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公开(公告)号:CN116042920A
公开(公告)日:2023-05-02
申请号:CN202211639790.9
申请日:2022-12-20
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6874 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明属于靶向二代测序领域,具体涉及基于高通量测序检测HPV的二代测序探针组及其方法。尤其适用于检测宫颈癌患者治疗后血浆中含有的低丰度HPV序列。能够对目标区域进行更好的捕获和覆盖,获得在目标区域上的足够的读段数据信息,从而对其MRD与治疗预后进行评估。
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公开(公告)号:CN115295074B
公开(公告)日:2022-12-16
申请号:CN202211220583.X
申请日:2022-10-08
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
Abstract: 本发明提供了基因标志物在恶性肺结节筛查中的应用、筛查模型的构建方法和检测装置,通过对高通量测序结果进行影像表现为高风险的肺结节良恶性差异DNA碎片片段长短比例,读段5端断点处序列读段占比和1Mb窗口拷贝数变化分析,16bp肿瘤新短序列和核小体覆盖模式,利用自动机器学习构建多特征多算法整合模型,对在影像学表现为高风险的肺结节的良恶性进行预测,实现对恶性肺结节无创精准诊断,减少非必要的良性肺结节切除手术。
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公开(公告)号:CN115295074A
公开(公告)日:2022-11-04
申请号:CN202211220583.X
申请日:2022-10-08
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
Abstract: 本发明提供了基因标志物在恶性肺结节筛查中的应用、筛查模型的构建方法和检测装置,通过对高通量测序结果进行影像表现为高风险的肺结节良恶性差异DNA碎片片段长短比例,读段5端断点处序列读段占比和1Mb窗口拷贝数变化分析,16bp肿瘤新短序列和核小体覆盖模式,利用自动机器学习构建多特征多算法整合模型,对在影像学表现为高风险的肺结节的良恶性进行预测,实现对恶性肺结节无创精准诊断,减少非必要的良性肺结节切除手术。
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公开(公告)号:CN119395167A
公开(公告)日:2025-02-07
申请号:CN202411376026.6
申请日:2024-09-29
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
Abstract: 本发明涉及一种血浆蛋白质组学前处理方法,涉及蛋白质组学检测领域。本发明的技术方案对血清白蛋白的去除效率达到50%以上,同时对其他蛋白的检出影响较小,性能与去除试剂盒相当甚至更优。
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公开(公告)号:CN117737235A
公开(公告)日:2024-03-22
申请号:CN202211648033.8
申请日:2022-12-21
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6883 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种同时检测异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)或者异柠檬酸脱氢酶2(IDH2)中多亚型基因位点突变的方法及其试剂,所述方法基于ARMS荧光定量PCR方法,在相同的反应体系中,分别使用针对所述IDH1或IDH2基因突变位点的突变型模板的ARMS引物及它们共用的上游或下游引物对待测样本进行检测。本发明的方法操作简便,可在短时间内通过多重检测,检出样本中是含有IDH突变位点。
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公开(公告)号:CN114927213A
公开(公告)日:2022-08-19
申请号:CN202210392412.9
申请日:2022-04-15
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: G16H50/20 , G16H50/30 , G16B20/20 , G06N3/08 , G06N3/04 , G06K9/62 , C12Q1/6886 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明涉及多癌种(肺癌、肠癌和肝癌)早期检测和癌种预测方法、检测装置以及计算机可读取介质。本发明提供了一种对血浆样本cfDNA进行WGS低深度测序,使用高通量测序结果分析各癌种cfDNA片段五种差异特征,包括基因组范围片段长度覆盖分布,染色体各长短臂上片段长度分布,片段断点处序列,片段5’端序列和1MB窗口片段拷贝数变化,利用再用广义线性模型,梯度提升机,随机森林,深度学习和极端梯度提升五种算法分别进行训练建模,再用广义线性模型进行二次集合训练构建多特征多算法整合模型,实现了对多癌种低深度高特异性高敏感性的无创精准早期检测和组织起源检测的目的。
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公开(公告)号:CN114093428A
公开(公告)日:2022-02-25
申请号:CN202111314976.2
申请日:2021-11-08
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
Abstract: 本发明公开一种NGS双端分子标签测序技术和背景降噪算法的检测血浆ctDNA超高测序深度下低丰度突变的检测方法,包括:(1)对所有测序读段携带的双端分子标签序列收集并标注分子标签序列和组合方式;(2)标注后的读段与参考序列进行比对,将分子标签组合序列和比对位置相同的测序读段归类至单分子共识序列;(3)将存在的分子标签组互补且读段序列互补的单分子共识序列进一步归类至双链共识序列;(4)对包含单链共识序列和双链共识序列的比对结果进行突变检测,注释和过滤;(5)对突变检测结果,利用健康人检测结果使用零膨胀泊松分布算法进行背景降噪。在保证100%特异性的前提下提升了检测灵敏度的,ctDNA中丰度0.1%突变的检测敏感性达到95%以上。
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公开(公告)号:CN114717319A
公开(公告)日:2022-07-08
申请号:CN202210407188.6
申请日:2022-04-19
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医学检验有限公司
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及用于胆管癌预后评估的分子标志物,属于肿瘤医学技术领域。本发明通过对大量胆管癌患者肿瘤样本的基因组数据进行分析和筛选,找到了可以用于胆管癌预后评估的分子标志物,包括KRAS、TP53、SMAD4和TERT,并构建了胆管癌患者总生存期联合预测标志物,它能够有效区分胆管癌患者总生存期,为临床诊疗提供参考依据。
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公开(公告)号:CN118581201A
公开(公告)日:2024-09-03
申请号:CN202410426824.9
申请日:2024-04-10
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司
IPC: C12Q1/6869 , G16B30/00
Abstract: 本发明涉及一种高通量测序文库的接头污染率的预测方法,本方法通过采用特定的核酸序列,并且采用待测试接头进行文库的构建,再通过高通量测序获得目标读段的数量,进而可以统计出接头试剂本身所存在的污染情况。
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公开(公告)号:CN117737234A
公开(公告)日:2024-03-22
申请号:CN202211638427.5
申请日:2022-12-19
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医学检验有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6874 , C40B50/06 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于二代测序(Next generation sequencing,NGS)领域,具体涉及基于高通量测序技术检测IGH克隆型重排的二代测序探针组及其方法。尤其适用于检测淋系血液肿瘤患者体内优势克隆型及其具体序列信息。
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