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公开(公告)号:CN117987588B
公开(公告)日:2025-03-07
申请号:CN202410124686.9
申请日:2024-01-30
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6874 , G16B20/20 , G06Q50/02
Abstract: 本发明涉及生物信息学和基因组育种领域,涉及一种玉米全基因组选择的液相育种芯片及应用,所述玉米全基因组选择的液相育种芯片用于玉米品种选育,所述SNP位点包括SNP0001~SNP5851,芯片中包含经GWAS鉴定的多个性状关联位点及重要结构变异,分布在全基因组范围,在选育阶段,可利用芯片中的功能位点,对玉米自交系进行初步鉴定,提高基因组选择效率。
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公开(公告)号:CN118685449A
公开(公告)日:2024-09-24
申请号:CN202411021916.5
申请日:2024-07-29
Applicant: 扬州大学
Abstract: 本发明属于植物基因工程领域,具体涉及玉米ZmTIP1;2基因在调控苗期根系发育和耐旱性中的应用,在玉米中过表达所述ZmTIP1;2基因,总根长、侧根长等性状显著增加;对过表达所述ZmTIP1;2基因材料进行干旱胁迫,存活率明显升高。在玉米中定点突变所述ZmTIP1;2基因,总根长、侧根长等性状显著降低;对定点突变所述ZmTIP1;2基因材料进行干旱胁迫,存活率明显降低。因此,本发明为调控玉米苗期根系发育和耐旱性提供了宝贵的基因资源。
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公开(公告)号:CN116731142B
公开(公告)日:2024-09-20
申请号:CN202310909406.0
申请日:2023-07-24
Applicant: 扬州大学
IPC: C07K14/415 , C12N15/82 , C12N15/29 , A01H6/46 , A01H5/06
Abstract: 本发明涉及植物基因工程领域,具体涉及一种ZmSAUR21基因、蛋白及其在调控苗期玉米根系发育的应用。在玉米中定点突变所述ZmSAUR21基因,主胚根轴根长、种子根轴根平均长度等性状均显著降低;在玉米中过表达所述ZmSAUR21基因,主胚根轴根长、种子根轴根平均长度等性状均显著升高。因此,本发明为调控玉米苗期根系发育提供了宝贵的基因资源。
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公开(公告)号:CN116959570A
公开(公告)日:2023-10-27
申请号:CN202310873519.X
申请日:2023-07-17
Applicant: 扬州大学 , 中垦种业股份有限公司
Abstract: 本发明属于育种技术领域,涉及一种代谢标志物辅助的全基因组预测方法及其应用,获取亲本自交系的SNP、代谢物以及表型数据,进行代谢组关联分析,挖掘产量相关性状的代谢标志物,构建代谢标志物辅助的全基因组预测模型,并对表型未知的杂交种进行表型预测,根据表型预测结果选择具有高产潜力的候选杂交组合。本发明可以提高GS模型对玉米杂种表型的预测准确度,进而能够更精准地筛选出具有高产潜力的候选杂交组合,为进一步提高作物产量做出贡献。
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公开(公告)号:CN116863998A
公开(公告)日:2023-10-10
申请号:CN202310741264.1
申请日:2023-06-21
Applicant: 扬州大学
Abstract: 本发明属于生物信息领域,涉及一种基于遗传算法的全基因组预测方法及其应用,采用基因组最佳线性无偏估计模型来预测个体的育种值,包括以下步骤:获取待预测作物的分子标记;从中重复地随机选择一定比例的分子标记子集供遗传算法初始化,并构建基因组预测模型,计算不同分子标记子集的适合度,保留适合度较高的分子标记子集,将保留的分子标记子集以一定的比率进行突变、配对、交叉互换,产生新的分子标记子集;再次计算不同分子标记子集的适合度函数,保留适合度较高的分子标记子集,直到达到最大迭代次数或者收敛,得到最终的分子标记子集并构建基因组最佳线性无偏估计模型用于全基因组预测。本发明方法可用于提高杂交种全基因组选择的准确性,可以为杂交种的精准选育提供重要的技术支撑。
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公开(公告)号:CN116731142A
公开(公告)日:2023-09-12
申请号:CN202310909406.0
申请日:2023-07-24
Applicant: 扬州大学
IPC: C07K14/415 , C12N15/82 , C12N15/29 , A01H6/46 , A01H5/06
Abstract: 本发明涉及植物基因工程领域,具体涉及一种ZmSAUR21基因、蛋白及其在调控苗期玉米根系发育的应用。在玉米中定点突变所述ZmSAUR21基因,主胚根轴根长、种子根轴根平均长度等性状均显著降低;在玉米中过表达所述ZmSAUR21基因,主胚根轴根长、种子根轴根平均长度等性状均显著升高。因此,本发明为调控玉米苗期根系发育提供了宝贵的基因资源。
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公开(公告)号:CN116574840A
公开(公告)日:2023-08-11
申请号:CN202310758749.1
申请日:2023-06-26
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种玉米耐旱基因位点的开发方法及应用,属于基因组序列及植物生物技术领域。它包括检测待测玉米的基因型,根据基因型结果鉴定或辅助鉴定耐旱;ZmReDroSNP0201492位点是玉米基因组中的一个SNP位点,其核苷酸种类为A或T,为序列表中SEQ ID No.1的第71位核苷酸;ZmReDroSNP1038761位点是玉米基因组中的一个SNP位点,其核苷酸种类为G或C,为序列表中SEQ ID No.2的第71位核苷酸。本发明开发了新的玉米耐旱基因位点,并利用KASP分型技术对耐旱基因位点进行快速基因分型,可用于玉米分子标记辅助育种。分子标记辅助玉米进行耐旱性选育,选择效率高、周期短,可在苗期进行定向基因型选择,淘汰大量不耐旱的材料,降低育种成本,提高育种效率。
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公开(公告)号:CN116253781A
公开(公告)日:2023-06-13
申请号:CN202211074755.7
申请日:2022-09-02
Applicant: 扬州大学
IPC: C07K14/415 , C12N15/29 , C12N15/84 , A01H5/04 , A01H5/10 , A01H5/00 , A01H6/46 , C12N15/11 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明属于植物基因工程领域,涉及水稻OsDNE1蛋白及其编码基因和应用。本发明所述蛋白及其编码基因可提高植株株高、提高分蘖数量、提高种子数量、增大种子长度和/或提高产量。本发明所述蛋白及其编码基因可用于增加水稻产量和改良水稻外观品质,在水稻育种上具有重要意义,可以为提高水稻产量和改良粒型提供重要的生物资源。
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公开(公告)号:CN107022634A
公开(公告)日:2017-08-08
申请号:CN201710407061.3
申请日:2017-05-25
Abstract: 本发明涉及一种鉴别水稻抽穗期基因qHD7.4的分子标记方法,属于生物工程技术领域。设计合成一对正、反引物,对不同水稻植株DNA进行扩增,如果能够扩增出117bp的特征条带即为含正常抽穗基因qHD7.4的纯合体;扩增出109bp的特征条带即为早抽穗基因qhd7.4的纯合体;如果同时存在117bp和109bp的两条特征条带,则为qHD7.4和qhd7.4的杂合体。本发明不仅能快速、准确地鉴定水稻种质资源或其育种群体中是否含有水稻正常抽穗基因qHD7.4或早抽穗基因qhd7.4,同时能进一步区分qHD7.4的纯合体和杂合体,预测后代基因型,大大提高对水稻抽穗期的选择效率,加速育种进程。
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公开(公告)号:CN103923890A
公开(公告)日:2014-07-16
申请号:CN201410187111.8
申请日:2014-05-05
Applicant: 扬州大学
CPC classification number: C12N9/001 , C12N15/825 , C12Y103/01083
Abstract: 本发明公开了一个水稻叶色控制基因LYL1编码的蛋白质,该蛋白质具有SEQ ID No:3所示的氨基酸序列。本发明还同时公开了一种水稻叶色控制基因LYL1,该基因具有SEQ ID No:1和2所示的核苷酸序列。LYL1编码一个双牻牛儿基还原酶,该基因的突变导致水稻叶色从正常的绿色变成黄色。本发明还同时公开了一种载体,为含有上述基因的植物表达载体;植物表达载体例如为pCAMBIA1301-LYL1。本发明还同时公开了一种宿主细胞,其为含有上述载体的细胞;细胞例如为大肠杆菌、农杆菌细胞或植物细胞。利用本发明lyl1-1突变基因控制的黄叶性状可以作为遗传标记用于农业生产中的品种鉴定以及水稻遗传育种。
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