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公开(公告)号：CN113249436B
公开(公告)日：2024-08-23
申请号：CN202011271732.6
申请日：2020-11-13
申请人： 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12Q1/689 , C12Q1/6895 , C12Q1/6893 , C12Q1/70 , C12Q1/04 , C12Q1/14 , C12R1/22 , C12R1/445 , C12R1/46 , C12R1/725 , C12R1/72 , C12R1/01 , C12R1/93 , C12R1/225 , C12R1/90
摘要： 本发明涉及一种降低生物样本中宿主核酸的方法和应用，属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤：1)将生物样本在温和的条件下进行样本前处理，部分裂解和/或不裂解宿主细胞膜，得液体样本；2)取上述液体样本，添加核酸消化试剂，降解暴露在溶液中的宿主核酸。采用该方法，可降低生物样本中宿主核酸，对细菌、真菌、病毒、支/衣原体等目标无选择地进行富集，既提高了检测灵敏度，降低了假阴率，又降低了检测成本。
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公开(公告)号：CN111462821B
公开(公告)日：2022-02-22
申请号：CN202010281509.3
申请日：2020-04-10
申请人： 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
IPC分类号： G16B30/00
摘要： 本发明涉及一种病原微生物分析鉴定系统及应用，属于基因检测分析技术领域。该病原微生物分析鉴定系统包括：数据获取模块：用于获取高通量测序得到的基因测序数据；数据过滤模块：用于将依次进行低质量序列过滤、宿主序列过滤；数据比对模块：用于将序列比对至病原微生物基因组数据库中；物种比对模块：用于统计待分析序列；数据分析模块：用于计算共有比对序列集中各序列对比上每一个物种的相似度S和平均相似度值SMSi；物种序列模块：用于计算物种的总比对序列数SNTi；结果输出模块：用于进行生物信息学分析，得到病原微生物分析鉴定结果。该病原微生物分析鉴定系统不仅具有分析时间短、准确性高的优点；还可准确得检测混合感染，获得具体病原体信息。
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公开(公告)号：CN111445955B
公开(公告)日：2021-09-10
申请号：CN202010280808.5
申请日：2020-04-10
申请人： 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
IPC分类号： G16B30/10
摘要： 本发明涉及一种新型冠状病毒变异分析方法及应用，属于基因测序分析技术领域。该方法包括数据获取、数据过滤、数据比对、变异检测、坐标分析、坐标校正和变异注释步骤。该方法不仅可以对纯病毒培养物测序数据进行变异检测，还可以对宏基因组测序数据进行变异检测，使用范围更广。同时还能准确对核糖体移码进行注释，以及对联合突变进行准确注释，提高了变异检测的准确率。此外还可以对病毒变异进行动态监测。
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公开(公告)号：CN111445955A
公开(公告)日：2020-07-24
申请号：CN202010280808.5
申请日：2020-04-10
申请人： 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司
IPC分类号： G16B30/10
摘要： 本发明涉及一种新型冠状病毒变异分析方法及应用，属于基因测序分析技术领域。该方法包括数据获取、数据过滤、数据比对、变异检测、坐标分析、坐标校正和变异注释步骤。该方法不仅可以对纯病毒培养物测序数据进行变异检测，还可以对宏基因组测序数据进行变异检测，使用范围更广。同时还能准确对核糖体移码进行注释，以及对联合突变进行准确注释，提高了变异检测的准确率。此外还可以对病毒变异进行动态监测。
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公开(公告)号：CN110804669B
公开(公告)日：2022-12-16
申请号：CN201911192004.3
申请日：2019-11-28
申请人： 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/35
摘要： 本发明涉及一种用于肺炎支原体的CRISPR检测引物组及其用途，属于CRISPR技术的基因检测技术领域。该引物组包括扩增引物对和crRNA；所述扩增引物对用于扩增肺炎支原体如SEQ ID NO.1所示序列；所述crRNA包括锚定序列和向导序列，所述锚定序列与Cas蛋白特异性识别，所述向导序列与所述SEQ ID NO.1序列中的靶向序列片段相匹配。采用该引物组以CRISPR技术检测肺炎支原体，缩短了肺炎支原体的检测时间，可在60min内完成检测。本发明通过筛选得到了特定的序列组合作为引物组进行检测，具有灵敏性高、特异性强的优势，其检测限可达30copies。并且采用该引物组对肺炎支原体进行CRISPR检测，摆脱了对qPCR仪等复杂变温扩增仪器的依赖，使得CRISPR‑Cas技术在肺炎支原体的即时诊断方面具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN110791578B
公开(公告)日：2022-12-16
申请号：CN201911190860.5
申请日：2019-11-28
申请人： 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/01
摘要： 本发明涉及一种用于百日咳博德特氏杆菌的CRISPR检测引物组及其用途，属于CRISPR技术的基因检测技术领域。该引物组包括扩增引物对和crRNA；所述扩增引物对用于扩增百日咳博德特氏杆菌如SEQ ID NO.1所示序列；所述crRNA包括锚定序列和向导序列，所述锚定序列与Cas蛋白特异性识别，所述向导序列与所述SEQ ID NO.1序列中的靶向序列片段相匹配。采用该引物组以CRISPR技术检测百日咳博德特氏杆菌，缩短了百日咳的检测时间，可在60min内完成检测。本发明通过筛选得到了特定的序列组合作为引物组进行检测，具有灵敏性高、特异性强的优势，其检测限可达3copies。并且采用该引物组对百日咳博德特氏杆菌进行CRISPR检测，摆脱了对qPCR仪等复杂变温扩增仪器的依赖，具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN113284560B
公开(公告)日：2022-05-17
申请号：CN202110466657.7
申请日：2021-04-28
申请人： 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
摘要： 本发明涉及一种病原检测背景微生物判断方法及应用，属于生物信息学分析技术领域。该判断方法包括以下步骤：确定核心背景微生物列表：取若干生物样本，将其中各微生物基因序列数据比对至相应微生物的特征序列区域，与核酸提取浓度或文库浓度进行相关性检验，得到相关性呈负相关的微生物列表，得核心背景微生物列表；确定核心背景微生物校正指数CBI：以上述核心背景微生物列表中所有微生物的特异性比对序列数之和为CBI；背景序列判断：将待测样本中微生物的特异性比对序列数与所述CBI相除得判断值。采用该方法可以背景微生物指数的大小来校正背景相关微生物，根据校正后的量来判断样本中该病原微生物是否存在，能够更为准确的判断结果。
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公开(公告)号：CN112708660A
公开(公告)日：2021-04-27
申请号：CN201911017285.9
申请日：2019-10-24
申请人： 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
IPC分类号： C12Q1/6844 , C12Q1/689 , C12Q1/14 , C12R1/46
摘要： 本发明涉及一种CRISPR‑POCT检测组合物及其应用，属于医学检测技术领域。该检测组合物包括：探针，包括依次连接的示踪部、识别切割区和固定相；所述示踪部包括标记示踪物和第一结合物，所述识别切割区根据CRISPR系统的Cas酶识别序列设计，为可被CRISPR系统识别酶切的RNA或DNA；试纸条，含有可与所述第一结合物特异性结合的第二结合物。该检测组合物，通过将探针进行固化，不让其完全进入试纸条检测系统中，可以避免因探针过量而造成的假阳性结果。与常规方法相比，提高了检测准确性，降低了假阳率，且具有较好的质控效果。
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公开(公告)号：CN111455021B
公开(公告)日：2024-06-04
申请号：CN201910047978.6
申请日：2019-01-18
申请人： 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806
摘要： 本发明涉及一种去除宏基因组中宿主DNA的方法及试剂盒，属于微生物基因检测技术领域。该方法包括以下步骤：DNA片段化：将宿主基因组DNA进行片段化处理，得到宿主DNA片段；氨基化：对上述宿主DNA片段进行氨基化处理；偶联磁珠：将上述经氨基化处理的宿主DNA片段与磁珠偶联，得捕获磁珠；杂交捕获：将待测样本采用上述方法进行DNA片段化，加入上述制备得到的捕获磁珠，进行杂交反应，磁力吸附磁珠，转移上清液，即得去除宿主DNA的待测宏基因组样本。上述方法通过将片段化的宿主DNA氨基化后，偶联到磁珠上，再通过磁珠与宏基因组样本核酸杂交的方式，把宏基因组样本核酸中的宿主源DNA分离开，从而使宏基因组样本核酸中病原微生物核酸的占比大大提高。
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公开(公告)号：CN112813196B
公开(公告)日：2023-10-13
申请号：CN202011636780.0
申请日：2020-12-31
申请人： 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/70 , C12Q1/689 , C12Q1/6893 , C12Q1/6888 , C12Q1/6895 , C12Q1/6813 , C12Q1/04 , C12Q1/10 , C12N15/11 , C40B40/06
摘要： 本发明涉及一种用于检测病原微生物的捕获探针组、方法、试剂盒及应用，属于基因检测技术领域。该捕获探针组特异性检测62种细菌及41种耐药基因，16种真菌，14种寄生虫，15种DNA病毒以及60种RNA病毒，能够覆盖临床样本中检出率较高的95％以上的病原微生物，并结合部分病原微生物存在检出难的现状，可极大的提高检测灵敏度和特异性，特别是提高了对临床有意义的病原微生物检测灵敏度。
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