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公开(公告)号：CN109825559A
公开(公告)日：2019-05-31
申请号：CN201910180935.5
申请日：2019-03-11
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种血浆cfDNA全局性甲基化检测方法及应用，涉及生物检测技术领域，其中，所述血浆cfDNA全局性甲基化检测方法为在从血浆中提取出的少量cfDNA中补加甲基化且含有生物素标记的外源DNA(λDNA)，然后进行富集甲基化实验，将收集的产物通过PCR扩增后，再基于生物素-链霉亲和素反应、采用链霉亲和素磁珠去除带有生物素标记的λDNA，得到cfDNA扩增文库，并进行高通量测序。本发明适用于少量的血浆cfDNA甲基化分析，无需特定地商品化试剂盒，操作简便高效，减少了样品的损失、提高了建库效率、且极大地提高了MeDIP等富集甲基化实验方法地检测灵敏性，具有较广泛的适用性。
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公开(公告)号：CN109097439A
公开(公告)日：2018-12-28
申请号：CN201811024725.9
申请日：2018-09-04
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6804
Abstract: 本发明提供了一种检测少量样品全基因组DNA甲基化的方法。具体地，本发明的方法包括步骤：(a)提供DNA片段；(b)在所述DNA片段两端添加接头；(c)向所述末端带有接头的DNA中加入辅助核酸片段，形成第一混合物；(d)将所述第一混合物进行热变性，使双链DNA成为单链DNA，形成第二混合物；(e)用特异性抗体对所述第二混合物中甲基化的核酸片段进行捕获；(f)用特异性引物对被捕获的核酸片段进行扩增，从而获得含有甲基化的核酸片段的扩增产物。本发明的方法适用于极少量来源样品的甲基化核酸测序分析，而且成本较低，具有很高的普遍适用性。
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公开(公告)号：CN109023537A
公开(公告)日：2018-12-18
申请号：CN201811025369.2
申请日：2018-09-04
Applicant: 上海交通大学
IPC: C40B50/06
CPC classification number: C40B50/06
Abstract: 本发明提供了一种微量DNA样品高通量测序文库的构建技术。具体地，本发明方法包括步骤：(a)提供DNA片段和辅助核酸片段；(b)向DNA片段和辅助核酸片段两端添加接头；(c)用特异性抗体捕获、富集末端带有接头的DNA片段和辅助核酸片段；(d)用特异性酶去除所述辅助核酸片段；(e)用特异性引物对所述步骤(c)中捕获、富集的DNA片段和辅助核酸片段进行扩增，从而获得扩增产物。本发明方法更适用于少量来源的微量样品的文库构建；文库质量好，无污染；成本较低，具有较高的普遍适用性。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN105902561A
公开(公告)日：2016-08-31
申请号：CN201610378853.8
申请日：2016-05-31
Applicant: 上海交通大学
IPC: A61K31/715 , A61K36/04 , A61P35/00 , A61K31/337 , A61K31/513 , A61K33/24 , A61K31/519
CPC classification number: A61K31/715 , A61K31/337 , A61K31/513 , A61K31/519 , A61K33/24 , A61K36/04 , A61K2300/00
Abstract: 本发明提供了一种龙须菜多糖的应用以及含有龙须菜多糖的抗肿瘤药物，该应用为龙须菜多糖作为增效剂在抗肿瘤药物制备中的应用，该抗肿瘤药物包含有龙须菜多糖增效剂、抗肿瘤活性成分以及药学上可接受的辅料。本发明首次发现海藻龙须菜多糖与化疗药紫杉醇、氟尿嘧啶、甲氨蝶呤和顺铂等联合使用可以增加化疗药治疗肿瘤的效果。龙须菜多糖与化疗药联用对于多个不同组织来源的肿瘤细胞具有抑制肿瘤增殖和活性的作用，包括肺癌、胃癌和宫颈癌等，龙须菜多糖对化疗药的增效作用呈剂量依赖性，且龙须菜多糖体外细胞实验中工作浓度未见毒性，具有药源丰富、安全无毒的特征，可开发为用于抗肿瘤化疗药增效剂的抗肿瘤药物或预防保健品，具有临床应用前景。
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公开(公告)号：CN103804447B
公开(公告)日：2016-08-17
申请号：CN201410055242.0
申请日：2014-02-18
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/167 , C07H19/173 , C07H19/20 , C07H1/00 , C07H1/04 , C09K11/06 , C12Q1/68
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种氮杂化鸟嘌呤核苷及其合成方法和在DNA测序中的用途；所述合成方法包括如下步骤：式(Ⅲ)化合物在碱性条件下去保护基得式(Ⅱ)化合物；进一步去甲基得式(Ⅰ)化合物，即7?去氮?7?卤素?8?氮?鸟嘌呤核苷；其中，R1为H或OH，R2为I、Br或Cl，R3为H或本发明的氮杂化鸟嘌呤核苷是用于DNA测序的新型试剂，与8位未取代氮的鸟嘌呤核苷相比，具有更好的碱基识别效果、更稳定的DNA链结构。同时，现有技术中8位氮取代鸟嘌呤核苷的合成方法复杂，产率低，尚未商业化生产，而本发明的合成方法所需原料简单易得，采用常规化学合成反应，且收率较高，适用于广泛推广使用。
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公开(公告)号：CN103601779B
公开(公告)日：2016-05-04
申请号：CN201310489397.0
申请日：2013-10-17
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/173 , C07H19/20 , C07H1/00
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种7-去氮-2’-脱氧-7-卤素取代鸟嘌呤核苷的合成方法；所述方法包括将下式(V)化合物在碱性条件下去甲基得到下式(I)化合物，即所述7-去氮-2’-脱氧-7-卤素取代鸟嘌呤核苷；(I)，(V)，其中R2为I、Br或Cl。本发明合成的7-去氮-7-碘-2’-脱氧鸟嘌呤核苷是在DNA测序、标记、延伸等生物学领域广泛使用的基本原料，目前其销售价格很高，且合成方法复杂；而本发明提供的合成方法所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN103484106B
公开(公告)日：2015-08-19
申请号：CN201310401580.0
申请日：2013-09-05
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种四色荧光标记可逆终端及其在DNA测序中的用途；所述可逆终端的结构式如式(I)所示：(I)；其中，R1为三磷酸盐；R2为H或者OH；碱基为U，C，A，G或其衍生物；连接单元为在温和条件下可以断裂的双官能团化合物；荧光基团选自BODIPY、荧光素、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、alexa、squarene染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种。本发明的可逆终端可用于DNA单分子测序；同时，本发明的可逆终端的合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用，并且生物学评价结果表明该类可逆终端能完全满足高通量测序的生化反应要求，具备很好的实用前景。
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公开(公告)号：CN104292117A
公开(公告)日：2015-01-21
申请号：CN201410186697.6
申请日：2014-05-05
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07C217/08 , C07C217/12 , C07C217/10 , C07C213/02 , C07H19/10 , C07H19/14 , C07H1/00 , C08G65/48 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种酸敏感连接单元的合成及其在DNA测序中的用途。该酸敏感连接单元，结构式为：其中R为NH2或N3，m为0～44中任一整数，n为0～44中任一整数；R1，R2均为脂肪族烷基，或R1，R2均为芳香族衍生物，或R1为苯基、萘基、苯基的衍生物、或萘基的衍生物，R2为脂肪族烷基或氢；或R2为苯基、萘基、苯基的衍生物、或萘基的衍生物，R1为脂肪族烷基或氢，或R1、R2构成环己基、环戊基或环丁基。该酸敏感连接单元与核苷酸及荧光素连接得到的可逆终端可用于DNA合成测序。该类可逆终端可用于DNA测序；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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