一种抗生素抗性基因下机数据的自动化可视化分析处理方法

    公开(公告)号:CN118053502A

    公开(公告)日:2024-05-17

    申请号:CN202410110052.8

    申请日:2024-01-25

    IPC分类号: G16B45/00 G16B20/10 G16B25/20

    摘要: 本发明属于生物技术领域,公开了一种抗生素抗性基因下机数据的自动化可视化分析处理方法,包括下列步骤:S1、获得qPCR的下机数据,基于qPCR的下机数据计算出qPCR每个反应的拷贝数,并将所述拷贝数作为参数添加到qPCR的下机数据中,形成初始数据;S2、根据预定的迭代条件对所获得的初始数据进行迭代处理,获得迭代数据;S3、根据预定的整合规则对迭代数据进行数据整合,获得的整合结果即可视化数据集;S4:基于的可视化数据集进行可视化分析;S5:基于可视化分析结果判断样本中抗生素抗性基因ARGs相关定量定性关系。本发明更直观展示每个样本中含有的ARGs的数量、类型和丰度的比较。