基于肠道微生物信息的过敏预测模型构建方法

    公开(公告)号:CN115881229A

    公开(公告)日:2023-03-31

    申请号:CN202211623297.8

    申请日:2022-12-16

    摘要: 本发明提供了一种基于肠道微生物信息的过敏预测模型构建方法,对受试者的过敏性病史和临床表征信息进行收集,获取肠道微生物原始序列数据并进行注释分析,从而筛选出肠道微生物的物种组成表,选择最优的特征变量合集,构建预测模型并选择出最优过敏预测模型。本发明利用了机器学习的方式来建立预测过敏的模型,只需要获取受试者的粪便样本即可,不需要对受试者机体造成可能的伤害;此外,建立的基于肠道微生物菌群的预测模型,预测准确率较高,灵敏度和特异性较好,能有效的区分多个样本中过敏与否的结果,为早期预防受试者是否会发生过敏而提供有效的证据。

    一种乳酸菌组成型启动子、重组载体及其应用

    公开(公告)号:CN118834876A

    公开(公告)日:2024-10-25

    申请号:CN202411150946.6

    申请日:2024-08-21

    摘要: 本发明提供了一种乳酸菌组成型启动子、重组载体及其应用,属于基因工程领域。本发明提供的启动子PenoA的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。所述启动子PenoA能够启动下游基因在乳酸菌中的高效表达,表达强度为甘油醛三磷酸脱氢酶启动子PgapA(原核生物中普遍较强)的3.38倍,为商业化启动子Perm和PldhL的32.61和51.40倍,是一种超高效启动子。该启动子可应用于乳酸乳球菌和植物乳杆菌。本发明提供的启动子能够用于原核生物内源或外源蛋白的高效表达,如白细胞介素10。且经过随机突变后,形成转录强度5.5%‑430.28%启动子文库,为以肠道益生菌为底盘细胞的生物活体药物的开发提供了有利工具。

    一种菌群互作网络构建、剪裁方法与系统及核心菌群标志物和应用

    公开(公告)号:CN118471344A

    公开(公告)日:2024-08-09

    申请号:CN202410623361.5

    申请日:2024-05-20

    IPC分类号: G16B40/00 G16B45/00 G16H70/20

    摘要: 本发明提供了一种菌群互作网络构建、剪裁方法与系统及核心菌群结构应用,本发明通过对群体肠道微生物组成信息的收集,构建群体的菌群组成数据,经过分析细菌间的共发现频次和基于概率的理论频次进行比较,确定细菌间的有益和有害关联,构建出细菌间互作的复杂网络。进一步通过对菌群互作网络的迭代裁剪和优化,最终确定群体微生态中的核心细菌组成。应用该算法功能性便秘儿童的菌群网络分析研究,发现了25个便秘相关的核心菌群标志物,并且通过机器学习算法验证25个标志物的分类模型区分便秘儿童和正常儿童,模型的AUC能到达85.2%。本发明通过一种网络构建和分析算法挖掘出特定人群的核心菌群标志物,为肠道微生态的临床应用研究提供新的方法。

    一种用于微生物领域的发酵罐清洗机

    公开(公告)号:CN109909246B

    公开(公告)日:2021-12-24

    申请号:CN201910329558.7

    申请日:2019-04-23

    发明人: 陈东波 邱玲玲

    IPC分类号: B08B9/093 B08B3/12

    摘要: 本发明属于微生物设备领域,尤其涉及一种用于微生物领域的发酵罐清洗机。本发明要解决的技术问题是提供一种能够便于工人操作、能够降低工人劳动强度、能够便于发酵罐清洗、能够有力清洗发酵罐内壁、能够对不同发酵罐进行清洗的用于微生物领域的发酵罐清洗机。一种用于微生物领域的发酵罐清洗机,包括有工作台、车轮、控制机构、储水桶、入口、封盖、抽水机构、升降机构、喷水管、调角机构、清洗机构、支架和安装座;安装座安装于工作台前后两侧。本发明达到能够便于工人操作、能够降低工人劳动强度、能够便于发酵罐清洗、能够有力清洗发酵罐内壁、能够对不同发酵罐进行清洗的效果。

    一种用于假小链双歧杆菌的定量检测方法及其核酸检测试剂盒

    公开(公告)号:CN117248040A

    公开(公告)日:2023-12-19

    申请号:CN202311060293.8

    申请日:2023-08-21

    摘要: 本发明公开了检测假小链双歧杆菌的特异性引物对,本发明还公开了一种基因片段和一种阳性标准质控品以及含有所述的引物对的检测假小链双歧杆菌的试剂盒及其相关应用。本发明还公开了一种检测假小链双歧杆菌的方法。本发明通过泛基因组和核心基因组分析,建立了特定菌种的基因组特异性序列筛选方法,并应用于假小链双歧杆菌特异性引物对的设计,且该引物具备良好的特异性及灵敏度,可用于复杂微生态群落样本的检测,灵敏度达到100拷贝/检测孔。实现了假小链双歧杆菌在种水平的绝对定量检测,将该检测方法应用于微生态样品的检测,并具备良好的特异性和灵敏度。