一种用于修复OTOF基因p.Q829X突变的单碱基编辑系统及其应用

    公开(公告)号:CN118931896A

    公开(公告)日:2024-11-12

    申请号:CN202410421468.1

    申请日:2024-04-09

    摘要: 本发明公开了一种用于修复OTOF基因p.Q829X突变的单碱基编辑系统及其应用。所述单碱基编辑系统包括:腺嘌呤碱基编辑器和sgRNA,所述sgRNA的靶向序列如SEQ ID NO.1所示。本发明通过纯合OtofQ828X/Q828X小鼠模型实验评价了该系统对小鼠听力损失的影响。结果发现,该系统能特异靶向OtofQ828X/Q828X小鼠内毛细胞对点突变进行有效修复,成功地纠正了C>T的突变,且在长达一年的观察期内,持续检测到听力恢复至野生型水平,同时观察到otoferlin蛋白表达和内毛细胞持续囊泡释放功能的恢复,直观地验证了该系统对OTOF(c.2482C>T,p.Q828X)突变基因导致的听神经病的治疗和/或预防作用,能够用于制备治疗和/或预防听神经病的药物。

    碱基编辑器及其构建方法与应用

    公开(公告)号:CN114045277B

    公开(公告)日:2024-11-05

    申请号:CN202111226226.X

    申请日:2021-10-21

    申请人: 复旦大学

    摘要: 本发明涉及基因编辑技术领域,尤其是涉及一种碱基编辑器及其构建方法与应用,用于DNA水平特定位点特定碱基的突变。本发明构建得到编辑特异性更高且RNA/DNA脱靶风险低的ABE,编辑精度高且RNA/DNA脱靶风险低的CBE以及体积更小的ACBE工具。本发明中开发的ABE工具在介导A·T‑‑G·C突变时有更高的特异性,其介导C·G‑‑T·A突变的能力被明显抑制,甚至清除,且在RNA和DNA水平的脱靶效应有明显降低,甚至消除;本发明开发的CBE工具在介导C·G‑‑T·A突变时有更高的精确度,且RNA和DNA水平的脱靶效应有明显降低,甚至消除;本发明中开发的ACBE工具,只需要单一的脱氨酶,其体积更小,且在RNA和DNA水平的脱靶效应有明显降低,甚至消除,具有更高的应用价值。

    一种米诺巴林的高效生物合成方法及突变体

    公开(公告)号:CN118879790A

    公开(公告)日:2024-11-01

    申请号:CN202410932806.8

    申请日:2024-07-12

    摘要: 本发明公开了一种米诺巴林的高效生物合成方法及突变体,首先利用重组羰基还原酶突变体选择性还原消旋体EHEO中的S‑EHEO,获得ee值高达99.8%的R‑EHEO。其次,经过几步化学修饰后获得CEHEC;然后,通过定向进化获得的腈水解酶突变体对CEHEC进行水解,一步将其立体拆分为S‑CEHEA,ee值高达99%,最后通过催化加氢还原获得米洛巴林。本发明采用酶法替代了两个关键中间体的合成,大大降低了工艺步骤和生产成本,酶法温和的反应条件使操作过程更加简单,对环境更加友好,符合绿色工业生产的要求,解决了已有的工艺中产物ee值不高,反应条件剧烈,反应过程较为复杂且难以控制,对环境不够友好等问题。

    胞嘧啶碱基编辑组合物及其用途

    公开(公告)号:CN114269913B

    公开(公告)日:2024-10-29

    申请号:CN202080055843.5

    申请日:2020-07-29

    IPC分类号: C12N9/22 C12N9/78 C12N15/10

    摘要: 本发明涉及胞嘧啶碱基编辑组合物,并且更具体地,涉及包含腺嘌呤脱氨酶和CRISPR相关蛋白9(Cas9)或其功能类似物的胞嘧啶碱基编辑组合物,其具有窄的编辑窗口,因此能够用其他碱基准确编辑靶序列中的胞嘧啶。本发明人已发现将包含腺嘌呤脱氨酶和Cas9或其功能类似物的胞嘧啶碱基编辑组合物应用于靶序列导致特定基序上的胞嘧啶被其他碱基替换,并且现有的腺嘌呤碱基编辑器(ABE)不仅能够编辑腺嘌呤,还能够编辑胞嘧啶,并且能以比现有胞嘧啶碱基编辑器(CBE)更高的准确性发生所述替换。因此,根据本发明的胞嘧啶碱基编辑组合物预期有利地用于遗传疾病的治疗和遗传疾病的研究中。

    Un1Cas12f1突变体及其应用
    7.
    发明公开

    公开(公告)号:CN118792282A

    公开(公告)日:2024-10-18

    申请号:CN202310442678.4

    申请日:2023-04-13

    申请人: 深圳大学

    发明人: 王宇 陈丽 黄成思

    摘要: 本发明涉及基因编辑领域,特别是基于CRISPR/Cas技术的基因编辑领域。具体而言,本发明涉及一种Un1Cas12f1突变体,其氨基酸序列相对于野生型Un1Cas12f1的氨基酸序列包含M427F和F487W取代中的一个或两个,其中氨基酸残基按照如SEQ ID NO:1所示的野生型Un1Cas12f1的氨基酸序列编号。本发明还涉及包含所述Un1Cas12f1突变体的氨基酸序列且进一步包含D143R、T147R、G297C、D326A、K330R、D510A和E528R取代的dUn1Cas12f1蛋白或不包含G297位置的突变的dUn1Cas12f1蛋白;编码所述Un1Cas12f1突变体、所述dUn1Cas12f1蛋白或nUn1Cas12f1蛋白的多核苷酸;包含所述Un1Cas12f1突变体、所述dUn1Cas12f1蛋白或nUn1Cas12f1蛋白的融合蛋白,CRISPR/Cas核酸酶系统,CRISPR/Cas延伸系统,载体,细胞和试剂盒;以及所述Un1Cas12f1突变体、所述dUn1Cas12f1蛋白或nUn1Cas12f1蛋白的应用。

    胞嘧啶脱氨酶突变体及其在甲基化检测中的应用

    公开(公告)号:CN118581073B

    公开(公告)日:2024-10-18

    申请号:CN202411076238.2

    申请日:2024-08-07

    发明人: 侯策 陈晶晶 曹振

    IPC分类号: C12N9/78 C12N15/55 C12Q1/6858

    摘要: 本发明提供了一种胞嘧啶脱氨酶突变体APOBEC mut5、其编码核苷酸序列及其在甲基化检测中的应用,以及基于APOBEC突变体甲基化检测方法,称为βFDM‑seq。βFDM‑seq首先使用甲基转移酶突变体M.MpeI N374K和羧基‑S‑腺苷‑L‑蛋氨酸使正常的C变成5cxmC,再用APOBEC mut5使5mC变为T,5hmC和5cxmC不被脱氨基,转化后的DNA片段通过NGS建库测序和生物信息学分析可发现5mC功能位点,具有巨大的临床应用价值。βFDM‑seq起始模板量低至10 ng,具有单碱基分辨率,其阳性位点检出率99.0%以上,准确性高,模板损伤小,数据质量高,这赋予了βFDM‑seq比重亚硫酸盐测序在肿瘤早筛领域更为巨大的优势和潜力。

    一种谷氨酸棒杆菌基因组进化的系统、连续进化方法及应用

    公开(公告)号:CN118638837A

    公开(公告)日:2024-09-13

    申请号:CN202410838024.8

    申请日:2024-06-26

    申请人: 江南大学

    摘要: 本发明涉及一种谷氨酸棒杆菌基因组进化的系统、连续进化方法及应用。基于DNA解旋酶在转录过程中解旋dsDNA,将胞嘧啶脱氨酶pmCDA1与DNA解旋酶融合,提高谷氨酸棒杆菌的基因组突变率。应用本发明的连续进化方法提高谷氨酸棒杆菌的乙醇耐受性,获得在13%乙醇浓度下生物量提高10.17倍的突变株。通过全基因组测序鉴定出编码醛脱氢酶的Cgl2467基因的L213W突变对谷氨酸棒杆菌乙醇耐受性提高具有重要作用,并首次鉴定了Cgl2467具有乙醛脱氢酶活性。本发明公开的连续进化方法对筛选其他鲁棒性增强的突变体具有重要指导意义,本发明鉴定的乙醛脱氢酶有助于对谷氨酸棒杆菌乙醇代谢有新的认识。