一种基于遗传算法的全基因组预测方法及其应用

    公开(公告)号:CN116863998A

    公开(公告)日:2023-10-10

    申请号:CN202310741264.1

    申请日:2023-06-21

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明属于生物信息领域,涉及一种基于遗传算法的全基因组预测方法及其应用,采用基因组最佳线性无偏估计模型来预测个体的育种值,包括以下步骤:获取待预测作物的分子标记;从中重复地随机选择一定比例的分子标记子集供遗传算法初始化,并构建基因组预测模型,计算不同分子标记子集的适合度,保留适合度较高的分子标记子集,将保留的分子标记子集以一定的比率进行突变、配对、交叉互换,产生新的分子标记子集;再次计算不同分子标记子集的适合度函数,保留适合度较高的分子标记子集,直到达到最大迭代次数或者收敛,得到最终的分子标记子集并构建基因组最佳线性无偏估计模型用于全基因组预测。本发明方法可用于提高杂交种全基因组选择的准确性,可以为杂交种的精准选育提供重要的技术支撑。

    玉米耐旱基因位点的开发方法及应用

    公开(公告)号:CN116574840A

    公开(公告)日:2023-08-11

    申请号:CN202310758749.1

    申请日:2023-06-26

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明公开了一种玉米耐旱基因位点的开发方法及应用,属于基因组序列及植物生物技术领域。它包括检测待测玉米的基因型,根据基因型结果鉴定或辅助鉴定耐旱;ZmReDroSNP0201492位点是玉米基因组中的一个SNP位点,其核苷酸种类为A或T,为序列表中SEQ ID No.1的第71位核苷酸;ZmReDroSNP1038761位点是玉米基因组中的一个SNP位点,其核苷酸种类为G或C,为序列表中SEQ ID No.2的第71位核苷酸。本发明开发了新的玉米耐旱基因位点,并利用KASP分型技术对耐旱基因位点进行快速基因分型,可用于玉米分子标记辅助育种。分子标记辅助玉米进行耐旱性选育,选择效率高、周期短,可在苗期进行定向基因型选择,淘汰大量不耐旱的材料,降低育种成本,提高育种效率。

    水稻叶色控制基因LYL1及其应用

    公开(公告)号:CN103923890A

    公开(公告)日:2014-07-16

    申请号:CN201410187111.8

    申请日:2014-05-05

    Applicant: 扬州大学

    CPC classification number: C12N9/001 C12N15/825 C12Y103/01083

    Abstract: 本发明公开了一个水稻叶色控制基因LYL1编码的蛋白质,该蛋白质具有SEQ ID No:3所示的氨基酸序列。本发明还同时公开了一种水稻叶色控制基因LYL1,该基因具有SEQ ID No:1和2所示的核苷酸序列。LYL1编码一个双牻牛儿基还原酶,该基因的突变导致水稻叶色从正常的绿色变成黄色。本发明还同时公开了一种载体,为含有上述基因的植物表达载体;植物表达载体例如为pCAMBIA1301-LYL1。本发明还同时公开了一种宿主细胞,其为含有上述载体的细胞;细胞例如为大肠杆菌、农杆菌细胞或植物细胞。利用本发明lyl1-1突变基因控制的黄叶性状可以作为遗传标记用于农业生产中的品种鉴定以及水稻遗传育种。

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