-
公开(公告)号:CN112760383A
公开(公告)日:2021-05-07
申请号:CN202110228229.0
申请日:2021-03-02
申请人: 复旦大学附属中山医院
IPC分类号: C12Q1/6886 , C12Q1/6851 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了应用于肺腺癌细胞亚群的一组qRT‑PCR内参基因及其应用,属于基因检测技术领域。本发明的内参基因选自基因RPL41、TPT1、RPL34、RPS29、RPL27A、HLA‑B、SERF2、RPS13和RPL7中的至少一种。本发明的内参基因相较于多数目前研究中常用的内参基因表达更加稳定,更加适用于从肺腺癌中分选出的肿瘤细胞和正常细胞,通过qRT‑PCR检测肺腺癌不同细胞亚群的基因的表达量,以获得更加可靠的标准化定量结果,从而为在复杂生理病理背景中探索肿瘤疾病的病因、肺腺癌的治疗和预后提供精确且可靠的数据支持。
-
公开(公告)号:CN113444793A
公开(公告)日:2021-09-28
申请号:CN202110597293.6
申请日:2021-05-31
申请人: 复旦大学附属中山医院
IPC分类号: C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16B20/50
摘要: 本发明涉及检测肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的试剂盒,所述试剂盒含有检测以下基因表达量的检测试剂:RP11‑539L10.2、AKR1C2、RP11‑572H4.1、TRIM16L、RARA、SESN2、RP5‑827L5.2、CTD‑2139B15.5、Metazoa_SRP、snoU13、RP11‑545H22.1、KRT8P30、TALDO1、TRAPPC13P1、GS1‑388B5.2、RP11‑267L5.1、TRAV11、RP11‑699A7.1、AL132671.1。与现有技术相比,本发明通过运用RNA测序、LASSO和二分类Logistic回归筛选与抗氧化应激通路相关的基因,并构建评分Score,通过ROC曲线分析得到肺腺癌中相应评分的截断值,可用于肺腺癌中抗氧化应激通路相关基因(KEAP1、NFE2L2、CUL3)突变的预测。该发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变,经TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库,实验以及多组学数据库验证,发现该预测方法具有准确性高,特异性好的优点,有很好的应用前景。
-
公开(公告)号:CN113151460A
公开(公告)日:2021-07-23
申请号:CN202110127761.3
申请日:2021-01-29
申请人: 复旦大学附属中山医院
IPC分类号: C12Q1/6886 , A61K45/00 , A61P35/00
摘要: 本发明涉及一种识别肺腺癌肿瘤细胞的基因标志物及其应用,属于分子生物学技术领域。所述基因标志物选自基因ERRFI1、MAL2、RNASE1、ATP11A、CYB5A、LGALS3BP、LPCAT1、SPINT2、ATP1A1、SMIM22和TSPAN3中的至少一种;其中MAL2、CYB5A和ATP11A这三种基因在肺腺癌肿瘤细胞的表达量为正常细胞的3‑6倍,本发明还通过Logistic回归方法建立了风险评估模型,以更准确地识别单细胞类型的肺腺癌肿瘤细胞,该模型的特异性和敏感性均接近90%。本发明的识别肺腺癌肿瘤细胞的基因标志物,为临床上研发诊断肺腺癌的方法和治疗肺腺癌的药物提供了新的分子靶标。
-
公开(公告)号:CN115261481A
公开(公告)日:2022-11-01
申请号:CN202211113982.6
申请日:2022-09-14
申请人: 复旦大学附属中山医院
IPC分类号: C12Q1/6886 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了一种检测肺腺癌铁死亡敏感性的试剂盒,其包括:用于从肺腺癌患者肿瘤组织中提取分离mRNA的mRNA提取分离系统;用于MAFF基因的mRNA表达量的MAFF基因检测系统;记载用于确定MAFF表达量高/低分界标准的数学模型载体,当肺腺癌患者肿瘤组织中MAFF表达量高于所述分界标准时,提示患者对铁死亡诱导剂药物治疗敏感;反之当低于所述分界标准时,提示患者对铁死亡诱导剂药物治疗不敏感、或者出现治疗抵抗。
-
公开(公告)号:CN113151460B
公开(公告)日:2022-10-18
申请号:CN202110127761.3
申请日:2021-01-29
申请人: 复旦大学附属中山医院
IPC分类号: C12Q1/6886 , A61K45/00 , A61P35/00
摘要: 本发明涉及一种识别肺腺癌肿瘤细胞的基因标志物及其应用,属于分子生物学技术领域。所述基因标志物选自基因ERRFI1、MAL2、RNASE1、ATP11A、CYB5A、LGALS3BP、LPCAT1、SPINT2、ATP1A1、SMIM22和TSPAN3中的至少一种;其中MAL2、CYB5A和ATP11A这三种基因在肺腺癌肿瘤细胞的表达量为正常细胞的3‑6倍,本发明还通过Logistic回归方法建立了风险评估模型,以更准确地识别单细胞类型的肺腺癌肿瘤细胞,该模型的特异性和敏感性均接近90%。本发明的识别肺腺癌肿瘤细胞的基因标志物,为临床上研发诊断肺腺癌的方法和治疗肺腺癌的药物提供了新的分子靶标。
-
公开(公告)号:CN115572766A
公开(公告)日:2023-01-06
申请号:CN202211285382.8
申请日:2022-10-20
申请人: 复旦大学附属中山医院
IPC分类号: C12Q1/6886 , G16B20/30 , G16B25/10 , G16B50/00
摘要: 本发明涉及一种预测肿瘤患者二甲双胍辅助治疗获益情况的试剂盒,属于生物医药技术领域。本发明提供一种定量检测肿瘤组织GREM1,KRT4,CES1,CDC42EP5,SGK2,PDZK1,NDUFA4L2,SLC7A8,FBLN5,ADAM23,POU5F1的RNA表达量的试剂在制备预测肿瘤患者辅助二甲双胍抗癌治疗获益与否的试剂盒的应用。试剂盒中包括计算方法和阳性判断阈值16。据此可有效特异地预测肿瘤患者对辅助二甲双胍治疗的获益与否,并进行了验证,确定本发明可特异性预测二甲双胍辅助抗癌治疗效果,方法简单、时间短、效率高,为个性化用药和预后判断提供指导作用。
-
公开(公告)号:CN113755602A
公开(公告)日:2021-12-07
申请号:CN202111218705.7
申请日:2021-10-20
申请人: 复旦大学附属中山医院
IPC分类号: C12Q1/6886 , C12Q1/6851 , C12N15/11 , A61K45/00 , A61P35/00 , A61P11/00
摘要: 本发明涉及一种识别肺腺癌肿瘤干细胞的基因标志物及其应用,属于生物医药技术领域。基因标志物选自基因RPS4X、FTH1、CYBA、POMP、SLC25A5、RPL35A、BST2、SEC61G、HMGB1、COMMD6、CLIC1、COX6B1、NDUFB4、TPI1、COX8A、SAP18、HMGN1和XIST。本发明基于单细胞转录组测序得到的肺腺癌肿瘤干细胞的标志物,可以准确地识别肺腺癌中的肺腺癌干细胞,并不限于细胞表面的干性基因,为进一步研究肺腺癌干细胞和针对肺腺癌干细胞的治疗提供了新的分子靶点。
-
公开(公告)号:CN116790757A
公开(公告)日:2023-09-22
申请号:CN202310914559.4
申请日:2023-07-24
申请人: 复旦大学附属中山医院
IPC分类号: C12Q1/6886 , C12Q1/6869
摘要: 本发明公开了一种用于检测肺腺癌不同亚型巨噬细胞浸润水平及预测患者预后的试剂盒。本发明在单细胞水平上识别了肿瘤相关巨噬细胞不同亚群,基于单细胞测序技术所得巨噬细胞亚群单核细胞、单核细胞‑巨噬细胞中间亚群、间质巨噬细胞、肺泡巨噬细胞,分别提取其前十位的高变基因作为其亚群的特征基因。利用上述特征基因的表达水平,用反卷积方法预测肺腺癌患者中不同亚群巨噬细胞的浸润水平,同时利用该水平预测患者预后。利用不同亚群的巨噬细胞浸润水平预测肺腺癌患者的预后,相较于目前常用的检测方法具有操作便捷、可定量分析、准确性高、灵敏度和特异性好的优势。
-
公开(公告)号:CN116716292A
公开(公告)日:2023-09-08
申请号:CN202310913255.6
申请日:2023-07-24
申请人: 复旦大学附属中山医院
摘要: 本发明公开了一种同时提取线粒体DNA及蛋白的试剂盒。本发明的试剂盒包括:Digitonin缓冲液、NP‑40缓冲液、悬浮液、裂解液、洗涤液1、洗涤液2和洗脱液。该试剂盒提取的线粒体DNA利用实时荧光定量PCR进行扩增,线粒体特征基因MT‑ND1、MT‑CO2、MT‑ATP6等均可以被很好地扩增;且同时提取得到的胞质蛋白提取物、线粒体蛋白提取物、核蛋白提取物中各自表达胞质特征蛋白AKT,线粒体特征蛋白VDAC,核特征蛋白Lamin B1,纯度好。本发明的试剂盒能够同时提取线粒体DNA及蛋白,还能获得细胞质DNA、细胞质蛋白、核DNA、核蛋白等产物,方便用于后续的分子生物学分析。
-
公开(公告)号:CN113444793B
公开(公告)日:2022-09-23
申请号:CN202110597293.6
申请日:2021-05-31
申请人: 复旦大学附属中山医院
IPC分类号: C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16B20/50
摘要: 本发明涉及检测肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的试剂盒,所述试剂盒含有检测以下基因表达量的检测试剂:RP11‑539L10.2、AKR1C2、RP11‑572H4.1、TRIM16L、RARA、SESN2、RP5‑827L5.2、CTD‑2139B15.5、Metazoa_SRP、snoU13、RP11‑545H22.1、KRT8P30、TALDO1、TRAPPC13P1、GS1‑388B5.2、RP11‑267L5.1、TRAV11、RP11‑699A7.1、AL132671.1。本发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变,经TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库,实验以及多组学数据库验证,发现该预测方法具有准确性高,特异性好的优点,有很好的应用前景。
-
-
-
-
-
-
-
-
-