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公开(公告)号:CN118064555A
公开(公告)日:2024-05-24
申请号:CN202410128511.5
申请日:2024-01-30
申请人: 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 北京微远医学检验实验室有限公司 , 广州微远智造科技有限公司 , 广州微远医学科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/6844 , C12Q1/6869 , C40B50/06
摘要: 本发明公开了一种用于提高多样本文库均一性的方法及应用,属于基因测序技术领域。该方法包括以等量的RNA探针与多样本样品进行杂交,随后进行DNA探针杂交和延伸,并以dsDNA酶消化双链DNA,保留杂交得到的DNA‑RNA杂交链,并进行PCR扩增,连接测序接头后得到上机文库。采用该方法构建文库,可提高各文库的均一性,减少多样本pooling上机检测后出现爆机的情况。
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公开(公告)号:CN111575348B
公开(公告)日:2024-01-09
申请号:CN202010425415.9
申请日:2020-05-19
申请人: 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/6806 , C12N15/10 , C40B50/06
摘要: 本发明涉及一种宏基因组文库及建库方法和应用,属于感染病原诊断技术领域。该方法包括以下步骤:S1:提取待测样本中的基因组核酸;S2:在片段化缓冲液体系中加入按照活性单位比1:6‑8的量加入基因组核酸和转座酶复合体,进行片段化和加接头反应;所述片段化缓冲液中包括数均分子量≥20,000的拥挤分子;S3:在S2步骤得到的溶液中直接加入引物和扩增试剂,对文库进行扩增;S4:对扩增后的文库进行纯化,即得。该方法适用于复杂核酸宏基因组条件,应用于临床感染病原诊断。该方法经过严格系统的优化后得出,不仅操作简便,耗时短,还能够提高文库复杂度,富集临床样本中mcfDNA,提高了检测灵敏度,增加了宏基因组对病原检测的灵敏度。
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公开(公告)号:CN117352055A
公开(公告)日:2024-01-05
申请号:CN202311113534.0
申请日:2023-08-30
申请人: 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 北京微远医学检验实验室有限公司 , 广州微远智造科技有限公司 , 广州微远医学科技有限公司
IPC分类号: G16B25/20 , C12Q1/6869 , G16B15/30 , G16B40/00 , G06N7/01
摘要: 本发明涉及一种tNGS检测污染判断模型及其建立方法和应用,属于宏基因组检测技术领域。该方法基于tNGS检测特点,以引物扩增频谱特点建立判断样品是否被强阳样品污染的tNGS检测污染判断模型,不仅无需额外的特殊引物试剂要求,成本较低,通用性高。且由于综合考虑了历史强阳样品,批次强阳样品,株系差异等特征,具有判断更加精准,区分度更高的优势。
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公开(公告)号:CN116926181A
公开(公告)日:2023-10-24
申请号:CN202310797852.7
申请日:2023-06-30
申请人: 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 北京微远医学检验实验室有限公司 , 广州微远智造科技有限公司 , 广州微远医学科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/6869 , C12Q1/6816 , C12N15/11
摘要: 本发明涉及一种评价病原微生物检测探针捕获效率的方法及应用,属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤:探针设计:针对目标病原微生物基因序列设计病原探针;针对宿主探针区域设计特异性探针,作为内参探针;建库测序:取待测样本,构建测序文库,将文库与所述病原探针和所述内参探针混合,进行杂交捕获反应,并对文库进行高通量测序;数据分析:取测序数据,比对至宿主基因序列,获得比对至宿主探针区域和宿主非探针区域的reads数,计算二者的比值,以该比值评价探针捕获效率。该方法在无需增加额外实验环节的情况下,通过对宿主探针区域的富集效率间接监控临床病原的富集效率,既节约了检测成本,又不影响检测结果交付的时效性。
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公开(公告)号:CN116374355A
公开(公告)日:2023-07-04
申请号:CN202310296951.7
申请日:2023-03-23
申请人: 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司 , 南京微远医学检验实验室有限公司 , 北京微远医学检验实验室有限公司 , 广州微远智造科技有限公司 , 广州微远医学科技有限公司
摘要: 本发明涉及一种试剂卡条自动上料设备及方法,属于自动化实验设备技术领域。试剂卡条自动上料设备,包括:存储机构,包括存储壳体和安装于该存储壳体内的抽屉、推卡机构和锁紧机构;接取机构,包括升降机构和接取组件;输送机构,包括输送座;刺膜机构,包括穿刺组件和刺膜驱动装置;以及机架,所述存储机构、接取机构、输送机构和刺膜机构均安装于所述机架上。上述试剂卡条自动上料设备,以存储机构、接取机构、输送机构和刺膜机构的配合,实现了整体自动化解决方案,解决了人工上料操作繁杂,人力投入成本高的问题,自动化程度高,且上述设备具有结构紧凑,体积小的优势。
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公开(公告)号:CN109811072B
公开(公告)日:2022-05-06
申请号:CN201910150399.4
申请日:2019-02-28
申请人: 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
IPC分类号: C12Q1/689 , C12N15/11 , C12Q1/6844 , C12R1/32
摘要: 本发明涉及一种用于结核分枝杆菌复合群的CRISPR检测引物组及其用途,属于基因检测技术领域。该引物组包括扩增引物对和crRNA;所述扩增引物对用于扩增结核分枝杆菌、牛分枝杆菌、非洲分枝杆菌、坎纳分支杆菌和田鼠分枝杆菌的共有保守序列;所述crRNA包括锚定序列和向导序列,所述锚定序列与cas蛋白结合,所述向导序列与所述共有保守序列中的靶向RNA片段相匹配。通过上述基于CRISPR检测技术的引物组,以CRISPR检测针对结核分枝杆菌、牛分枝杆菌、非洲分枝杆菌、坎纳分支杆菌和田鼠分枝杆菌的共有保守序列进行基因检测,能够快速进行结核分枝杆菌复合群的现场检测,且具有特异高、灵敏高、简易的优点。
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公开(公告)号:CN111500781B
公开(公告)日:2021-10-29
申请号:CN202010413060.1
申请日:2020-05-15
申请人: 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
IPC分类号: C12Q1/70 , C12Q1/6869 , C12N15/11
摘要: 本发明涉及一种mNGS检测SARS‑CoV‑2的扩增引物组及其应用,属于基因检测技术领域。该扩增引物组包括:随机引物和SARS‑CoV‑2特异性引物,所述随机引物为5‑7bp的寡核苷酸,所述SARS‑CoV‑2特异性引物为针对SARS‑CoV‑2序列设计的10‑20bp的寡核苷酸。上述扩增引物组,以建库的方式,针对新型冠状病毒,在建库之前进行特异性扩增,进行高覆盖度靶向富集建库,提高了病原检出的覆盖度、病原基因组突变的鉴定、病原检出的灵敏度以及新型冠状病毒感染的诊断能力。
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公开(公告)号:CN113284560A
公开(公告)日:2021-08-20
申请号:CN202110466657.7
申请日:2021-04-28
申请人: 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
摘要: 本发明涉及一种病原检测背景微生物判断方法及应用,属于生物信息学分析技术领域。该判断方法包括以下步骤:确定核心背景微生物列表:取若干生物样本,将其中各微生物基因序列数据比对至相应微生物的特征序列区域,与核酸提取浓度或文库浓度进行相关性检验,得到相关性呈负相关的微生物列表,得核心背景微生物列表;确定核心背景微生物校正指数CBI:以上述核心背景微生物列表中所有微生物的特异性比对序列数之和为CBI;背景序列判断:将待测样本中微生物的特异性比对序列数与所述CBI相除得判断值。采用该方法可以背景微生物指数的大小来校正背景相关微生物,根据校正后的量来判断样本中该病原微生物是否存在,能够更为准确的判断结果。
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公开(公告)号:CN113270145A
公开(公告)日:2021-08-17
申请号:CN202110466665.1
申请日:2021-04-28
申请人: 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
摘要: 本发明涉及一种判断背景引入微生物序列的方法及其应用,属于生物信息分析技术领域。该方法包括以下步骤:确定背景微生物列表:取若干病原微生物阴性样本,将各微生物丰度的定量值A与核酸总量D进行相关性检验,呈负相关则判定为背景病原微生物;判断模型建立:分别取背景病原微生物的阴性对照样本集和阳性样本集,将背景病原微生物基因序列数据比对至该微生物的特征序列区域,计算丰度,建立判断模型;微生物特异性区域定量分析:获取待测样本中背景病原微生物基因序列数据,采用上述判断模型进行判断。该方法能够准确判断测序所得微生物序列是否为背景引入,且可降低批次假阳或者假阴问题,可广泛应用于病原微生物检测的数据分析中。
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公开(公告)号:CN112813196A
公开(公告)日:2021-05-18
申请号:CN202011636780.0
申请日:2020-12-31
申请人: 广州微远基因科技有限公司 , 广州微远医疗器械有限公司 , 广州微远医学检验实验室有限公司 , 深圳微远医疗科技有限公司 , 微远(深圳)医学研究中心有限公司
IPC分类号: C12Q1/70 , C12Q1/689 , C12Q1/6893 , C12Q1/6888 , C12Q1/6895 , C12Q1/6813 , C12Q1/04 , C12Q1/10 , C12N15/11 , C40B40/06
摘要: 本发明涉及一种用于检测病原微生物的捕获探针组、方法、试剂盒及应用,属于基因检测技术领域。该捕获探针组特异性检测62种细菌及41种耐药基因,16种真菌,14种寄生虫,15种DNA病毒以及60种RNA病毒,能够覆盖临床样本中检出率较高的95%以上的病原微生物,并结合部分病原微生物存在检出难的现状,可极大的提高检测灵敏度和特异性,特别是提高了对临床有意义的病原微生物检测灵敏度。
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