跨断点进行染色体微缺失分析的方法、装置、设备及存储介质

    公开(公告)号:CN114220482A

    公开(公告)日:2022-03-22

    申请号:CN202111461943.0

    申请日:2021-12-02

    Abstract: 本发明涉及一种跨断点进行染色体微缺失分析的方法、装置、设备及存储介质。上述染色体微缺失分析的方法和装置,对父方和母方的基因测序结果进行分析,获得染色体缺失信息,根据该缺失信息分析断点位置,将参考胚胎样本测序信息与该缺失信息进行比对,选取携带型胚胎。根据父方、母方和携带型胚胎在断点位置的上游和下游预设范围内的含有多个SNP位点的区域,进行家系连锁分析,确定正常单体型,再将待测胚胎与之比对,则能准确选取出正常胚胎。该染色体微缺失的分析方法能够精确分析出染色体断点,在此基础上结合断点上游和下游的SNP位点能够准确判断胚胎的染色体缺失情况,该分析方法操作简便,结果判断准确。

    跨断点进行染色体微缺失分析的方法、装置、设备及存储介质

    公开(公告)号:CN114220482B

    公开(公告)日:2024-11-15

    申请号:CN202111461943.0

    申请日:2021-12-02

    Abstract: 本发明涉及一种跨断点进行染色体微缺失分析的方法、装置、设备及存储介质。上述染色体微缺失分析的方法和装置,对父方和母方的基因测序结果进行分析,获得染色体缺失信息,根据该缺失信息分析断点位置,将参考胚胎样本测序信息与该缺失信息进行比对,选取携带型胚胎。根据父方、母方和携带型胚胎在断点位置的上游和下游预设范围内的含有多个SNP位点的区域,进行家系连锁分析,确定正常单体型,再将待测胚胎与之比对,则能准确选取出正常胚胎。该染色体微缺失的分析方法能够精确分析出染色体断点,在此基础上结合断点上游和下游的SNP位点能够准确判断胚胎的染色体缺失情况,该分析方法操作简便,结果判断准确。

    一种构建CNV检测文库的方法及CNV检测方法

    公开(公告)号:CN114457143B

    公开(公告)日:2024-07-09

    申请号:CN202210258037.9

    申请日:2022-03-16

    Abstract: 本发明公开了一种构建CNV检测文库的方法及CNV检测方法。所述方法包括:采用双核酸内切酶组合对样本基因组DNA进行切割得到酶切产物,将所述酶切产物与测序接头连接,得到连接产物;对所述连接产物进行PCR扩增,得到测序文库,所述双核酸内切酶组合包括MboI、MseI、BfaI或ApoI‑HF中任意2种的组合。本发明的文库构建方法,能够用较少的数据量(测序成本)对全基因组部分代表性区域进行高深度测序,获得高密度和覆盖均一的足量能进行CNV分析的SNP位点。通过CNV组合分析策略实现同时对多种CNV变异类型的检测,包括染色体非整倍体、重复缺失、单倍体、三倍体、多倍体、LOH、UPD等。

    一种一体化文库构建的方法及其应用

    公开(公告)号:CN117683853A

    公开(公告)日:2024-03-12

    申请号:CN202311681283.6

    申请日:2023-12-08

    Abstract: 本发明公开了一种一体化文库构建的方法及其应用。所述方法包括:使用第一核酸内切酶和第二核酸内切酶对基因组DNA进行酶切得到酶切产物,将酶切产物与测序接头连接,得到连接产物,将筛选后的连接产物与多重PCR扩增得到的扩增子库混合,使用引物进行文库PCR反应,即得所述一体化核酸文库;所述第一核酸内切酶包括BfaI;所述第二核酸内切酶包括MboI;所述多重PCR扩增子库由一端含有BfaI酶切位点识别序列,另一端含有MboI酶切位点识别序列的DNA片段组成。本发明方法实现了在均匀覆盖全基因组CNV和SNP的同时,对漏检遗传病区域进行针对性的捕获富集,提供了一种更完善和准确的一体化高通量测序检测方法。

    用于检测mRNA可变剪切变异的试剂盒、建库方法和测序方法

    公开(公告)号:CN114317685B

    公开(公告)日:2023-10-20

    申请号:CN202210008651.X

    申请日:2022-01-05

    Abstract: 本发明涉及用于检测mRNA可变剪切变异的试剂盒、建库方法和测序方法,试剂盒包括用于扩增靶基因目的片段的特异性上游引物和特异性下游引物,目的片段包含mRNA可变剪切变异片段,特异性上游引物的3’端互补配对于mRNA可变剪切变异片段相邻的第一外显子区域,特异性下游引物的3’端互补配对于mRNA可变剪切变异片段相邻的第二外显子区域,以使得目的片段的起始位置位于第一外显子区域内,目的片段的终止位置位于第二外显子区域内。本发明的试剂盒通过设计靶基因目的片段的引物对待测样本cDNA一步扩增、建库,并对扩增产物进行上机测序,能够获取靶基因发生mRNA可变剪切变异形成的异常转录本序列信息以及异常转录本比例,提高了mRNA可变剪切变异的检测效率。

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