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公开(公告)号:CN114807309A
公开(公告)日:2022-07-29
申请号:CN202210543900.5
申请日:2022-05-19
申请人: 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
IPC分类号: C12Q1/6806 , C40B50/06 , C12Q1/6869 , C12Q1/686
摘要: 本发明涉及一种文库标签引物的质控方法及其应用,涉及基因测序领域。该质控方法包括以下步骤:制备待检质控品、构建第一文库、第一质控、构建第二文库、第二质控,其中通过滑动切割的方法得到待检质控品,采用PCR法构建第一文库、第二文库。该质控方法通过与合格的质控品形成一对一的关系构建相应文库,没有片段化和核酸分选的过程,相较于常规建库方法,该质控方法中采用的建库方法更加节省时间,进而提高文库标签引物的质控效率,易实现文库标签引物质控的规模化。
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公开(公告)号:CN118064555A
公开(公告)日:2024-05-24
申请号:CN202410128511.5
申请日:2024-01-30
申请人: 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 北京微远医学检验实验室有限公司 , 广州微远智造科技有限公司 , 广州微远医学科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/6844 , C12Q1/6869 , C40B50/06
摘要: 本发明公开了一种用于提高多样本文库均一性的方法及应用,属于基因测序技术领域。该方法包括以等量的RNA探针与多样本样品进行杂交,随后进行DNA探针杂交和延伸,并以dsDNA酶消化双链DNA,保留杂交得到的DNA‑RNA杂交链,并进行PCR扩增,连接测序接头后得到上机文库。采用该方法构建文库,可提高各文库的均一性,减少多样本pooling上机检测后出现爆机的情况。
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公开(公告)号:CN113249436B
公开(公告)日:2024-08-23
申请号:CN202011271732.6
申请日:2020-11-13
申请人: 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12Q1/689 , C12Q1/6895 , C12Q1/6893 , C12Q1/70 , C12Q1/04 , C12Q1/14 , C12R1/22 , C12R1/445 , C12R1/46 , C12R1/725 , C12R1/72 , C12R1/01 , C12R1/93 , C12R1/225 , C12R1/90
摘要: 本发明涉及一种降低生物样本中宿主核酸的方法和应用,属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤:1)将生物样本在温和的条件下进行样本前处理,部分裂解和/或不裂解宿主细胞膜,得液体样本;2)取上述液体样本,添加核酸消化试剂,降解暴露在溶液中的宿主核酸。采用该方法,可降低生物样本中宿主核酸,对细菌、真菌、病毒、支/衣原体等目标无选择地进行富集,既提高了检测灵敏度,降低了假阴率,又降低了检测成本。
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公开(公告)号:CN118086468A
公开(公告)日:2024-05-28
申请号:CN202410128510.0
申请日:2024-01-30
申请人: 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 北京微远医学检验实验室有限公司 , 广州微远智造科技有限公司 , 广州微远医学科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/6844 , C12Q1/6869 , C40B50/06
摘要: 本发明公开了一种用于提高文库数据均一性的方法及应用,属于NGS测序技术领域。该方法包括以下步骤:片段化:取样本DNA进行片段化处理,并在断口处连接测序引物;扩增富集:加入1st特异性引物PCR扩增,1st特异性引物包含接头、Index和互补序列,互补序列与测序引物互补,Index为特异性标签;Pooling:将带有Index的若干样本混合;均一化扩增:向混合样本中加入等量2nd特异性引物进行限制性PCR扩增;该2nd特异性引物与所述1st特异性引物中的接头序列和Index序列互补且加入量小于所有样本目标区域片段充分扩增所需量。采用该方法建库测序可提高数据均一性,缩短测序数据质量的差异。
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公开(公告)号:CN112863601B
公开(公告)日:2023-03-10
申请号:CN202110055195.X
申请日:2021-01-15
申请人: 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
摘要: 本发明涉及一种病原微生物耐药基因归属模型及其建立方法和应用,属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤:建立病原微生物基因数据库和耐药基因数据库;获取临床样本的病原微生物宏基因组测序数据,得到每个临床样本中病原微生物和所对应的耐药基因序列数据;对上述病原微生物的序列数据和耐药基因序列数据进行聚类分析,获得单个耐药基因与至少一个疑似来源病原微生物的正态分布模型,选取其中病原微生物丰度高且耐药基因序列数与病原微生物序列数强相关的模型,即得。采用该方法得到的病原微生物耐药基因归属模型,能够判断每种耐药基因究竟来源于哪种细菌,弥补了现有技术的缺陷,且具有适用范围广、准确性高的优点。
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公开(公告)号:CN112837745A
公开(公告)日:2021-05-25
申请号:CN202110055186.0
申请日:2021-01-15
申请人: 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
摘要: 本发明涉及一种病原微生物毒力基因关联模型及其建立方法和应用,属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤:建立病原微生物基因数据库和毒力基因数据库;获取临床样本的病原微生物宏基因组测序数据,得到每个临床样本中病原微生物和所对应的毒力基因序列数据;对上述病原微生物的序列数据和毒力基因序列数据进行聚类分析,获得单个毒力基因与至少一个疑似关联病原微生物的正态分布模型,选取其中病原微生物丰度高且毒力基因序列数与病原微生物序列数强相关的模型,即得。采用该方法得到的病原微生物毒力基因关联模型,能够判断每种毒力基因究竟来源于哪种细菌,弥补了现有技术的缺陷,且具有适用范围广、准确性高的优点。
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公开(公告)号:CN112837745B
公开(公告)日:2023-11-21
申请号:CN202110055186.0
申请日:2021-01-15
申请人: 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司
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公开(公告)号:CN112863601A
公开(公告)日:2021-05-28
申请号:CN202110055195.X
申请日:2021-01-15
申请人: 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
摘要: 本发明涉及一种病原微生物耐药基因归属模型及其建立方法和应用,属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤:建立病原微生物基因数据库和耐药基因数据库;获取临床样本的病原微生物宏基因组测序数据,得到每个临床样本中病原微生物和所对应的耐药基因序列数据;对上述病原微生物的序列数据和耐药基因序列数据进行聚类分析,获得单个耐药基因与至少一个疑似来源病原微生物的正态分布模型,选取其中病原微生物丰度高且耐药基因序列数与病原微生物序列数强相关的模型,即得。采用该方法得到的病原微生物耐药基因归属模型,能够判断每种耐药基因究竟来源于哪种细菌,弥补了现有技术的缺陷,且具有适用范围广、准确性高的优点。
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公开(公告)号:CN113249436A
公开(公告)日:2021-08-13
申请号:CN202011271732.6
申请日:2020-11-13
申请人: 广州微远基因科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12Q1/689 , C12Q1/6895 , C12Q1/6893 , C12Q1/70 , C12Q1/04 , C12Q1/14 , C12R1/22 , C12R1/445 , C12R1/46 , C12R1/725 , C12R1/72 , C12R1/01 , C12R1/93 , C12R1/225 , C12R1/90
摘要: 本发明涉及一种降低生物样本中宿主核酸的方法和应用,属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤:1)将生物样本在温和的条件下进行样本前处理,部分裂解和/或不裂解宿主细胞膜,得液体样本;2)取上述液体样本,添加核酸消化试剂,降解暴露在溶液中的宿主核酸。采用该方法,可降低生物样本中宿主核酸,对细菌、真菌、病毒、支/衣原体等目标无选择地进行富集,既提高了检测灵敏度,降低了假阴率,又降低了检测成本。
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