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公开(公告)号：CN117925771A
公开(公告)日：2024-04-26
申请号：CN202410120360.9
申请日：2024-01-29
申请人： 迪辅乐生物(上海)有限公司
摘要： 本发明公开了一种HMO高利用率菌株的筛选方法和得到的高HMO利用率的菌株，该方法简单快捷，筛选一目了然，可以用于HMO为唯一碳源的利用率筛选，也可以用于其他碳源作为唯一碳源的利用率筛选；该方法避免了厌氧菌在生长曲线测定过程中反复取放引起氧气后对菌株生长造成的影响，为严格厌氧菌的生长曲线测定提供了一种可行的实验方案。本发明筛选的长双歧杆菌婴儿亚种Dipro F能够高效利用HMO，相比市场所售的婴幼儿可食用名单菌株具有更优的HMO利用效率，经过全基因组测序确定了HMO利用机制，菌株经实验验证不存在安全隐患。
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公开(公告)号：CN115881229A
公开(公告)日：2023-03-31
申请号：CN202211623297.8
申请日：2022-12-16
申请人： 迪辅乐生物(上海)有限公司
IPC分类号： G16B40/00 , G16B25/20 , G06F18/2431 , G16B20/30
摘要： 本发明提供了一种基于肠道微生物信息的过敏预测模型构建方法，对受试者的过敏性病史和临床表征信息进行收集，获取肠道微生物原始序列数据并进行注释分析，从而筛选出肠道微生物的物种组成表，选择最优的特征变量合集，构建预测模型并选择出最优过敏预测模型。本发明利用了机器学习的方式来建立预测过敏的模型，只需要获取受试者的粪便样本即可，不需要对受试者机体造成可能的伤害；此外，建立的基于肠道微生物菌群的预测模型，预测准确率较高，灵敏度和特异性较好，能有效的区分多个样本中过敏与否的结果，为早期预防受试者是否会发生过敏而提供有效的证据。
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公开(公告)号：CN115881229B
公开(公告)日：2024-01-09
申请号：CN202211623297.8
申请日：2022-12-16
申请人： 迪辅乐生物(上海)有限公司
IPC分类号： G16B40/00 , G16B25/20 , G06F18/2431 , G16B20/30
摘要： 本发明提供了一种基于肠道微生物信息的过敏预测模型构建方法，对受试者的过敏性病史和临床表征信息进行收集，获取肠道微生物原始序列数据并进行注释分析，从而筛选出肠道微生物的物种组成表，选择最优的特征变量合集，构建预测模型并选择出最优过敏预测模型。本发明利用了机器学习的方式来建立预测过敏的模型，只需要获取受试者的粪便样本即可，不需要对受试者机体造成可能的伤害；此外，建立的基于肠道微生物菌群的预测模型，预测准确率较高，灵敏度和特异性较好，能有效的区分多个样本中过敏与否的结果，为早期预防受试者是否会发生过敏而提供有效的证据。(56)对比文件袁凯琦;邓扬;陈道源;张冰;雷凯.医学知识图谱构建技术与研究进展.计算机应用研究.2017,(第07期),第15-22页.
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公开(公告)号：CN116153414A
公开(公告)日：2023-05-23
申请号：CN202310130546.8
申请日：2023-02-17
申请人： 迪辅乐生物(上海)有限公司
IPC分类号： G16B40/00 , G06F18/2431
摘要： 本发明提供了一种基于肠道微生物的宿主生命早期年龄预测模型构建方法，通过收集涉及生命早期的肠道微生物测序原始数据及其宿主的背景信息，获得构建年龄预测模型的肠道微生物相对丰度信息表，进行微生物特征选择，并构建年龄预测模型验证，利用年龄预测模型对将要预测的样本数据进行年龄预测。本发明基于宿主生命早期肠道微生物群落变化与宿主发育之间的关系，利用肠道微生物在宿主生命早期发挥的重要作用以及不断发育的特点，构建了基于肠道微生物的宿主生命早期年龄预测模型，以及获取在宿主生命早期重要的肠道微生物标志物信息，作为宿主生命早期健康状态评价指标之一；构建的模型预测效果更好、精度越高。
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公开(公告)号：CN118834876A
公开(公告)日：2024-10-25
申请号：CN202411150946.6
申请日：2024-08-21
申请人： 迪辅乐生物(上海)有限公司
IPC分类号： C12N15/113 , C12N15/60 , C12N15/74 , C12N15/65 , C12N15/67 , C12N15/24 , C12N1/21 , C12R1/25 , C12R1/01
摘要： 本发明提供了一种乳酸菌组成型启动子、重组载体及其应用，属于基因工程领域。本发明提供的启动子PenoA的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。所述启动子PenoA能够启动下游基因在乳酸菌中的高效表达，表达强度为甘油醛三磷酸脱氢酶启动子PgapA（原核生物中普遍较强）的3.38倍，为商业化启动子Perm和PldhL的32.61和51.40倍，是一种超高效启动子。该启动子可应用于乳酸乳球菌和植物乳杆菌。本发明提供的启动子能够用于原核生物内源或外源蛋白的高效表达，如白细胞介素10。且经过随机突变后，形成转录强度5.5%‑430.28%启动子文库，为以肠道益生菌为底盘细胞的生物活体药物的开发提供了有利工具。
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公开(公告)号：CN118471344A
公开(公告)日：2024-08-09
申请号：CN202410623361.5
申请日：2024-05-20
申请人： 迪辅乐生物(上海)有限公司
摘要： 本发明提供了一种菌群互作网络构建、剪裁方法与系统及核心菌群结构应用，本发明通过对群体肠道微生物组成信息的收集，构建群体的菌群组成数据，经过分析细菌间的共发现频次和基于概率的理论频次进行比较，确定细菌间的有益和有害关联，构建出细菌间互作的复杂网络。进一步通过对菌群互作网络的迭代裁剪和优化，最终确定群体微生态中的核心细菌组成。应用该算法功能性便秘儿童的菌群网络分析研究，发现了25个便秘相关的核心菌群标志物，并且通过机器学习算法验证25个标志物的分类模型区分便秘儿童和正常儿童，模型的AUC能到达85.2%。本发明通过一种网络构建和分析算法挖掘出特定人群的核心菌群标志物，为肠道微生态的临床应用研究提供新的方法。
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公开(公告)号：CN118910292A
公开(公告)日：2024-11-08
申请号：CN202410954685.7
申请日：2024-07-17
申请人： 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 迪辅乐生物(上海)有限公司
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6883 , C12N15/11 , C12R1/01 , C12R1/185
摘要： 本发明涉及一种诊断VEO‑IBD和IL10RA突变肠炎的生物标志物。本发明克服了现有技术由于目前IBD的诊断多依赖于血液检测、内镜等有创及侵入性检查，筛查检测门槛高、有一定风险及医从性差等问题，容易发生误诊和漏诊的缺陷。
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公开(公告)号：CN116662798A
公开(公告)日：2023-08-29
申请号：CN202310439648.8
申请日：2023-04-23
申请人： 迪辅乐生物(上海)有限公司
IPC分类号： G06F18/214 , G06F18/243 , G06N20/20 , C12Q1/689 , C12Q1/6869
摘要： 本发明公开了基于肠型分型的过敏人群的微生物标志物组合物及其在制备鉴定过敏性疾病的试剂或试剂盒中的应用。本发明还公开了一种鉴定过敏性疾病的试剂盒。本发明还公开了基于肠型分型的过敏预测模型的构建方法及其在构建判断样本过敏风险的系统中的应用。本发明首次提出了基于肠型分层的过敏预测模型，先通过肠型进行分类，进而利用对应机器学习模型预测该样本的过敏风险。本发明通过一种无创非侵入的方式，仅需要儿童的粪便即可检测出该儿童的过敏风险。本发明为未来儿童过敏的研究提供新的技术基础，为儿童过敏检测提供新的无创非侵入的新方法。
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公开(公告)号：CN116042868A
公开(公告)日：2023-05-02
申请号：CN202211264145.3
申请日：2022-10-14
申请人： 迪辅乐生物(上海)有限公司
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6883 , C12N15/11 , C12R1/01
摘要： 本发明公开了用于诊断儿童过敏性疾病的微生物标志物及其应用，其包括Blautia_obeum和Subdoligranulum中的一种或两种。本发明基于特异性序列设计了能够扩增这两段特异性序列的特异性引物及相应试剂盒；本发明采用从粪便中提取微生物菌群的基因组DNA进行扩增子测序的方法，提供了基于粪便样本的儿童过敏风险判断和检测方法，对儿童患者的过敏性疾病的风险进行准确预测。另外，可以通过qPCR的方法，利用特异性引物检测这两种标志菌株的含量，判断是否达到一定参考阈值来完成对儿童患者过敏风险的判断和预测；本发明操作简便，对儿童没有损害，节省成本，对过敏儿童判断的准确率达到100％。
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