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公开(公告)号：CN115287353B
公开(公告)日：2023-10-27
申请号：CN202210745197.6
申请日：2022-06-24
Applicant: 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , G16B20/30 , G06F18/241 , G06F18/214
Abstract: 本发明涉及一种肝癌血浆游离DNA来源的甲基化标志物及用途，属于分子生物医学技术领域。本研究通过肝癌血浆cfDNA来研究肝癌和健康人的甲基化差异，并筛选出具有明显差异的甲基化区域，然后通过随机森林的方法，首次筛选出10个最佳的差异性甲基化区域(Differentially Methylated Region，DMR)建立肝癌甲基化风险预测模型，适用于预测早期肝癌发生的风险评估，适用于肝癌的筛查与诊断，用于筛查肝癌人群。
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公开(公告)号：CN115678999A
公开(公告)日：2023-02-03
申请号：CN202211718841.7
申请日：2022-12-30
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , G16B20/50 , G16B30/10 , G16H50/30
Abstract: 本发明公开了一种基因标志物在非小细胞肺癌复发预测中的应用、微小残留病灶的检测方法和预测装置,属于分子生物医学技术领域，通过对血浆样本cfDNA进行液体活检全基因组WGS低深度测序，通过对非小细胞肺癌癌细胞切除术后病人在术后的血液样本进行低通量测序，利用测序结果中的DNA碎片化片段长短比例，进行正则化比例风险模型（Regularized Cox Regression）构建，检测术后病人在术后肿瘤微小残留病灶（minimal residual disease,MRD），实现对非小细胞肺癌切除术后复发风险的早期无创精准预测，对术后辅助治疗提供指导性作用。
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公开(公告)号：CN115595372A
公开(公告)日：2023-01-13
申请号：CN202211619587.5
申请日：2022-12-16
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司(CN) , 南京世和医疗器械有限公司(CN)
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明涉及一种血浆游离DNA来源的甲基化检测方法、肺癌诊断标志物以及试剂盒，属于基因检测技术领域。使用一种优化的MBD‑seq技术，通过对低进入量的肺癌血浆cfDNA进行MBD蛋白甲基化富集，将富集到的高甲基化DNA构建文库进行酶促法转化，并进行甲基化测序。这种优化的MBD富集的方法在富集甲基化DNA和检测灵敏度、准确度方面都高于原始MBD‑seq方法，减少了非特异性DNA富集，同时，使用较低进入量的cfDNA，节省样本材料，提高灵敏度。本发明还提供了一种由上述检测方法进行分析得到的甲基化诊断标志物，由20个DMR区域构成，具有较好的检测准确性。
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公开(公告)号：CN113373524B
公开(公告)日：2022-10-25
申请号：CN202110458794.6
申请日：2021-04-27
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C40B70/00 , C40B80/00 , C40B40/06 , C12Q1/6869 , G16B30/00
Abstract: 本发明公开一种利用NGS技术检测血浆ctDNA超低频突变的测序方法及分子标签接头。标签接头包括含有11个碱基的样本标签和含有4个碱基的单分子及双链DNA共用标签序列。样本标签实现了超过300种i7/i5“双端唯一”index组合，分子标签可同时用作单分子和双链分子index。采用本发明提供的标签接头，可以有效去除文库富集过程中DNA氧化应激损伤、PCR扩增以及测序引入的随机错误突变；同时能够有效识别发生“标签跳跃”的分子，避免因标签跳跃造成样本间交叉污染引入的假性突变。本发明在保证100%特异性的前提下实现了检测灵敏度的大力提升，ctDNA中丰度0.1%突变的检测敏感性达到95%以上。
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公开(公告)号：CN114561473B
公开(公告)日：2022-08-12
申请号：CN202210455413.3
申请日：2022-04-28
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种PML‑RARA融合基因突变的检测方法，本发明中通过下一代测序技术（NGS）方法能够准确地检测出PML和RARA的融合基因发生的变化情况，本发明的方法能够同步检测基因突变、缺失、增加、和颠换等多种基因变异类型，全面指导临床急性早幼粒细胞白血病（acute promyelocytic leukemia,APL）的诊断，指导后续砷剂或全反式维甲酸（ATRA）治疗和耐药选择。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN114736968A
公开(公告)日：2022-07-12
申请号：CN202210665014.X
申请日：2022-06-13
Applicant: 南京世和医疗器械有限公司
Abstract: 本发明涉及血浆游离DNA甲基化标志物在肺癌早筛中的用途以及肺癌早筛装置，属于基因诊断技术领域。本研究通过肺癌血浆cfDNA来研究肺癌和健康人的甲基化差异，并筛选出具有明显差异的甲基化区域，然后通过广义线性模型的方法，首次筛选出29个最佳的差异性甲基化区域(Differentially Methylated Region，DMR)并建立肺癌甲基化风险预测模型，适用于对早期肺癌进行风险预测评估，适用于高危人群肺癌的筛查与诊断。
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公开(公告)号：CN113403395A
公开(公告)日：2021-09-17
申请号：CN202110620700.0
申请日：2021-06-03
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明涉及使用房水cfDNA进行基因检测来辅助临床诊断，属于基因检测技术领域。本发明发现利用房水中的cfDNA进行检测，并比对于参考基因组上，获得的突变信息能够有效地对原发性玻璃体视网膜淋巴瘤(PVRL)进行诊断，检测结果显著优于从血浆中对cfDNA的检测准确性，能够实现早期诊断。
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公开(公告)号：CN113355421A
公开(公告)日：2021-09-07
申请号：CN202110753782.6
申请日：2021-07-03
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , G16B20/30 , G16B40/00 , G16B30/10
Abstract: 本发明涉及肺癌早筛标志物、检测方法、检测装置以及计算机可读取介质，本发明提对血浆样本cfDNA进行WGS低深度测序，通过对高通量测序结果进行肺癌健康人差异DNA片段末端断点处序列8mer(Motif end8mer)分析，构建模型，实现了对肺癌无创精准诊断的目的。
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公开(公告)号：CN111424084A
公开(公告)日：2020-07-17
申请号：CN202010180494.1
申请日：2020-03-16
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , C12M1/34
Abstract: 本发明涉及一种bTMB标记物、检测试剂盒以及用途，属于医学分子生物学技术领域。本发明验证了Panel估算的bTMB作为生物标志物的临床实用性，可用于鉴定对免疫疗法有响应的患者。另一方面，研究发现了ctDNA MSAF是预测免疫治疗疗效的一个新型生物标志物。重要的是，低ctDNA释放与PFS获益显著相关，且MSAF和bTMB的综合分析可大大增强潜在应答者的富集度。研究结果基于液体活检血液ctDNA作为癌症免疫治疗分子标志物的来源的层面具有重要的临床意义和实用性。
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公开(公告)号：CN109880910A
公开(公告)日：2019-06-14
申请号：CN201910338312.6
申请日：2019-04-25
Applicant: 南京世和基因生物技术有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种基于Panel测序检测肿瘤突变负荷(TMB)的位点组合、处理流程及计算方法，属于生物医学技术领域。本发明提供的肿瘤突变负荷的检测方法，对目标检测区域中的具体位点进行了优化：排除了中国人群中肿瘤发生发展相关高频突变位点，纳入了同义突变，使得基于Panel和全外显子测序的TMB结果高度一致，并在真实世界中有比较理想的临床预测效果。
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