HNF4G在检测肺腺癌顺铂敏感性中的应用

    公开(公告)号:CN115927645B

    公开(公告)日:2024-07-26

    申请号:CN202310095574.0

    申请日:2023-02-07

    IPC分类号: C12Q1/6886 G01N33/574

    摘要: 本发明公开了HNF4G在检测肺腺癌顺铂敏感性中的应用。本发明首先基于生物信息学分析,揭示了HNF4G的高表达与顺铂耐药性显著正相关;随后经过一系列生物学实验证实了HNF4G表达与顺铂耐药性的相关性,进一步提出通过检测HNF4G表达来判断肺腺癌对顺铂的敏感性。本发明首次提出了HNF4G可作为生物标志物用于判断肺腺癌对顺铂的敏感性;通过检测HNF4G表达来判断肺腺癌对顺铂的敏感性,具有操作简便、高敏感性、特异性的优点,因此,具有临床推广应用价值。

    评估PI3K/Akt/mTOR通路相关基因突变的试剂盒、系统、储存介质及其应用

    公开(公告)号:CN114134228B

    公开(公告)日:2024-05-03

    申请号:CN202111175274.0

    申请日:2021-10-09

    IPC分类号: C12Q1/6886 G16B20/30

    摘要: 本发明提供一种评估PI3K/Akt/mTOR通路相关基因突变的试剂盒、系统、计算机可读储存介质及其应用,涉及医疗诊断技术领域。所述试剂盒包括检测KRT5、RPL21、NDUFB4、TK1、AQP1、NCLN、PGM1、SMARCA4、INPPL1、TIMM9、SMYD5、NDUFAF2、STMN3,FRAT2、P3H3、MORC4、TFAP2A、IRX2、RASL11A、SPINK5、PRR4、IRS4和CLDN6基因表达量或基因表达相关物质及其产物含量的试剂。所述系统包括数据采集模块、突变评估模块和输出模块。所述计算机可读储存介质包括完成上述系统的程序。本发明所述采用临床已有检测项目的基因作为检测对象,能够在较低检测成本的基础上对PI3K/Akt/mTOR通路相关基因突变进行较高准确度的预测。

    一种检测肺腺癌EGFR突变的miRNA标志物、试剂盒及方法

    公开(公告)号:CN115678998A

    公开(公告)日:2023-02-03

    申请号:CN202211439309.1

    申请日:2022-11-17

    摘要: 本发明公开了一种检测肺腺癌EGFR突变的miRNA标志物、试剂盒及方法。所述的miRNA标志物由miR‑10a‑5p、miR‑10b‑5p、miR‑34a‑5p、miR‑181a‑5p、miR‑203a‑3p、miR‑30e‑3p、miR‑542‑3p和miR‑4772‑3p组成。本发明通过运用limma包筛选与肺腺癌EGFR突变密切相关的差异miRNA,通过Lasso回归和logistic回归构建上述miRNA组合物的评分Score,可用于肺腺癌EGFR突变的检测。本发明的检测方法具有灵敏度、特异度高的特点,同时性价比高,能够简便、快速地为临床上EGFR‑TKI治疗提供科学的指导。

    一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变的ncRNA及预测模型

    公开(公告)号:CN113564259A

    公开(公告)日:2021-10-29

    申请号:CN202111020869.9

    申请日:2021-09-01

    IPC分类号: C12Q1/6886 C12N15/113

    摘要: 本发明公开了一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变的ncRNA及预测模型。本发明通过运用RNA测序、套索算法(LASSO)和二分类Logistic回归获得与细胞周期通路状态高度相关的ncRNA,并构建评分score,进而通过受试者工作曲线(ROC)分析得到肺腺癌中score相应的截断值,可用于预测肺腺癌细胞周期通路相关基因突变。本发明的预测模型经验证在应用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变中具有灵敏度高,特异性强的优点,具有较好的应用前景。

    检测肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的试剂盒

    公开(公告)号:CN113444793A

    公开(公告)日:2021-09-28

    申请号:CN202110597293.6

    申请日:2021-05-31

    摘要: 本发明涉及检测肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的试剂盒,所述试剂盒含有检测以下基因表达量的检测试剂:RP11‑539L10.2、AKR1C2、RP11‑572H4.1、TRIM16L、RARA、SESN2、RP5‑827L5.2、CTD‑2139B15.5、Metazoa_SRP、snoU13、RP11‑545H22.1、KRT8P30、TALDO1、TRAPPC13P1、GS1‑388B5.2、RP11‑267L5.1、TRAV11、RP11‑699A7.1、AL132671.1。与现有技术相比,本发明通过运用RNA测序、LASSO和二分类Logistic回归筛选与抗氧化应激通路相关的基因,并构建评分Score,通过ROC曲线分析得到肺腺癌中相应评分的截断值,可用于肺腺癌中抗氧化应激通路相关基因(KEAP1、NFE2L2、CUL3)突变的预测。该发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变,经TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库,实验以及多组学数据库验证,发现该预测方法具有准确性高,特异性好的优点,有很好的应用前景。

    一种识别肺腺癌肿瘤细胞的基因标志物及其应用

    公开(公告)号:CN113151460A

    公开(公告)日:2021-07-23

    申请号:CN202110127761.3

    申请日:2021-01-29

    摘要: 本发明涉及一种识别肺腺癌肿瘤细胞的基因标志物及其应用,属于分子生物学技术领域。所述基因标志物选自基因ERRFI1、MAL2、RNASE1、ATP11A、CYB5A、LGALS3BP、LPCAT1、SPINT2、ATP1A1、SMIM22和TSPAN3中的至少一种;其中MAL2、CYB5A和ATP11A这三种基因在肺腺癌肿瘤细胞的表达量为正常细胞的3‑6倍,本发明还通过Logistic回归方法建立了风险评估模型,以更准确地识别单细胞类型的肺腺癌肿瘤细胞,该模型的特异性和敏感性均接近90%。本发明的识别肺腺癌肿瘤细胞的基因标志物,为临床上研发诊断肺腺癌的方法和治疗肺腺癌的药物提供了新的分子靶标。

    一种用于评估顺铂治疗肺腺癌敏感性的试剂盒

    公开(公告)号:CN115873955B

    公开(公告)日:2024-08-23

    申请号:CN202211664856.X

    申请日:2022-12-22

    IPC分类号: C12Q1/6886

    摘要: 本发明公开了一种用于评估顺铂治疗肺腺癌敏感性的试剂盒。本发明首先基于一系列细胞实验,结果发现基因RETSAT对铁死亡具有重要的介导作用,由此推断,RETSAT适合于作为预后指标判断肺腺癌患者对顺铂治疗的敏感性。随后采用qPCR的方法检测34例接受顺铂治疗的患者手术切除标本中RETSAT的表达情况,并分析其预后情况,发现RETSAT高表达的患者对顺铂治疗的反应较低表达患者更为敏感,预后较好。因此,RETSAT的表达水平可以用于预判肺腺癌患者对顺铂治疗是否敏感或耐药,利用现有的检测试剂即可方便地检测RETSAT的表达量,具有良好的临床应用价值和推广应用价值。

    一种培美曲塞/顺铂联合化疗治疗肺腺癌预后评估的ODC1基因标志物及其应用

    公开(公告)号:CN117106914A

    公开(公告)日:2023-11-24

    申请号:CN202311103497.5

    申请日:2023-08-30

    IPC分类号: C12Q1/6886 C12Q1/6851

    摘要: 本发明公开了一种培美曲塞/顺铂联合化疗治疗肺腺癌预后评估的ODC1基因标志物及其应用,一方面提出ODC1基因在制备培美曲塞/顺铂联合化疗治疗肺腺癌预后评估的试剂中的应用,ODC1基因的Ensembl号为ENST00000234111.9,同时还提出一种用于评估肺腺癌对培美曲塞/顺铂联合化疗敏感性的试剂盒,其包含检测ODC1表达量的试剂。本发明基于细胞实验和临床数据验证发现ODC1基因对铁死亡具有重要的介导作用,其表达水平与细胞对铁死亡诱导剂及联合化疗处理的敏感性相关,作为生物标志物来辅助预判肺腺癌患者对化疗的敏感性或耐受性,具有重要的临床应用价值。