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公开(公告)号：CN108192957A
公开(公告)日：2018-06-22
申请号：CN201711279201.X
申请日：2017-12-06
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6869 , C12M1/36 , C12M1/34
Abstract: 本发明公开了一种DNA合成测序方法和测序系统，所述方法包括：通过水溶性双功能连接单元将引物P1连接于基体表面；在基体表面加入含待测DNA模板的溶液，然后进行等温表面放大反应；再将引物Pe加入基体表面，然后在基体表面加入四种碱基的荧光标记可逆终止剂的延伸反应溶液，进行延伸反应；然后对延伸后的DNA双链进行成像之后，加入相应的化学试剂，使荧光标记可逆终止剂的连接单元断裂。重复DNA链延伸和断裂步骤，完成多次循环测序，即得待测DNA模板核苷酸的碱基序列。本发明测序方法可用于DNA高通量合成测序，在所述测序条件下实验结果其读长至少为73碱基；如果双端测序，其读长至少为146，准确率至少为99.98％。
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公开(公告)号：CN104031268B
公开(公告)日：2017-01-11
申请号：CN201410196559.6
申请日：2014-05-09
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种聚乙烯亚胺三嵌段共聚物及其在基因载体中的用途；所述共聚物PEI-PLA-PEG的结构式如下所示：其中，PEG的分子量为2000～10000g/mol中的任意一个整数，PLA的分子量为3000～10000g/mol，PEI的分子量为1800～10000g/mol。该嵌段共聚物可以自组装成纳米胶束作为基因载体应用于基因药物输送体系，在负载基因药物的同时还可以包裹疏水小分子药物，从而成为基因/疏水药物的双重载体。
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公开(公告)号：CN103709410B
公开(公告)日：2016-04-13
申请号：CN201310643667.9
申请日：2013-12-03
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种酸敏感两亲性嵌段共聚物及其自组织胶束、用途；其结构式为式(I)所示：其中，n为1～300中的任意一个整数，m为1～100中的任意一个整数，R为式(II)、(III)、(IV)、(V)或(VI)所示的结构：其中，t＝1或2。本发明化合物合成原料简单易得，合成过程均为常规反应，反应条件温和，可以大量制备；由该类嵌段共聚物自组装而成的胶束可用于药物运输载体。
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公开(公告)号：CN105254899A
公开(公告)日：2016-01-20
申请号：CN201510666681.X
申请日：2015-10-15
Applicant: 上海交通大学
IPC: C08G81/00
Abstract: 本发明提供了一种基于分子胶的PLA-PEG两亲性多嵌段共聚物，其结构如式I所示：其中，n为2～200之间的任意整数，m为2～150之间的任意整数，t为1或2。所述的基于分子胶的PLA-PEG两亲性多嵌段共聚物的制备方法包括如下步骤：分别制备亲水片段化合物S3-PEG-S3和疏水片段化合物Z1-PLA-Z1将所述亲水片段化合物S3-PEG-S3和疏水片段化合物Z1-PLA-Z1进行氧化反应，得到所述PLA-PEG两亲性多嵌段共聚物本发明具有如下的有益效果：使用凝胶色谱技术对该多嵌段共聚物进行分析表征，通过合成基于分子胶的两亲性多嵌段共聚物的表征的对照组共聚物，有效准确地计算每个嵌段在该共聚物中的百分含量。
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公开(公告)号：CN102675262B
公开(公告)日：2016-01-13
申请号：CN201210132695.X
申请日：2012-04-28
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07D307/20 , C08G65/48 , C12Q1/68
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了四氢呋喃醚衍生物可裂解连接单元及其用途；本发明的可裂解连接单元，结构式如下式所示：，其中，n为0～44中的任意一个整数。本发明的四氢呋喃环衍生物中，无论是顺式、反式或二者的混合物都可用于测序，并具有相同的作用；该类化合物合成原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，易于实现大量合成；该类化合物可与核苷酸和荧光素实现高效率的连接；通过研究该类化合物的裂解性能，发现该类化合物在温和的条件下可以实现高效率的裂解，具有应用于DNA测序的价值。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN104725453A
公开(公告)日：2015-06-24
申请号：CN201510031230.9
申请日：2015-01-21
Applicant: 上海交通大学
CPC classification number: C07H19/10 , C07C247/10 , C07H1/00 , C12Q1/6869 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明提供了一种基于偶氮连接单元的荧光标记核苷酸及其用途，其结构式如式VI所示：其中，荧光素选自BODIPY、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、Alexa、Squaring染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种；R1、R2、R3、R4、R6为各种取代基，R5为除-C2H5以外的取代基、且R1、R2、R3、R4、R5、R6不同时为H；n为0～10的整数。与现有技术相比，本发明合成了一类新的基于偶氮连接单元的可逆终端；该类可逆终端在温和的条件下可以实现高效率的剪切，可用于DNA测序；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN103539697A
公开(公告)日：2014-01-29
申请号：CN201310462509.3
申请日：2013-09-30
IPC: C07C245/08 , C07H19/10 , C07H1/00 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种还原敏感偶氮连接单元的合成及其在DNA测序中的用途；该还原敏感偶氮连接单元结构式如下：其中m为0～44中任一整数，n为0～44中任一整数。该还原敏感偶氮连接单元与核苷酸及荧光素连接得到可逆终端，所述可逆终端用于DNA合成测序。与现有技术相比，本发明合成了一类新的可裂解连接单元，并用于合成了基于这种连接单元的可逆终端；该类可逆终端在温和的条件下可以实现高效率的裂解，可用于DNA合成测序；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN112390839B
公开(公告)日：2022-02-25
申请号：CN202011286386.9
申请日：2020-11-17
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/073 , C07H1/00 , C12Q1/6869
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公开(公告)号：CN108192957B
公开(公告)日：2021-11-23
申请号：CN201711279201.X
申请日：2017-12-06
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6869 , C12M1/36 , C12M1/34
Abstract: 本发明公开了一种DNA合成测序方法和测序系统，所述方法包括：通过水溶性双功能连接单元将引物P1连接于基体表面；在基体表面加入含待测DNA模板的溶液，然后进行等温表面放大反应；再将引物Pe加入基体表面，然后在基体表面加入四种碱基的荧光标记可逆终止剂的延伸反应溶液，进行延伸反应；然后对延伸后的DNA双链进行成像之后，加入相应的化学试剂，使荧光标记可逆终止剂的连接单元断裂。重复DNA链延伸和断裂步骤，完成多次循环测序，即得待测DNA模板核苷酸的碱基序列。本发明测序方法可用于DNA高通量合成测序，在所述测序条件下实验结果其读长至少为73碱基；如果双端测序，其读长至少为146，准确率至少为99.98％。
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公开(公告)号：CN108424844B
公开(公告)日：2020-07-28
申请号：CN201810307850.4
申请日：2018-04-08
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12M1/34 , C12M1/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种单分子测序芯片及其制备方法，所述芯片包括流道板、基板和盖板，所述流道板设置在基板和盖板之间；所述流道板上设置流通池，所述流通池包括多个平行设置的流道；所述流通池的上方设置盖板、流通池的下方设置基板；所述流道的底部与基板表面连通；与流道板接触的所述基板的表面固定测序引物和定位用荧光标记物。该芯片表面负载有荧光寿命长、荧光强度高，荧光性能稳定的量子点或荧光微球，可以在测序过程中对目标DNA单分子进行定位。由于量子点或荧光微球在经过很多次的激发光照后仍然能够保持较高的荧光强度，解决了定位荧光信号无法长时间保持的问题，显著提高单分子测序读长，降低测序的错误率，并有效降低测序成本。
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