-
公开(公告)号：CN119580852A
公开(公告)日：2025-03-07
申请号：CN202411653970.1
申请日：2024-11-19
Applicant: 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
Abstract: 本发明公开了一种宏基因组数据集的生物地球化学元素循环分析方法及系统，包括：获取原始实验数据，基于原始实验数据获得注释文件、样本分组文件与非冗余基因组概况文件；对注释文件、样本分组文件与非冗余基因组概况文件进行预处理，获得样本数据集；构建化学元素循环分析模型，基于样本数据集与化学元素循环分析模型获得化学元素的剖面文件；将化学元素的剖面文件按照所对应的实验处理条件进行分类整理，对每个分类进行统计分析后进行可视化处理，并存储统计分析结果与可视化处理结果。当用户需要对庞大的宏基因组数据集进行分析时，使用户能够全面、快速、灵活地获取到直观的微生物的相关信息。
-
公开(公告)号：CN119541634A
公开(公告)日：2025-02-28
申请号：CN202411599910.6
申请日：2024-11-11
Applicant: 东北林业大学
IPC: G16B20/40 , C12Q1/6869 , C12Q1/6888 , C12N15/11 , G16B25/00 , G16B30/10 , G16B45/00
Abstract: 一种单独使用全基因组重测序数据进行杂交检测的方法，属于分子生物学技术领域。本发明为解决现有技术中杂交检测的方法存在高成本、准确率较低、需要纯父母本参考基因组信息的技术问题，提供了一种基于核线粒体DNA重测序数据检测杂交个体的方法，所述方法基于目标个体的全基因组重测序数据与核线粒体DNA片段，根据核线粒体DNA片段与其线粒体同源片段之间的遗传距离数据集所绘制的折线图进行杂交检测结果的判断。本发明提供的杂交个体的检测方法具有较高的准确性，规避了需要设计对父母本都有效的遗传标记的技术难题，以及无需检测目标个体的纯父母本参考基因组，降低了检测成本，扩大了适用范围。
-
公开(公告)号：CN119510374A
公开(公告)日：2025-02-25
申请号：CN202411672200.1
申请日：2024-11-21
Applicant: 中国药科大学
Abstract: 本发明涉及一种荧光阵列传感器，具体涉及一种含改性高分子聚合物的双功能荧光阵列传感器、其制备方法及其在细菌检测以及发酵性碳水化合物检测中的应用。本发明的阵列传感器含有至少2个不同荧光传感单元，所述的荧光传感单元是由PN与香豆素染料通过共价相互作用形成PN‑香豆素染料复合物，所述PN为硝基苯硼酸修饰的高分子聚合物PEI，所述香豆素染料为6,7‑二羟基‑2H‑苯并吡喃‑2‑酮ES或4‑甲基七叶亭MS。本发明公开的复合物荧光阵列传感器可以同时实现十三种肠易激综合征(IBS)相关类型细菌以及十四种FODMAPs的区分检测，具灵敏度高、检测时间短、成本低、重复性好、准确度高且无需专业技术人员等优点。
-
公开(公告)号：CN119487578A
公开(公告)日：2025-02-18
申请号：CN202380050831.7
申请日：2023-06-27
Applicant: 皇家飞利浦有限公司
Abstract: 一种用于对患者的肿瘤的异质性进行可视化的方法(100)，包括：(i)接收(120)关于患者的信息，所接收的信息包括关于所述患者的人口统计信息和临床信息、对所述患者的肿瘤类型的识别，以及对所述患者的肿瘤的异质性评估；(ii)基于对所述患者的肿瘤类型的所述识别和对所述患者的肿瘤的所述异质性评估来获得(130)针对所述肿瘤的两个或更多个亚克隆中的每个亚克隆的治疗效果信息；(iii)生成(140)对所述患者的肿瘤的所述异质性评估和所获得的针对所述肿瘤的所述两个或更多个亚克隆中的每个亚克隆的治疗效果信息的视觉表示；并且(iv)经由所述系统的用户接口提供(150)所生成的视觉表示，其中，所述视觉表示包括肿瘤异质性图形和治疗效果图形。
-
公开(公告)号：CN119433056A
公开(公告)日：2025-02-14
申请号：CN202411923441.9
申请日：2024-12-25
Applicant: 中国农业大学
Abstract: 本发明涉及基因分子育种领域，公开了一种长白猪生长繁殖SNP分子标记及其应用，其特征在于，所述长白猪SNP分子标记由306个SNP分子标记组成，所述306个SNP分子标记的物理位置是基于猪的参考基因组Sscrofa11.1进行序列比对确定的；所述SNP分子标记位点信息具体如说明书表1所示。其有益效果为：本发明提供的长白猪生长繁殖SNP分子标记可用于长白猪低成本且大规模的基因分型，基于液相芯片技术，位点灵活，后期可随时增加新的功能标记位点。
-
公开(公告)号：CN119432987A
公开(公告)日：2025-02-14
申请号：CN202411487121.3
申请日：2024-10-24
Applicant: 青岛大学
Abstract: 本发明属于生物信息学技术领域，具体涉及一种基于空间转录组技术的4D打印干细胞载体改善糖尿病皮肤损伤分析方法，首先，分别对PBS处理组的组织和联合治疗组的组织进行空间转录组测序，然后，进行细胞聚类和细胞注释，鉴定主要细胞类型后，可视化两组细胞类型的空间分布，统计量化各种细胞类型的数量占比，最后，对差异基因显著的细胞亚群进行富集分析并验证，其通过4D打印干细胞载体结合pRNA抑制剂及干细胞的联合治疗方案，展示伤口愈合过程中细胞的空间分布和动态变化，揭示细胞在组织中的精确位置和基因表达模式，对于理解生物材料在促进糖尿病性损伤愈合的复杂生物学过程至关重要，同时，能够为后续药物开发提供新思路。
-
公开(公告)号：CN114694754B
公开(公告)日：2025-02-11
申请号：CN202210411315.X
申请日：2022-04-19
Applicant: 中国医学科学院医学实验动物研究所
Abstract: 本发明公开了一种基于图的多序列比对方法、系统、设备和计算机可读存储介质，方法其包括：获取一组泛基因组序列数据，对所述泛基因组序列数据进行构图，得到泛基因组的着色图；标记并获取所述着色图单个结点的访问状态的特征，遍历所述着色图得到将所述着色图分解后的cSupB数据模型；获取着色图分解后的cSupB数据模型，提取所述cSupB数据模型中结点的偏移值数据特征；基于所述偏移值数据特征对所述cSupB数据模型进行第一次预处理，得到所述cSupB数据模型的初始比对结果。本发明克服了目前在面对大量测序样本基因组时，传统的多序列比对方式无法满足现状的问题。
-
公开(公告)号：CN119339801A
公开(公告)日：2025-01-21
申请号：CN202410768242.9
申请日：2024-06-14
Applicant: 北京金匙医学检验实验室有限公司 , 天津金匙医学科技有限公司 , 天津华智诺科技有限公司
Abstract: 本申请涉及生物信息学技术领域，具体公开一种目标病原特异性核心基因组序列的筛选方法及其模型。本申请针对不同目标病原，基于基因组序列通过与选定参考基因组序列直接比对，统计基因组不同区域覆盖深度和覆盖基因组数目等，筛选目标病原核心基因组区域序列；再将核心基因组区域序列与人参考基因组序列、目标病原同科其他所有物种参考基因组序列及NT库比对，过滤得到最终目标病原特异性序列。本申请能够筛选出高覆盖率、高拷倍数的特异性核心序列，同时具有高效简单和耗时短的优势。
-
公开(公告)号：CN118800333B
公开(公告)日：2025-01-21
申请号：CN202411288391.1
申请日：2024-09-14
Applicant: 北京百奥益康医药科技有限公司
Abstract: 本发明提供了一种获得非模式物种T细胞受体TCR多样性信息的方法，包括：获取非模式目标物种的参考基因组数据和同源物种的TCR数据并进行整理和注释，获得目标物种的TCR数据；使用TCR数据创建参考数据库；基于TCR数据确定引物设计区域并针对该区域设计引物从而靶向扩增目标物种的TCR区域，由此构建得到目标物种的TCR文库并测序和分析，获得目标物种的TCR多样性信息。本发明还涉及用于单细胞TCR组库构建的引物及其应用。本发明方法可应用于TCR信息未知或信息不全的非模式物种，使TCR组库研究不再局限于特定物种，所设计的引物组具有物种特异性且覆盖TCR区域，提高了TCR多样性信息分析的完整性和准确性。
-
公开(公告)号：CN118006784B
公开(公告)日：2025-01-21
申请号：CN202410236627.0
申请日：2024-03-01
Applicant: 江苏先声医学诊断有限公司 , 江苏先声诊断医疗器械有限公司 , 北京先声医学检验实验室有限公司
IPC: C12Q1/6886 , G16B20/20 , G16B20/50 , G16B20/30 , G16B45/00
Abstract: 本申请涉及分子诊断技术领域，具体提供一种DNA复制晚期区域在泛癌种诊断中的应用。本申请通过多种组学数据发现DNA复制晚期区域在肿瘤中呈现DNA低甲基化，高突变频率，且在肿瘤cfDNA中呈现更高的片段短长比和独特的末端模体特征。这个现象存在于多个癌种中，属于泛癌种标志物，基于此建立泛癌种的诊断方法和应用。
