一种针对于无创产前诊断领域的新型捕获探针及其设计方法和应用

    公开(公告)号:CN116959574A

    公开(公告)日:2023-10-27

    申请号:CN202310941767.3

    申请日:2023-07-28

    Abstract: 本发明公开了一种针对无创产前诊断领域的新型捕获探针及其设计方法和应用。所述方法包括:针对于无创产前诊断领域,确定目标基因区域内的SNP位点序列,根据SNP位点序列设计捕获探针,捕获探针上对应SNP位点处的碱基缺失。本发明开发新型的捕获探针设计方法,针对于杂合位点,引入此位点的捕获探针上的碱基缺失突变,使得捕获探针与杂合位点结合无偏好性,捕获效率保持一致,在无创产前检测时,用于亲本DNA,先症者DNA,胎儿游离DNA中目标区域的捕获,降低捕获文库偏好性的同时,探针的捕获位点丰富度和通用性也得到提升。

    围绝经期经激素治疗后乳腺癌风险相关的SNP位点的检测试剂及其应用

    公开(公告)号:CN119842894A

    公开(公告)日:2025-04-18

    申请号:CN202411973177.X

    申请日:2024-12-30

    Abstract: 本申请属于基因检测技术领域,具体涉及一种围绝经期经激素治疗后乳腺癌风险相关的SNP位点的检测试剂及其应用。本申请通过与特定表型相关的SNP位点组合的筛选和进一步的分析去重复,筛选出了与激素治疗后乳腺癌患病风险相关的SNP位点组合,进一步进行多重迭代筛选最优位点集合,最终得到128个的SNP有效位点,并以此提供一种围绝经期经激素治疗后乳腺癌风险相关的SNP位点的检测试剂。基于本研究获得SNP位点,可有效预测围绝经期女性经激素治疗后患乳腺癌的风险,可对围绝经期女性的治疗手段进行参考,向临床医生提供精准化诊疗意见。

    一种基于二代测序数据对HLA-DRB基因进行分型的方法及应用

    公开(公告)号:CN117542412A

    公开(公告)日:2024-02-09

    申请号:CN202311495522.9

    申请日:2023-11-10

    Abstract: 本发明公开了一种基于二代测序数据对HLA‑DRB基因进行分型的方法及应用。所述方法包括:测序数据质控,初步分型和校正分型;所述数据质控包括测序reads统计和目标区域统计;所述初步分型包括构建参考基因组,reads比对和权重打分,HLA‑DRB基因拷贝数评估,单个等位基因的筛选和等位基因对的筛选;所述校正分型包括组装consensus序列,序列比对,校正分型结果和提示变异;所述HLA‑DRB基因包括HLA‑DRB3基因、HLA‑DRB4基因和HLA‑DRB5基因中的任意一种或至少两种的组合。本发明能够准确判断包括DRB3/4/5在内的15个基因的拷贝数,与已知分型结果100%一致,再结合等位基因对的打分和筛选规则,DRB3/4/5六位分型结果的准确率分别从85%,98%,96%提升至100%。

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