一种用于多位点可持续使用的基因分型标准品

    公开(公告)号:CN115125295A

    公开(公告)日:2022-09-30

    申请号:CN202210230210.4

    申请日:2022-03-10

    IPC分类号: C12Q1/6876 C12N15/11

    摘要: 本发明属于基因测序标准品技术领域,提供一种用于多位点可持续使用的基因分型标准品,所述标准品包括PTC‑HEX、PTC‑FAM和PTC‑H;其中,PTC‑HEX的PCR产物包括rs25487(G)、rs1042522(C)和rs1048943(A);PTC‑FAM的PCR产物包括rs25487(A)、rs1042522(G)和rs1048943(T),PTC‑H的PCR产物包括PTC‑HEX。本标准品经DNA结构改造,可用于多位点SNP分型,可持续使用的基因分型标准品。可通过单引物PCR扩增的方式进行标准品复制,从而使标准品可持续使用,且大大降低了标准品重新制备的成本。

    一种抗生素抗性基因下机数据的自动化可视化分析处理方法

    公开(公告)号:CN118053502A

    公开(公告)日:2024-05-17

    申请号:CN202410110052.8

    申请日:2024-01-25

    IPC分类号: G16B45/00 G16B20/10 G16B25/20

    摘要: 本发明属于生物技术领域,公开了一种抗生素抗性基因下机数据的自动化可视化分析处理方法,包括下列步骤:S1、获得qPCR的下机数据,基于qPCR的下机数据计算出qPCR每个反应的拷贝数,并将所述拷贝数作为参数添加到qPCR的下机数据中,形成初始数据;S2、根据预定的迭代条件对所获得的初始数据进行迭代处理,获得迭代数据;S3、根据预定的整合规则对迭代数据进行数据整合,获得的整合结果即可视化数据集;S4:基于的可视化数据集进行可视化分析;S5:基于可视化分析结果判断样本中抗生素抗性基因ARGs相关定量定性关系。本发明更直观展示每个样本中含有的ARGs的数量、类型和丰度的比较。

    一种高通量水产养殖抗生素抗性基因的定量检测方法

    公开(公告)号:CN112501325A

    公开(公告)日:2021-03-16

    申请号:CN202011445483.8

    申请日:2020-12-09

    摘要: 一种高通量水产养殖抗生素抗性基因的定量检测方法,包括水产养殖样本的采集,处理、核酸抽提、标准品构建及标准曲线绘制、高通量qPCR检测和数据处理,四环素抗生素抗性基因包括tetA、tetB、tetC、tetD、tetE、tetH、tetL、tetM、tetO、tetQ、tetS、tetW、tetX、tetBP等14种;14种标准品构建过程:(1)通过PCR反应扩增出耐药基因的DNA片段;(2)切胶回收耐药基因的普通PCR产物;(3)PCR产物一代测序,并与NCBI数据库比对,比对确定是相对应的基因再进行下一步;(4)将回收的普通PCR产物与克隆载体连接成环状质粒,转化至感受态细菌进行克隆,通过质粒携带的抗性基因筛选出阳性克隆子,分离纯化后提取质粒;(5)对质粒插入片段进行一带测序,跟(3)的序列进行比对,吻合即为该基因的质粒标准品。

    一种核酸试纸条快检试剂盒

    公开(公告)号:CN218059047U

    公开(公告)日:2022-12-16

    申请号:CN202221602551.1

    申请日:2022-06-24

    IPC分类号: C12Q1/6844

    摘要: 本实用新型涉及生物试剂盒技术领域,且公开了一种核酸试纸条快检试剂盒,包括恒温扩增体系、基于基因编辑的核酸检测体系和可视化检测系统,所述恒温扩增体系包括RPA酶、反应缓冲液V、醋酸镁溶液和无核酸水,所述基于基因编辑的核酸检测体系包括Cas13a核酸酶、非特异性报告分子和检测缓冲液C,所述可视化检测系统包括侧向流动试纸条、检测层析液;本试剂盒操作简便,无需复杂的温控设备,快速高效,仅需1小时即可判读结果,扩增效率极高,并且污染风险低。