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公开(公告)号:CN116287334A
公开(公告)日:2023-06-23
申请号:CN202310080096.6
申请日:2023-02-08
申请人: 海南热带海洋学院崖州湾创新研究院 , 国家海洋环境监测中心 , 安徽基特奥生物科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/689 , C12Q1/6851 , C12N15/11 , C12N15/63 , C12N15/64
摘要: 一种环境中大环内酯类抗生素抗性基因的高通量定量检测试剂盒,包括特异性引物、qPCR反应试剂、smartchip芯片以及wafergen耗材,所述特异性引物由45对大环内酯类抗生素抗性基因和内参16SrRNA基因的特异性引物组成,所述wafergen耗材包括384深孔板、qPCR膜、芯片暂封膜、芯片滤膜和芯片qPCR膜,本试剂盒一次可检测96个环境样本。采用wafergen平台进行ARGs检测,很好的解决了目前qPCR方法通量低的缺点。自行编写的自动化脚本,实现快速绝对拷贝数的计算。将以上46对引物预喷在芯片上,然后组装成试剂盒,方便后续环境测检点的快速检测。通过分析大环内酯类抗生素的基因序列,进行进化树分析,将序列相似的抗生素分为一类,分析每一大类抗生素的丰度情况。
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公开(公告)号:CN114736785B
公开(公告)日:2023-04-21
申请号:CN202210371135.3
申请日:2022-04-11
申请人: 海南热带海洋学院崖州湾创新研究院 , 国家海洋环境监测中心 , 合肥元哉生物科技有限公司
IPC分类号: C12M1/34 , C12M1/12 , C12M1/00 , C12N15/10 , C12Q1/6806 , C12Q1/6851
摘要: 本发明涉及生物工程技术领域,且公开了一种用于野外的便携式ARGs检测系统,包括后表面开口且中空长方体结构的箱体、小型样本研磨系统、小型核酸提取系统、核酸定量系统和16孔荧光定量PCR系统,所述箱体的内后部转动连接有连接板;本发明中的样本研磨系统、核酸提取系统、核酸定量系统和16孔荧光定量PCR系统四种组合产品技术成熟稳定,可集成化也可单独使用,非常适用于野外科研工作者,实时实地的处理样本和检测样本避免了在样本提取检测之前需要低温保存和运输的麻烦,保持了样本采集时的原始状态,防止因采集样本到后续处理和检测的时间太久影响样本原始状态而导致的结果与真实情况有出入的偏差。
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公开(公告)号:CN117288850A
公开(公告)日:2023-12-26
申请号:CN202310832699.7
申请日:2023-07-08
申请人: 海南热带海洋学院崖州湾创新研究院 , 国家海洋环境监测中心
摘要: 本发明属于水产养殖技术领域,提供了一种水产养殖环境中典型阻燃剂高通量分析的方法,包括固相萃取柱吸附剂的选择和水样萃取方法的确定;本发明基于实验室已有的大体积固相萃取装置,建立水中OPEs、PBDEs、HBCDs和Decs的实验室高通量分析方法,并结合超声萃取,建立沉积物中OPEs、PBDEs、HBCDs和Decs的实验室高通量分析方法,使得该分析方法可以针对多种的不同类的污染物,在一定程度上缩短了环境监测的反馈时间,从而利于管控水产养殖环境中的污染物。
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公开(公告)号:CN114736785A
公开(公告)日:2022-07-12
申请号:CN202210371135.3
申请日:2022-04-11
申请人: 海南热带海洋学院崖州湾创新研究院 , 国家海洋环境监测中心 , 合肥元哉生物科技有限公司
IPC分类号: C12M1/34 , C12M1/12 , C12M1/00 , C12N15/10 , C12Q1/6806 , C12Q1/6851
摘要: 本发明涉及生物工程技术领域,且公开了一种用于野外的便携式ARGs检测系统,包括后表面开口且中空长方体结构的箱体、小型样本研磨系统、小型核酸提取系统、核酸定量系统和16孔荧光定量PCR系统,所述箱体的内后部转动连接有连接板;本发明中的样本研磨系统、核酸提取系统、核酸定量系统和16孔荧光定量PCR系统四种组合产品技术成熟稳定,可集成化也可单独使用,非常适用于野外科研工作者,实时实地的处理样本和检测样本避免了在样本提取检测之前需要低温保存和运输的麻烦,保持了样本采集时的原始状态,防止因采集样本到后续处理和检测的时间太久影响样本原始状态而导致的结果与真实情况有出入的偏差。
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公开(公告)号:CN117965290B
公开(公告)日:2024-09-24
申请号:CN202410222536.1
申请日:2024-02-28
申请人: 安徽师范大学 , 海南热带海洋学院崖州湾创新研究院 , 国家海洋环境监测中心 , 合肥元哉生物科技有限公司
摘要: 本发明公开了一种手提箱式野外基因检测设备,包括箱体以及和箱体转动设置的箱盖,还包括:检测槽,开设于箱体上,所述检测槽上通过转轴转动设置有槽盖,所述检测槽内设置有检测单元;所述检测单元包括:放置机构、夹持机构、协同机构,通过箱体以及在箱体内设置检测单元的设计,可以解决在野外实现对基因检测的问题,这样就解决了现有检测过程复杂的问题,同时也避免了运输过程中造成对检测结果影响的因素,同时通过检测单元的重新设置,可以更好的便于试管的取用放置,同时在放置检测时对试管进行固定以及试管口封闭,以防止检测过程中碰撞造成箱体移动而对检测结果造成的影响。
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公开(公告)号:CN117965290A
公开(公告)日:2024-05-03
申请号:CN202410222536.1
申请日:2024-02-28
申请人: 安徽师范大学 , 海南热带海洋学院崖州湾创新研究院 , 国家海洋环境监测中心 , 合肥元哉生物科技有限公司
摘要: 本发明公开了一种手提箱式野外基因检测设备,包括箱体以及和箱体转动设置的箱盖,还包括:检测槽,开设于箱体上,所述检测槽上通过转轴转动设置有槽盖,所述检测槽内设置有检测单元;所述检测单元包括:放置机构、夹持机构、协同机构,通过箱体以及在箱体内设置检测单元的设计,可以解决在野外实现对基因检测的问题,这样就解决了现有检测过程复杂的问题,同时也避免了运输过程中造成对检测结果影响的因素,同时通过检测单元的重新设置,可以更好的便于试管的取用放置,同时在放置检测时对试管进行固定以及试管口封闭,以防止检测过程中碰撞造成箱体移动而对检测结果造成的影响。
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公开(公告)号:CN115290615B
公开(公告)日:2024-09-10
申请号:CN202210879501.6
申请日:2022-07-25
申请人: 海南热带海洋学院崖州湾创新研究院 , 海南热带海洋学院
摘要: 一种检测海洋生物体内微塑料含量的高通量方法,本发明涉及环境污染物检测领域,具体涉及一种检测海洋生物体内微塑料含量的高通量方法。本发明要解决现有方法不能快速、高效且准确检测海洋生物中微塑料含量的问题。方法:一、实验动物驯化;二、微塑料暴露实验;三、组织采集;四、组织消解;五、建立标准曲线;六、微塑料含量测定。本发明能够快速、高效且准确检测海洋生物中微塑料含量。本发明用于检测海洋生物中微塑料含量。
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公开(公告)号:CN112501325A
公开(公告)日:2021-03-16
申请号:CN202011445483.8
申请日:2020-12-09
申请人: 国家海洋环境监测中心 , 安徽微分基因科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/689 , C12Q1/6851 , C12Q1/6806 , C12N15/63
摘要: 一种高通量水产养殖抗生素抗性基因的定量检测方法,包括水产养殖样本的采集,处理、核酸抽提、标准品构建及标准曲线绘制、高通量qPCR检测和数据处理,四环素抗生素抗性基因包括tetA、tetB、tetC、tetD、tetE、tetH、tetL、tetM、tetO、tetQ、tetS、tetW、tetX、tetBP等14种;14种标准品构建过程:(1)通过PCR反应扩增出耐药基因的DNA片段;(2)切胶回收耐药基因的普通PCR产物;(3)PCR产物一代测序,并与NCBI数据库比对,比对确定是相对应的基因再进行下一步;(4)将回收的普通PCR产物与克隆载体连接成环状质粒,转化至感受态细菌进行克隆,通过质粒携带的抗性基因筛选出阳性克隆子,分离纯化后提取质粒;(5)对质粒插入片段进行一带测序,跟(3)的序列进行比对,吻合即为该基因的质粒标准品。
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公开(公告)号:CN112592990A
公开(公告)日:2021-04-02
申请号:CN202011447764.7
申请日:2020-12-09
申请人: 国家海洋环境监测中心 , 安徽微分基因科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/689 , C12Q1/6851 , C12Q1/6806 , C12N15/63
摘要: 一种基于高通量水产养殖环境中基因盒的定量检测方法,包括水产养殖环境样本的采集,处理、核酸抽提、标准品构建及标准曲线绘制、高通量qPCR检测和数据处理,所述基因盒包括整合子、磺胺类抗生素抗性基因、β‑内酰胺类抗生素抗性基因、氯霉素类抗生素抗性基因;所述整合子包括int1、int2两个基因;所述磺胺类抗生素抗性基因包括sul1、sul2、sul3三个基因;所述β‑内酰胺类抗生素抗性基因包括blaTEM、blaSHV、blaPSE‑1三个基因;所述氯霉素类抗生素抗性基因包括floR、cmlA两个基因;所述基因盒包含10个基因,本发明具有检测通量高的优点,对于10个基因盒相关基因,一次可检测384个样本。
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公开(公告)号:CN105112497A
公开(公告)日:2015-12-02
申请号:CN201510567031.X
申请日:2015-09-08
申请人: 国家海洋环境监测中心
摘要: 本发明公开了一种河口及近岸海洋环境中大肠杆菌、金黄色葡萄球菌分离筛选及抗生素抗性评估方法。本方法是通过在MI琼脂与VJ琼脂中浸入筛选抗生素(四环素、磺胺、喹诺酮等)制成敏感的特异性选择琼脂,快速分离并计数河口及近岸海洋环境中抗生素抗性大肠杆菌(E.coli)与金黄色葡萄球菌(S.aureus),进而评估其抗性水平。本发明的河口及近岸海洋环境中大肠杆菌、金黄色葡萄球菌分离筛选及抗生素抗性评估方法具有操作简便易行,准确率高,安全环保的优点,适用于近岸海洋、河口、及入海排污口水体与沉积物样品中大肠杆菌与金黄色葡萄球菌的快速分析及抗生素抗性水平检测。
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