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公开(公告)号：CN113249436B
公开(公告)日：2024-08-23
申请号：CN202011271732.6
申请日：2020-11-13
申请人： 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12Q1/689 , C12Q1/6895 , C12Q1/6893 , C12Q1/70 , C12Q1/04 , C12Q1/14 , C12R1/22 , C12R1/445 , C12R1/46 , C12R1/725 , C12R1/72 , C12R1/01 , C12R1/93 , C12R1/225 , C12R1/90
摘要： 本发明涉及一种降低生物样本中宿主核酸的方法和应用，属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤：1)将生物样本在温和的条件下进行样本前处理，部分裂解和/或不裂解宿主细胞膜，得液体样本；2)取上述液体样本，添加核酸消化试剂，降解暴露在溶液中的宿主核酸。采用该方法，可降低生物样本中宿主核酸，对细菌、真菌、病毒、支/衣原体等目标无选择地进行富集，既提高了检测灵敏度，降低了假阴率，又降低了检测成本。
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公开(公告)号：CN118086468A
公开(公告)日：2024-05-28
申请号：CN202410128510.0
申请日：2024-01-30
申请人： 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 北京微远医学检验实验室有限公司 , 广州微远智造科技有限公司 , 广州微远医学科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6844 , C12Q1/6869 , C40B50/06
摘要： 本发明公开了一种用于提高文库数据均一性的方法及应用，属于NGS测序技术领域。该方法包括以下步骤：片段化：取样本DNA进行片段化处理，并在断口处连接测序引物；扩增富集：加入1st特异性引物PCR扩增，1st特异性引物包含接头、Index和互补序列，互补序列与测序引物互补，Index为特异性标签；Pooling：将带有Index的若干样本混合；均一化扩增：向混合样本中加入等量2nd特异性引物进行限制性PCR扩增；该2nd特异性引物与所述1st特异性引物中的接头序列和Index序列互补且加入量小于所有样本目标区域片段充分扩增所需量。采用该方法建库测序可提高数据均一性，缩短测序数据质量的差异。
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公开(公告)号：CN111462821B
公开(公告)日：2022-02-22
申请号：CN202010281509.3
申请日：2020-04-10
申请人： 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
IPC分类号： G16B30/00
摘要： 本发明涉及一种病原微生物分析鉴定系统及应用，属于基因检测分析技术领域。该病原微生物分析鉴定系统包括：数据获取模块：用于获取高通量测序得到的基因测序数据；数据过滤模块：用于将依次进行低质量序列过滤、宿主序列过滤；数据比对模块：用于将序列比对至病原微生物基因组数据库中；物种比对模块：用于统计待分析序列；数据分析模块：用于计算共有比对序列集中各序列对比上每一个物种的相似度S和平均相似度值SMSi；物种序列模块：用于计算物种的总比对序列数SNTi；结果输出模块：用于进行生物信息学分析，得到病原微生物分析鉴定结果。该病原微生物分析鉴定系统不仅具有分析时间短、准确性高的优点；还可准确得检测混合感染，获得具体病原体信息。
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公开(公告)号：CN111445955B
公开(公告)日：2021-09-10
申请号：CN202010280808.5
申请日：2020-04-10
申请人： 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
IPC分类号： G16B30/10
摘要： 本发明涉及一种新型冠状病毒变异分析方法及应用，属于基因测序分析技术领域。该方法包括数据获取、数据过滤、数据比对、变异检测、坐标分析、坐标校正和变异注释步骤。该方法不仅可以对纯病毒培养物测序数据进行变异检测，还可以对宏基因组测序数据进行变异检测，使用范围更广。同时还能准确对核糖体移码进行注释，以及对联合突变进行准确注释，提高了变异检测的准确率。此外还可以对病毒变异进行动态监测。
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公开(公告)号：CN111445955A
公开(公告)日：2020-07-24
申请号：CN202010280808.5
申请日：2020-04-10
申请人： 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司
IPC分类号： G16B30/10
摘要： 本发明涉及一种新型冠状病毒变异分析方法及应用，属于基因测序分析技术领域。该方法包括数据获取、数据过滤、数据比对、变异检测、坐标分析、坐标校正和变异注释步骤。该方法不仅可以对纯病毒培养物测序数据进行变异检测，还可以对宏基因组测序数据进行变异检测，使用范围更广。同时还能准确对核糖体移码进行注释，以及对联合突变进行准确注释，提高了变异检测的准确率。此外还可以对病毒变异进行动态监测。
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公开(公告)号：CN117821561A
公开(公告)日：2024-04-05
申请号：CN202211197088.1
申请日：2022-09-29
申请人： 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 北京微远医学检验实验室有限公司 , 广州微远智造科技有限公司 , 广州微远医学科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B40/06 , C40B50/06 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及一种基于二代测序的文库及其构建方法和试剂，属于基因检测技术领域。该基于二代测序的文库，所述文库的序列片段由5’端至3’端依次为：第一通用接头序列、Read3测序引物序列、index2序列、Read1测序引物序列、目标插入片段、Read2测序引物序列、index1序列和第二通用接头序列，所述目标插入片段为待测基因组片段化后的待测序列。发明通过调整文库结构，省略了测index2需要耗时1h重新合成的模板链翻转的工序，最终实现测序数据提前1小时拆分，实现缩短实验周转时间的目的，可进行快速的二代测序，特别适用于mNGS分析中，可满足临床医生快速、准确鉴定病原体的迫切需求。
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公开(公告)号：CN110804669B
公开(公告)日：2022-12-16
申请号：CN201911192004.3
申请日：2019-11-28
申请人： 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/35
摘要： 本发明涉及一种用于肺炎支原体的CRISPR检测引物组及其用途，属于CRISPR技术的基因检测技术领域。该引物组包括扩增引物对和crRNA；所述扩增引物对用于扩增肺炎支原体如SEQ ID NO.1所示序列；所述crRNA包括锚定序列和向导序列，所述锚定序列与Cas蛋白特异性识别，所述向导序列与所述SEQ ID NO.1序列中的靶向序列片段相匹配。采用该引物组以CRISPR技术检测肺炎支原体，缩短了肺炎支原体的检测时间，可在60min内完成检测。本发明通过筛选得到了特定的序列组合作为引物组进行检测，具有灵敏性高、特异性强的优势，其检测限可达30copies。并且采用该引物组对肺炎支原体进行CRISPR检测，摆脱了对qPCR仪等复杂变温扩增仪器的依赖，使得CRISPR‑Cas技术在肺炎支原体的即时诊断方面具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN110791578B
公开(公告)日：2022-12-16
申请号：CN201911190860.5
申请日：2019-11-28
申请人： 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/01
摘要： 本发明涉及一种用于百日咳博德特氏杆菌的CRISPR检测引物组及其用途，属于CRISPR技术的基因检测技术领域。该引物组包括扩增引物对和crRNA；所述扩增引物对用于扩增百日咳博德特氏杆菌如SEQ ID NO.1所示序列；所述crRNA包括锚定序列和向导序列，所述锚定序列与Cas蛋白特异性识别，所述向导序列与所述SEQ ID NO.1序列中的靶向序列片段相匹配。采用该引物组以CRISPR技术检测百日咳博德特氏杆菌，缩短了百日咳的检测时间，可在60min内完成检测。本发明通过筛选得到了特定的序列组合作为引物组进行检测，具有灵敏性高、特异性强的优势，其检测限可达3copies。并且采用该引物组对百日咳博德特氏杆菌进行CRISPR检测，摆脱了对qPCR仪等复杂变温扩增仪器的依赖，具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN112708660A
公开(公告)日：2021-04-27
申请号：CN201911017285.9
申请日：2019-10-24
申请人： 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
IPC分类号： C12Q1/6844 , C12Q1/689 , C12Q1/14 , C12R1/46
摘要： 本发明涉及一种CRISPR‑POCT检测组合物及其应用，属于医学检测技术领域。该检测组合物包括：探针，包括依次连接的示踪部、识别切割区和固定相；所述示踪部包括标记示踪物和第一结合物，所述识别切割区根据CRISPR系统的Cas酶识别序列设计，为可被CRISPR系统识别酶切的RNA或DNA；试纸条，含有可与所述第一结合物特异性结合的第二结合物。该检测组合物，通过将探针进行固化，不让其完全进入试纸条检测系统中，可以避免因探针过量而造成的假阳性结果。与常规方法相比，提高了检测准确性，降低了假阳率，且具有较好的质控效果。
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公开(公告)号：CN111455021B
公开(公告)日：2024-06-04
申请号：CN201910047978.6
申请日：2019-01-18
申请人： 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806
摘要： 本发明涉及一种去除宏基因组中宿主DNA的方法及试剂盒，属于微生物基因检测技术领域。该方法包括以下步骤：DNA片段化：将宿主基因组DNA进行片段化处理，得到宿主DNA片段；氨基化：对上述宿主DNA片段进行氨基化处理；偶联磁珠：将上述经氨基化处理的宿主DNA片段与磁珠偶联，得捕获磁珠；杂交捕获：将待测样本采用上述方法进行DNA片段化，加入上述制备得到的捕获磁珠，进行杂交反应，磁力吸附磁珠，转移上清液，即得去除宿主DNA的待测宏基因组样本。上述方法通过将片段化的宿主DNA氨基化后，偶联到磁珠上，再通过磁珠与宏基因组样本核酸杂交的方式，把宏基因组样本核酸中的宿主源DNA分离开，从而使宏基因组样本核酸中病原微生物核酸的占比大大提高。
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