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公开(公告)号：CN103601779A
公开(公告)日：2014-02-26
申请号：CN201310489397.0
申请日：2013-10-17
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/173 , C07H19/20 , C07H1/00
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种7-去氮-2’-脱氧-7-卤素取代鸟嘌呤核苷的合成方法；所述方法包括将下式(V)化合物在碱性条件下去甲基得到下式(I)化合物，即所述7-去氮-2’-脱氧-7-卤素取代鸟嘌呤核苷；(I)，(V)，其中R2为I、Br或Cl。本发明合成的7-去氮-7-碘-2’-脱氧鸟嘌呤核苷是在DNA测序、标记、延伸等生物学领域广泛使用的基本原料，目前其销售价格很高，且合成方法复杂；而本发明提供的合成方法所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN103588838A
公开(公告)日：2014-02-19
申请号：CN201310533070.9
申请日：2013-10-30
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/10 , C07H1/00 , C07H19/14 , C07H19/044 , C07C217/10 , C07C213/02 , C07C217/08 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种碱基修饰核苷酸的合成方法及其用途；所述方法包括将各种修饰核苷在磷酸化试剂的作用下，选择性地生成5′-核苷三磷酸；这些磷酸化试剂包括反应过程中原位生成的环状磷酸化试剂以及三氯氧磷和三丁基焦磷酸铵协同作用下的反应产物。本发明合成的碱基修饰核苷酸在DNA测序、标记、延伸等生物学领域广泛使用，目前其销售价格很高，合成方法复杂，反应选择性差，副反应多，不好分离纯化；而本发明提供的合成方法选择性好，副反应少，容易分离纯化，且所需实验条件易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN103396556A
公开(公告)日：2013-11-20
申请号：CN201310317966.3
申请日：2013-07-25
Applicant: 上海交通大学 , 上海其胜生物制剂有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于壳聚糖的两亲性嵌段共聚物及其合成方法。所述共聚物的结构式如式(I)所示：其中，m、n为满足0≤m+n≤32且n/(m+n+1)≤15％的任一整数。本发明在壳聚糖、PLA、PCL、月桂酸及硬脂酸上分别引入具有氢键序列特异性作用的分子胶，合成了一系列基于壳聚糖的嵌段共聚物，产物经1H-NMR、GPC等表征。该类化合物合成原料简单易得，合成过程均为常规反应，各步反应技术均已成熟；本发明制备的两亲性嵌段共聚物含有双重二硫键，具有还原敏感性，可用于制备还原敏感性的自组装药物运输胶束。
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公开(公告)号：CN102675262A
公开(公告)日：2012-09-19
申请号：CN201210132695.X
申请日：2012-04-28
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07D307/20 , C08G65/48 , C12Q1/68
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了四氢呋喃醚衍生物可裂解连接单元及其用途；本发明的可裂解连接单元，结构式如下式所示：，其中，n为0～44中的任意一个整数。本发明的四氢呋喃环衍生物中，无论是顺式、反式或二者的混合物都可用于测序，并具有相同的作用；该类化合物合成原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，易于实现大量合成；该类化合物可与核苷酸和荧光素实现高效率的连接；通过研究该类化合物的裂解性能，发现该类化合物在温和的条件下可以实现高效率的裂解，具有应用于DNA测序的价值。
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公开(公告)号：CN112390839B
公开(公告)日：2022-02-25
申请号：CN202011286386.9
申请日：2020-11-17
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/073 , C07H1/00 , C12Q1/6869
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN108192957B
公开(公告)日：2021-11-23
申请号：CN201711279201.X
申请日：2017-12-06
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6869 , C12M1/36 , C12M1/34
Abstract: 本发明公开了一种DNA合成测序方法和测序系统，所述方法包括：通过水溶性双功能连接单元将引物P1连接于基体表面；在基体表面加入含待测DNA模板的溶液，然后进行等温表面放大反应；再将引物Pe加入基体表面，然后在基体表面加入四种碱基的荧光标记可逆终止剂的延伸反应溶液，进行延伸反应；然后对延伸后的DNA双链进行成像之后，加入相应的化学试剂，使荧光标记可逆终止剂的连接单元断裂。重复DNA链延伸和断裂步骤，完成多次循环测序，即得待测DNA模板核苷酸的碱基序列。本发明测序方法可用于DNA高通量合成测序，在所述测序条件下实验结果其读长至少为73碱基；如果双端测序，其读长至少为146，准确率至少为99.98％。
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公开(公告)号：CN108424844B
公开(公告)日：2020-07-28
申请号：CN201810307850.4
申请日：2018-04-08
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12M1/34 , C12M1/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种单分子测序芯片及其制备方法，所述芯片包括流道板、基板和盖板，所述流道板设置在基板和盖板之间；所述流道板上设置流通池，所述流通池包括多个平行设置的流道；所述流通池的上方设置盖板、流通池的下方设置基板；所述流道的底部与基板表面连通；与流道板接触的所述基板的表面固定测序引物和定位用荧光标记物。该芯片表面负载有荧光寿命长、荧光强度高，荧光性能稳定的量子点或荧光微球，可以在测序过程中对目标DNA单分子进行定位。由于量子点或荧光微球在经过很多次的激发光照后仍然能够保持较高的荧光强度，解决了定位荧光信号无法长时间保持的问题，显著提高单分子测序读长，降低测序的错误率，并有效降低测序成本。
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公开(公告)号：CN104292117B
公开(公告)日：2016-10-05
申请号：CN201410186697.6
申请日：2014-05-05
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07C217/08 , C07C217/12 , C07C217/10 , C07C213/02 , C07H19/10 , C07H19/14 , C07H1/00 , C08G65/48 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种酸敏感连接单元的合成及其在DNA测序中的用途。该酸敏感连接单元，结构式为：其中R为NH2或N3，m为0～44中任一整数，n为0～44中任一整数；R1，R2均为脂肪族烷基，或R1，R2均为芳香族衍生物，或R1为苯基、萘基、苯基的衍生物、或萘基的衍生物，R2为脂肪族烷基或氢；或R2为苯基、萘基、苯基的衍生物、或萘基的衍生物，R1为脂肪族烷基或氢，或R1、R2构成环己基、环戊基或环丁基。该酸敏感连接单元与核苷酸及荧光素连接得到的可逆终端可用于DNA合成测序。该类可逆终端可用于DNA测序；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN104003902B
公开(公告)日：2016-05-04
申请号：CN201410203327.9
申请日：2014-05-14
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07C247/10 , C07H19/10 , C07H1/00 , C09K11/06 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种三氮烯连接单元的合成及其在DNA测序中的用途；该三氮烯连接单元结构式如下：其中-CH2OH和-CH2N3分别连接于三氮烯结构的邻位、对位或间位。该酸敏感的三氮烯连接单元与核苷酸及荧光素连接得到的可逆终端可用于DNA合成测序。与现有技术相比，本发明合成了一类新的酸敏感连接单元，并用于合成了基于这种连接单元的可逆终端；该类可逆终端可用于DNA合成测序；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN103819523B
公开(公告)日：2016-02-10
申请号：CN201410030095.1
申请日：2014-01-22
IPC: C07H19/167 , C07H1/00 , C07H19/173 , C07H19/20
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种7-去氮-7-卤素鸟嘌呤核苷的合成方法；所述方法包括如下步骤：式(III)化合物在碱性条件下去保护基得式(IV1)或(IV2)化合物；进一步去甲基得式(I)化合物，即所述7-去氮-7-卤素鸟嘌呤核苷；其中，R1为H或OH，R2为I、Br或Cl，R3为H或本发明合成的7-去氮-7-卤素-鸟嘌呤核苷是在DNA测序、标记、延伸等生物学领域广泛使用的基本原料，目前其销售价格很高，且合成方法复杂，难以控制；而本发明的合成方法所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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