一种菌群互作网络构建、剪裁方法与系统及核心菌群标志物和应用

    公开(公告)号:CN118471344A

    公开(公告)日:2024-08-09

    申请号:CN202410623361.5

    申请日:2024-05-20

    IPC分类号: G16B40/00 G16B45/00 G16H70/20

    摘要: 本发明提供了一种菌群互作网络构建、剪裁方法与系统及核心菌群结构应用,本发明通过对群体肠道微生物组成信息的收集,构建群体的菌群组成数据,经过分析细菌间的共发现频次和基于概率的理论频次进行比较,确定细菌间的有益和有害关联,构建出细菌间互作的复杂网络。进一步通过对菌群互作网络的迭代裁剪和优化,最终确定群体微生态中的核心细菌组成。应用该算法功能性便秘儿童的菌群网络分析研究,发现了25个便秘相关的核心菌群标志物,并且通过机器学习算法验证25个标志物的分类模型区分便秘儿童和正常儿童,模型的AUC能到达85.2%。本发明通过一种网络构建和分析算法挖掘出特定人群的核心菌群标志物,为肠道微生态的临床应用研究提供新的方法。