易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN102937743A
公开(公告)日：2013-02-20
申请号：CN201210487879.8
申请日：2012-11-26
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种随机光学重建荧光显微镜及其实现方法，该显微镜包括载物台、电子耦合器件及紧挨载物台下方的物镜，其还包括：双滤光片层，设置于该载物台下方，包含两层电动转换的滤光片盒；活化光光源产生模块，产生活化光，产生的活化光经扩束、聚焦后，经双滤光片层的一层电动滤光片盒的二向色镜及物镜后照在载物台的样品表面照明；以及激发光光源产生模块，其产生的激发光，经过扩束聚焦后，经双滤光片层的另一电动滤光片盒的二向色镜及物镜后照在载物台的样品表面照明，本发明可以使得传统荧光显微镜的分辨率从光学衍射极限(200nm)提高到纳米尺度(20-50nm)，且实现的成本远低于目前的商业化超高分辨率显微镜产品。
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公开(公告)号：CN102675262A
公开(公告)日：2012-09-19
申请号：CN201210132695.X
申请日：2012-04-28
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07D307/20 , C08G65/48 , C12Q1/68
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了四氢呋喃醚衍生物可裂解连接单元及其用途；本发明的可裂解连接单元，结构式如下式所示：，其中，n为0～44中的任意一个整数。本发明的四氢呋喃环衍生物中，无论是顺式、反式或二者的混合物都可用于测序，并具有相同的作用；该类化合物合成原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，易于实现大量合成；该类化合物可与核苷酸和荧光素实现高效率的连接；通过研究该类化合物的裂解性能，发现该类化合物在温和的条件下可以实现高效率的裂解，具有应用于DNA测序的价值。
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公开(公告)号：CN118726540A
公开(公告)日：2024-10-01
申请号：CN202410826734.9
申请日：2024-06-25
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6806 , C40B50/06 , G01N1/30
Abstract: 本发明属于生物技术领域，具体公开了一种高通量染色质结构定向捕获并分析的方法。这是一种在组织切片上获取具有原位空间信息和表型定义的高通量染色体构象捕获(Hi‑C)方法。通过对组织切片预先进行固定、破膜、多步酶反应等关键步骤，然后应用激光显微切割技术获取免疫染色或其它标记的特定细胞，实现了具有原位空间定位的微量细胞高效Hi‑C文库构建，据此测序并分析可以得到其染色体的高分辨空间结构。本发明使Hi‑C技术可以广泛应用于组织原位的空间基因组学研究，在基础研究和临床研究都有广泛的应用价值。本发明制备的文库质量稳定，基因组覆盖率高，并且可用于少量细胞的染色体构象研究。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110887825B
公开(公告)日：2023-03-17
申请号：CN201911260222.6
申请日：2019-12-10
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供了一种基于可控磁场的生物力学参数测量方法，包括下列步骤：磁性物体与生物样品接触；通过磁场对多个磁性物体同时产生作用力，磁性物体受到磁场作用，对作为生物样品产生作用力；检测记录磁性物体的运动轨迹；通过分析磁性物体所受磁场力与其运动轨迹的关系，获得作为测量对象的生物样品有关的力学参数的表征。在本发明提供的基于可控磁场的生物力学参数测量方法中，磁场源产生磁场对磁性物体产生作用力，磁性物质受力对生物样品产生形变，通过测试磁性物体的运动轨迹，从而获得生物样品的形变，最终获得生物样品的受力的力学参数。
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公开(公告)号：CN112390839B
公开(公告)日：2022-02-25
申请号：CN202011286386.9
申请日：2020-11-17
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/073 , C07H1/00 , C12Q1/6869
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公开(公告)号：CN108192957B
公开(公告)日：2021-11-23
申请号：CN201711279201.X
申请日：2017-12-06
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6869 , C12M1/36 , C12M1/34
Abstract: 本发明公开了一种DNA合成测序方法和测序系统，所述方法包括：通过水溶性双功能连接单元将引物P1连接于基体表面；在基体表面加入含待测DNA模板的溶液，然后进行等温表面放大反应；再将引物Pe加入基体表面，然后在基体表面加入四种碱基的荧光标记可逆终止剂的延伸反应溶液，进行延伸反应；然后对延伸后的DNA双链进行成像之后，加入相应的化学试剂，使荧光标记可逆终止剂的连接单元断裂。重复DNA链延伸和断裂步骤，完成多次循环测序，即得待测DNA模板核苷酸的碱基序列。本发明测序方法可用于DNA高通量合成测序，在所述测序条件下实验结果其读长至少为73碱基；如果双端测序，其读长至少为146，准确率至少为99.98％。
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公开(公告)号：CN113322314A
公开(公告)日：2021-08-31
申请号：CN202110626124.0
申请日：2021-06-04
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6869 , G01N1/30 , G01N1/28 , G01N1/42
Abstract: 本发明提供了一种单细胞空间转录组分析方法。具体地，本发明提供了一种可以检测非解离状态的单细胞空间转录组。本发明的方法可以在保有组织中细胞空间位置信息的基础上，高通量地收集单细胞，通过二代高通量测序，获得高灵敏度、高重复性和可定量化的细胞转录组数据，并基于每个目标细胞的三维坐标值，将每个目标细胞的单细胞空间转录组测序数据映射于组织样品的对应空间上，从而获得组织样品的单细胞空间转录组测序数据集。本发明的方法可广泛应用于正常和疾病组织的单细胞基因表达定量研究，为组织中细胞状态和功能研究提供更高效和准确的工具。
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公开(公告)号：CN113189071A
公开(公告)日：2021-07-30
申请号：CN202110477789.X
申请日：2021-04-29
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N21/64
Abstract: 本发明提供了一种用于完整器官血管三维网络精准成像的试剂盒及成像方法。具体地，包括：(A)抗凝血剂；(B)去血剂，所述去血剂包括抗凝血剂和血管扩张剂；(C)血管标记物，所述血管标记物包括荧光微球；(D)组织固定剂；和(E)荧光微球稀释液，其中所述荧光微球稀释液包括肝素钠和碳化二亚胺(EDAC)。本发明的试剂盒可实现实验动物或其组织器官的快速、完整、稳定的血管标记。
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