一种HMO高利用率菌株的筛选方法以及高HMO利用率菌株

    公开(公告)号:CN117925771A

    公开(公告)日:2024-04-26

    申请号:CN202410120360.9

    申请日:2024-01-29

    IPC分类号: C12Q1/04 C12N1/20 C12R1/01

    摘要: 本发明公开了一种HMO高利用率菌株的筛选方法和得到的高HMO利用率的菌株,该方法简单快捷,筛选一目了然,可以用于HMO为唯一碳源的利用率筛选,也可以用于其他碳源作为唯一碳源的利用率筛选;该方法避免了厌氧菌在生长曲线测定过程中反复取放引起氧气后对菌株生长造成的影响,为严格厌氧菌的生长曲线测定提供了一种可行的实验方案。本发明筛选的长双歧杆菌婴儿亚种Dipro F能够高效利用HMO,相比市场所售的婴幼儿可食用名单菌株具有更优的HMO利用效率,经过全基因组测序确定了HMO利用机制,菌株经实验验证不存在安全隐患。

    基于肠道微生物信息的过敏预测模型构建方法

    公开(公告)号:CN115881229A

    公开(公告)日:2023-03-31

    申请号:CN202211623297.8

    申请日:2022-12-16

    摘要: 本发明提供了一种基于肠道微生物信息的过敏预测模型构建方法,对受试者的过敏性病史和临床表征信息进行收集,获取肠道微生物原始序列数据并进行注释分析,从而筛选出肠道微生物的物种组成表,选择最优的特征变量合集,构建预测模型并选择出最优过敏预测模型。本发明利用了机器学习的方式来建立预测过敏的模型,只需要获取受试者的粪便样本即可,不需要对受试者机体造成可能的伤害;此外,建立的基于肠道微生物菌群的预测模型,预测准确率较高,灵敏度和特异性较好,能有效的区分多个样本中过敏与否的结果,为早期预防受试者是否会发生过敏而提供有效的证据。

    基于比较基因组的双歧杆菌三重绝对定量荧光PCR核酸检测试剂盒

    公开(公告)号:CN118480615A

    公开(公告)日:2024-08-13

    申请号:CN202410596250.X

    申请日:2024-05-14

    摘要: 本发明公开了能同时检测长双歧杆菌长亚种、长双歧杆菌婴儿亚种和短双歧杆菌的引物探针组合、其检测试剂盒。本发明还公开了基于比较基因组的长双歧杆菌长亚种、长双歧杆菌婴儿亚种和短双歧杆菌的三重绝对定量荧光PCR检测方法。本发明的引物探针组合及其检测试剂盒具备良好的特异性及灵敏度,特异性可做到双歧杆菌种及亚种的检测,灵敏度达到5拷贝/μl,可用于复杂微生态群落样本的检测。本发明实现了单孔内对三个靶标基因的检测,极大的减少了检测成本,提升了检测效率。本发明的引物探针组合及其检测试剂盒不仅可做到定性检测,也实现了长双歧杆菌长亚种、长双歧杆菌婴儿亚种、短双歧杆菌在种水平的三重绝对定量检测。

    基于肠道微生物信息的过敏预测模型构建方法

    公开(公告)号:CN115881229B

    公开(公告)日:2024-01-09

    申请号:CN202211623297.8

    申请日:2022-12-16

    摘要: 本发明提供了一种基于肠道微生物信息的过敏预测模型构建方法,对受试者的过敏性病史和临床表征信息进行收集,获取肠道微生物原始序列数据并进行注释分析,从而筛选出肠道微生物的物种组成表,选择最优的特征变量合集,构建预测模型并选择出最优过敏预测模型。本发明利用了机器学习的方式来建立预测过敏的模型,只需要获取受试者的粪便样本即可,不需要对受试者机体造成可能的伤害;此外,建立的基于肠道微生物菌群的预测模型,预测准确率较高,灵敏度和特异性较好,能有效的区分多个样本中过敏与否的结果,为早期预防受试者是否会发生过敏而提供有效的证据。(56)对比文件袁凯琦;邓扬;陈道源;张冰;雷凯.医学知识图谱构建技术与研究进展.计算机应用研究.2017,(第07期),第15-22页.

    基于肠道微生物的宿主生命早期年龄预测模型构建方法

    公开(公告)号:CN116153414A

    公开(公告)日:2023-05-23

    申请号:CN202310130546.8

    申请日:2023-02-17

    IPC分类号: G16B40/00 G06F18/2431

    摘要: 本发明提供了一种基于肠道微生物的宿主生命早期年龄预测模型构建方法,通过收集涉及生命早期的肠道微生物测序原始数据及其宿主的背景信息,获得构建年龄预测模型的肠道微生物相对丰度信息表,进行微生物特征选择,并构建年龄预测模型验证,利用年龄预测模型对将要预测的样本数据进行年龄预测。本发明基于宿主生命早期肠道微生物群落变化与宿主发育之间的关系,利用肠道微生物在宿主生命早期发挥的重要作用以及不断发育的特点,构建了基于肠道微生物的宿主生命早期年龄预测模型,以及获取在宿主生命早期重要的肠道微生物标志物信息,作为宿主生命早期健康状态评价指标之一;构建的模型预测效果更好、精度越高。

    一种用于假小链双歧杆菌的定量检测方法及其核酸检测试剂盒

    公开(公告)号:CN117248040A

    公开(公告)日:2023-12-19

    申请号:CN202311060293.8

    申请日:2023-08-21

    摘要: 本发明公开了检测假小链双歧杆菌的特异性引物对,本发明还公开了一种基因片段和一种阳性标准质控品以及含有所述的引物对的检测假小链双歧杆菌的试剂盒及其相关应用。本发明还公开了一种检测假小链双歧杆菌的方法。本发明通过泛基因组和核心基因组分析,建立了特定菌种的基因组特异性序列筛选方法,并应用于假小链双歧杆菌特异性引物对的设计,且该引物具备良好的特异性及灵敏度,可用于复杂微生态群落样本的检测,灵敏度达到100拷贝/检测孔。实现了假小链双歧杆菌在种水平的绝对定量检测,将该检测方法应用于微生态样品的检测,并具备良好的特异性和灵敏度。