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公开(公告)号：CN110678559B
公开(公告)日：2023-09-15
申请号：CN201880034913.1
申请日：2018-07-06
申请人： 深圳华大智造科技股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/6869 , C07H21/00
摘要： 核酸探针以及边连接边测序的核酸测序方法，上述核酸探针为DNA测序探针，其包含第一部分、第二部分、连接体和可检测的标记物，第一部分的碱基为A、T、U、C或G，第二部分的碱基为随机碱基和/或通用碱基，并且至少为3个碱基，第一部分和第二部分通过连接体连接，并且第一部分和连接体之间的连接能够被切断，可检测的标记物连接在第二部分或者连接体上。上述探针或将其组合或者测序方法能够降低测序中的探针数量或种类，从而降低成本。
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公开(公告)号：CN109937259B
公开(公告)日：2023-01-13
申请号：CN201780068192.1
申请日：2017-01-10
申请人： 深圳华大智造科技股份有限公司(CN)
IPC分类号： C12Q1/6869
摘要： 公开了一种提高核酸聚合测序质量的方法、反应体系和试剂盒。本申请的提高核酸聚合测序质量的方法，包括在聚合测序的反应液中加入第二类核苷酸，第二类核苷酸的3’糖羟基具有阻断修饰但没有荧光修饰。
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公开(公告)号：CN114958998A
公开(公告)日：2022-08-30
申请号：CN202210627105.4
申请日：2017-01-10
申请人： 深圳华大智造科技股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/6869
摘要： 本申请公开了一种提高核酸聚合测序质量的方法、反应体系和试剂盒。本申请的提高核酸聚合测序质量的方法，包括在聚合测序的反应液中加入第二类核苷酸，第二类核苷酸具有在3’糖羟基上的阻断修饰但没有荧光修饰。本申请的提高核酸聚合测序质量的方法，在其反应液中添加仅仅具有阻断修饰的dNTPs，由于这类dNTPs没有荧光修饰，更利于DNA聚合酶识别和合成，能够补充反应不完全的部分，提高合成反应的效率，降低反应不充分的风险；与此同时，由于没有荧光修饰，降低了因荧光切除不干净，或者切除的荧光洗脱不干净导致的信号干扰，提高了切除效率，降低了测序错误率。
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公开(公告)号：CN109652501B
公开(公告)日：2022-06-07
申请号：CN201710948000.8
申请日：2017-10-12
申请人： 深圳华大智造科技股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/6816 , C12Q1/34
摘要： 本发明公开了一种检测核酸酶对特定碱基3'‑5'外切活性的方法和试剂盒。本发明首次提出检测酶对特定碱基的外切活性；利用该发明可以检测任一碱基，包括dATP、dCTP、dGTP、dTTP、dUTP以及简并碱基等，应用范围十分广泛；该发明可以检测大多数核酸酶的3’‑5’外切活性；使用荧光作为检测信号，避免了放射性污染，且灵敏度高；无需荧光基团修饰的核苷酸链，成本低；可以用来快速大量地筛选核酸酶，应用灵活，通量高。
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公开(公告)号：CN108265111B
公开(公告)日：2022-01-18
申请号：CN201611245066.2
申请日：2016-12-29
申请人： 深圳华大智造科技股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12N15/10
摘要： 本发明提供了一种用于双末端测序的反应体系、其组成的试剂盒和应用，具体涉及一种提高双末端测序质量的反应体系、其组成的试剂盒和提高双末端测序质量的方法，所述反应体系包括1×Phi29 buffer、dNTP、Phi29聚合酶和PCR增强剂。本发明在生成互补链的反应体系中添加组合的PCR增强剂，通过甘油、DMSO、Triton X‑100、海藻糖和甜菜碱之间相互促进，发挥了协同增效的作用，能明显提高互补链合成的效率，提高测序的准确度，测序的平均信号值提高了1.1倍；同时采用CTAB处理生成的互补链，限制了Phi29酶的外切活性，显著降低了Lag&Runon值。
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公开(公告)号：CN108239669B
公开(公告)日：2021-03-16
申请号：CN201611208173.8
申请日：2016-12-23
申请人： 深圳华大智造科技股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/6851
摘要： 本发明公开了一种检测可逆性阻断dNTP中非阻断杂质含量的方法和试剂盒，该方法包括：(a)获取至少一装载有核酸的芯片和至少一已知序列，该已知序列与核酸上的部分序列互补；形成互补后，核酸在沿已知序列的延伸方向上紧接有两个特异的待测碱基，第一个碱基与待检测的可逆性阻断dNTP互补，第二个碱基与带荧光的dNTP互补；(b)在DNA聚合酶的作用下，首先至少加入待检测的可逆性阻断dNTP，使已知序列延伸一个碱基；然后加入带荧光的dNTP，使至少部分序列继续延伸一个碱基；(c)采集反应后产物的荧光信号，并根据荧光信号的强度推算出待检测的可逆性阻断dNTP中非阻断杂质的含量。本发明的方法能够进一步评估可逆性阻断dNTP的纯度，并且精确度更高。
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公开(公告)号：CN111278974B
公开(公告)日：2024-06-11
申请号：CN201780096314.8
申请日：2017-11-09
申请人： 深圳华大智造科技股份有限公司
IPC分类号： C12N15/11 , C12N15/10 , C12Q1/6806 , C40B50/06
摘要： 本发明提供了一种钩状探针、核酸连接方法以及测序文库的构建方法，所述钩状探针包括目标特定区域和相连的钩区域，所述目标特定区域包括与待连接的核酸片段的至少部分单链互补配对的序列，所述钩区域包括与所述核酸片段不配对的序列，所述钩区域的末端是可连接末端，所述可连接末端能够连接到所述核酸片段的单链末端。
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公开(公告)号：CN111718849B
公开(公告)日：2024-04-30
申请号：CN201910210101.4
申请日：2019-03-19
申请人： 深圳华大智造科技股份有限公司
摘要： 本发明提供一种加载促进装置，所述加载促进装置包括一电场提供器，所述电场提供器用于收容至少一测序芯片并施加电场于所述测序芯片，使加载至所述测序芯片的核酸分子加速加载至所述测序芯片上的特异性修饰区域。本发明还提供一种加载装置，利用本发明，能显著缩短加载时间，同时提升核酸分子与测序芯片特异性修饰区域结合的比率，减少核酸分子样品的使用量。
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公开(公告)号：CN111286527B
公开(公告)日：2024-03-19
申请号：CN201811503942.6
申请日：2018-12-10
申请人： 深圳华大智造科技股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/6874
摘要： 一种合成DNA纳米球互补链的方法和测序方法，其中合成DNA纳米球互补链的方法包括：使用酶处理DNA纳米球的一链测序后的产物，其中一链测序的引物上有修饰，酶处理后，修饰被酶破坏使得引物被消化；使用多重置换扩增引物与上一步的产物进行杂交，其中多重置换扩增引物至少包括第一引物，该第一引物与一链测序的引物结合区域全部或部分互补；和在具有链置换功能的聚合酶作用下，以多重置换扩增引物和一链为引物，进行链置换反应生成DNA纳米球的互补链。本发明的方法在MDA之前，将占位的一链引物除去，空出位置来进行MDA引物杂交，因此增加了杂交引物量，从而增加DNB拷贝数。
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公开(公告)号：CN115927566A
公开(公告)日：2023-04-07
申请号：CN202211321287.9
申请日：2017-09-20
申请人： 深圳华大智造科技股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/6869
摘要： 本申请公开了一种用于Small RNA的测序方法、测序试剂和应用。本申请用于Small RNA的测序方法，包括在对混合样本的环状文库进行测序时，向引物溶液中添加正常测序引物和阻断测序引物，采用混合引物进行测序；阻断测序引物由正常测序引物3’末端羟基经化学修饰而成。本申请的测序方法，通过添加阻断测序引物，使得混合样本环状文库Small RNA测序得以实现，并能有效的保障标签序列的测序，进而提高了数据利用率，得到良好的拆分率。本申请的Small RNA测序方法和测序试剂，为Small RNA混合样本测序提供了一种新的思路和方案，解决了目前的环状文库Small RNA测序的测序资源浪费等问题。
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