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公开(公告)号：CN106198990A
公开(公告)日：2016-12-07
申请号：CN201510219570.4
申请日：2015-04-30
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N33/58
Abstract: 本发明公开了一种对组织样本进行免疫标记的方法，具体地，本发明(a)提供一标记体系，所述标记体系含有待进行免疫标记的组织样本、用于对所述组织样本进行标记的探针和缓冲液；和(b)将所述的标记体系置于电场作用下进行标记处理，从而使得所述的探针进入所述组织样本内部，从而对所述组织样本进行免疫标记，获得经免疫标记的组织样本。本发明不仅能够缩短探针进入组织样本内部的时间，还能保持组织内部的完整性，具有极大的应用价值。
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公开(公告)号：CN103804447B
公开(公告)日：2016-08-17
申请号：CN201410055242.0
申请日：2014-02-18
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/167 , C07H19/173 , C07H19/20 , C07H1/00 , C07H1/04 , C09K11/06 , C12Q1/68
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种氮杂化鸟嘌呤核苷及其合成方法和在DNA测序中的用途；所述合成方法包括如下步骤：式(Ⅲ)化合物在碱性条件下去保护基得式(Ⅱ)化合物；进一步去甲基得式(Ⅰ)化合物，即7?去氮?7?卤素?8?氮?鸟嘌呤核苷；其中，R1为H或OH，R2为I、Br或Cl，R3为H或本发明的氮杂化鸟嘌呤核苷是用于DNA测序的新型试剂，与8位未取代氮的鸟嘌呤核苷相比，具有更好的碱基识别效果、更稳定的DNA链结构。同时，现有技术中8位氮取代鸟嘌呤核苷的合成方法复杂，产率低，尚未商业化生产，而本发明的合成方法所需原料简单易得，采用常规化学合成反应，且收率较高，适用于广泛推广使用。
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公开(公告)号：CN103601779B
公开(公告)日：2016-05-04
申请号：CN201310489397.0
申请日：2013-10-17
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/173 , C07H19/20 , C07H1/00
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种7-去氮-2’-脱氧-7-卤素取代鸟嘌呤核苷的合成方法；所述方法包括将下式(V)化合物在碱性条件下去甲基得到下式(I)化合物，即所述7-去氮-2’-脱氧-7-卤素取代鸟嘌呤核苷；(I)，(V)，其中R2为I、Br或Cl。本发明合成的7-去氮-7-碘-2’-脱氧鸟嘌呤核苷是在DNA测序、标记、延伸等生物学领域广泛使用的基本原料，目前其销售价格很高，且合成方法复杂；而本发明提供的合成方法所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN103484106B
公开(公告)日：2015-08-19
申请号：CN201310401580.0
申请日：2013-09-05
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种四色荧光标记可逆终端及其在DNA测序中的用途；所述可逆终端的结构式如式(I)所示：(I)；其中，R1为三磷酸盐；R2为H或者OH；碱基为U，C，A，G或其衍生物；连接单元为在温和条件下可以断裂的双官能团化合物；荧光基团选自BODIPY、荧光素、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、alexa、squarene染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种。本发明的可逆终端可用于DNA单分子测序；同时，本发明的可逆终端的合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用，并且生物学评价结果表明该类可逆终端能完全满足高通量测序的生化反应要求，具备很好的实用前景。
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公开(公告)号：CN104292117A
公开(公告)日：2015-01-21
申请号：CN201410186697.6
申请日：2014-05-05
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07C217/08 , C07C217/12 , C07C217/10 , C07C213/02 , C07H19/10 , C07H19/14 , C07H1/00 , C08G65/48 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种酸敏感连接单元的合成及其在DNA测序中的用途。该酸敏感连接单元，结构式为：其中R为NH2或N3，m为0～44中任一整数，n为0～44中任一整数；R1，R2均为脂肪族烷基，或R1，R2均为芳香族衍生物，或R1为苯基、萘基、苯基的衍生物、或萘基的衍生物，R2为脂肪族烷基或氢；或R2为苯基、萘基、苯基的衍生物、或萘基的衍生物，R1为脂肪族烷基或氢，或R1、R2构成环己基、环戊基或环丁基。该酸敏感连接单元与核苷酸及荧光素连接得到的可逆终端可用于DNA合成测序。该类可逆终端可用于DNA测序；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN108192957B
公开(公告)日：2021-11-23
申请号：CN201711279201.X
申请日：2017-12-06
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6869 , C12M1/36 , C12M1/34
Abstract: 本发明公开了一种DNA合成测序方法和测序系统，所述方法包括：通过水溶性双功能连接单元将引物P1连接于基体表面；在基体表面加入含待测DNA模板的溶液，然后进行等温表面放大反应；再将引物Pe加入基体表面，然后在基体表面加入四种碱基的荧光标记可逆终止剂的延伸反应溶液，进行延伸反应；然后对延伸后的DNA双链进行成像之后，加入相应的化学试剂，使荧光标记可逆终止剂的连接单元断裂。重复DNA链延伸和断裂步骤，完成多次循环测序，即得待测DNA模板核苷酸的碱基序列。本发明测序方法可用于DNA高通量合成测序，在所述测序条件下实验结果其读长至少为73碱基；如果双端测序，其读长至少为146，准确率至少为99.98％。
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公开(公告)号：CN113189071A
公开(公告)日：2021-07-30
申请号：CN202110477789.X
申请日：2021-04-29
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N21/64
Abstract: 本发明提供了一种用于完整器官血管三维网络精准成像的试剂盒及成像方法。具体地，包括：(A)抗凝血剂；(B)去血剂，所述去血剂包括抗凝血剂和血管扩张剂；(C)血管标记物，所述血管标记物包括荧光微球；(D)组织固定剂；和(E)荧光微球稀释液，其中所述荧光微球稀释液包括肝素钠和碳化二亚胺(EDAC)。本发明的试剂盒可实现实验动物或其组织器官的快速、完整、稳定的血管标记。
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公开(公告)号：CN107590798B
公开(公告)日：2020-09-29
申请号：CN201710642640.6
申请日：2017-07-31
Abstract: 本发明公开了一种生物组织三维图像背景去除系统和方法。该系统包括图像提供模块，用于提供目标生物组织的同一断面的多通道荧光图像；归一化处理模块，用于对多通道荧光图像进行窗口分割，并对窗口中的每个像素进行归一化处理；映射窗口计算模块，用于计算多通道一对映射窗口的Dif值；采样模块，用于根据Dif值选择采样点，并获得采样像素；以及结果计算模块，用于将采样模块的采样像素作为背景估计值进行插值，获得整张图像的背景估计值；其中，归一化处理模块与图像提供模块以及映射窗口计算模块连接，采样模块与映射窗口计算模块以及结果计算模块连接。本发明的系统，结构简单，运行速度快，效率高。
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公开(公告)号：CN108424844B
公开(公告)日：2020-07-28
申请号：CN201810307850.4
申请日：2018-04-08
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12M1/34 , C12M1/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种单分子测序芯片及其制备方法，所述芯片包括流道板、基板和盖板，所述流道板设置在基板和盖板之间；所述流道板上设置流通池，所述流通池包括多个平行设置的流道；所述流通池的上方设置盖板、流通池的下方设置基板；所述流道的底部与基板表面连通；与流道板接触的所述基板的表面固定测序引物和定位用荧光标记物。该芯片表面负载有荧光寿命长、荧光强度高，荧光性能稳定的量子点或荧光微球，可以在测序过程中对目标DNA单分子进行定位。由于量子点或荧光微球在经过很多次的激发光照后仍然能够保持较高的荧光强度，解决了定位荧光信号无法长时间保持的问题，显著提高单分子测序读长，降低测序的错误率，并有效降低测序成本。
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公开(公告)号：CN104292117B
公开(公告)日：2016-10-05
申请号：CN201410186697.6
申请日：2014-05-05
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07C217/08 , C07C217/12 , C07C217/10 , C07C213/02 , C07H19/10 , C07H19/14 , C07H1/00 , C08G65/48 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种酸敏感连接单元的合成及其在DNA测序中的用途。该酸敏感连接单元，结构式为：其中R为NH2或N3，m为0～44中任一整数，n为0～44中任一整数；R1，R2均为脂肪族烷基，或R1，R2均为芳香族衍生物，或R1为苯基、萘基、苯基的衍生物、或萘基的衍生物，R2为脂肪族烷基或氢；或R2为苯基、萘基、苯基的衍生物、或萘基的衍生物，R1为脂肪族烷基或氢，或R1、R2构成环己基、环戊基或环丁基。该酸敏感连接单元与核苷酸及荧光素连接得到的可逆终端可用于DNA合成测序。该类可逆终端可用于DNA测序；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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