公开(公告)号：CN116287334A

公开(公告)日：2023-06-23

申请号：CN202310080096.6

申请日：2023-02-08

申请人： 海南热带海洋学院崖州湾创新研究院 ,  国家海洋环境监测中心 ,  安徽基特奥生物科技有限公司

发明人： 那广水 ,  高轩 ,  高会 ,  李瑞婧 ,  曾映旭 ,  李西清 ,  刘晓蕙 ,  程亚双

IPC分类号： C12Q1/689 ,  C12Q1/6851 ,  C12N15/11 ,  C12N15/63 ,  C12N15/64

摘要： 一种环境中大环内酯类抗生素抗性基因的高通量定量检测试剂盒，包括特异性引物、qPCR反应试剂、smartchip芯片以及wafergen耗材，所述特异性引物由45对大环内酯类抗生素抗性基因和内参16SrRNA基因的特异性引物组成，所述wafergen耗材包括384深孔板、qPCR膜、芯片暂封膜、芯片滤膜和芯片qPCR膜，本试剂盒一次可检测96个环境样本。采用wafergen平台进行ARGs检测，很好的解决了目前qPCR方法通量低的缺点。自行编写的自动化脚本，实现快速绝对拷贝数的计算。将以上46对引物预喷在芯片上，然后组装成试剂盒，方便后续环境测检点的快速检测。通过分析大环内酯类抗生素的基因序列，进行进化树分析，将序列相似的抗生素分为一类，分析每一大类抗生素的丰度情况。