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公开(公告)号：CN114134228B
公开(公告)日：2024-05-03
申请号：CN202111175274.0
申请日：2021-10-09
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886 , G16B20/30
摘要： 本发明提供一种评估PI3K/Akt/mTOR通路相关基因突变的试剂盒、系统、计算机可读储存介质及其应用，涉及医疗诊断技术领域。所述试剂盒包括检测KRT5、RPL21、NDUFB4、TK1、AQP1、NCLN、PGM1、SMARCA4、INPPL1、TIMM9、SMYD5、NDUFAF2、STMN3,FRAT2、P3H3、MORC4、TFAP2A、IRX2、RASL11A、SPINK5、PRR4、IRS4和CLDN6基因表达量或基因表达相关物质及其产物含量的试剂。所述系统包括数据采集模块、突变评估模块和输出模块。所述计算机可读储存介质包括完成上述系统的程序。本发明所述采用临床已有检测项目的基因作为检测对象，能够在较低检测成本的基础上对PI3K/Akt/mTOR通路相关基因突变进行较高准确度的预测。
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公开(公告)号：CN116555180A
公开(公告)日：2023-08-08
申请号：CN202211163713.0
申请日：2022-09-23
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12N5/09
摘要： 本发明提供了一种包括ALDH3A1抑制剂的铁死亡诱导的增敏剂及其应用，本发明涉及生物医药技术领域。发明人研究发现ALDH3A1的高表达与细胞对铁死亡诱导剂的敏感性呈显著负相关，ALDH3A1抑制剂可作为铁死亡诱导的增敏剂，使铁死亡诱导剂在低浓度下对耐受细胞进行成功诱导，填补了这一领域的空白，为研究铁死亡在不同疾病模型中的作用提供了新的技术手段。
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公开(公告)号：CN116377077A
公开(公告)日：2023-07-04
申请号：CN202310510966.9
申请日：2023-05-09
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886 , G16H20/10 , G16B50/00 , G16B20/30
摘要： 本发明提供了一种预测含铂类新辅助治疗对中晚期肿瘤患者适用性的试剂盒及系统，属于生物医药技术领域。本发明提供了肿瘤组织中分子标记的RNA表达量的定量检测试剂在制备预测含铂类新辅助治疗对中晚期肿瘤患者适用性的试剂盒的应用，其特征在于，所述分子标记包括CD24、D9、DUSP23、KRT19、LRRK2、MAL2、PERP、SPINT2、TACSTD2、TSPAN13、C8orf4、FMO5、CAPN8、MDK、SLC20A1、SPINK13、TANC2、CLDN3、RGMB、S100P、MUC4、C19和f33中的一种或多种。本发明根据肿瘤组织中CD24等分子标记的基因表达量预测中晚期肿瘤患者是否可以从含铂类新辅助治疗中受益，为个性化肿瘤治疗提供判断依据，有助于提高中晚期肿瘤患者的生存率。
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公开(公告)号：CN113444793A
公开(公告)日：2021-09-28
申请号：CN202110597293.6
申请日：2021-05-31
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16B20/50
摘要： 本发明涉及检测肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的试剂盒，所述试剂盒含有检测以下基因表达量的检测试剂：RP11‑539L10.2、AKR1C2、RP11‑572H4.1、TRIM16L、RARA、SESN2、RP5‑827L5.2、CTD‑2139B15.5、Metazoa_SRP、snoU13、RP11‑545H22.1、KRT8P30、TALDO1、TRAPPC13P1、GS1‑388B5.2、RP11‑267L5.1、TRAV11、RP11‑699A7.1、AL132671.1。与现有技术相比，本发明通过运用RNA测序、LASSO和二分类Logistic回归筛选与抗氧化应激通路相关的基因，并构建评分Score，通过ROC曲线分析得到肺腺癌中相应评分的截断值，可用于肺腺癌中抗氧化应激通路相关基因(KEAP1、NFE2L2、CUL3)突变的预测。该发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变，经TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库，实验以及多组学数据库验证，发现该预测方法具有准确性高，特异性好的优点，有很好的应用前景。
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公开(公告)号：CN113151460A
公开(公告)日：2021-07-23
申请号：CN202110127761.3
申请日：2021-01-29
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886 , A61K45/00 , A61P35/00
摘要： 本发明涉及一种识别肺腺癌肿瘤细胞的基因标志物及其应用，属于分子生物学技术领域。所述基因标志物选自基因ERRFI1、MAL2、RNASE1、ATP11A、CYB5A、LGALS3BP、LPCAT1、SPINT2、ATP1A1、SMIM22和TSPAN3中的至少一种；其中MAL2、CYB5A和ATP11A这三种基因在肺腺癌肿瘤细胞的表达量为正常细胞的3‑6倍，本发明还通过Logistic回归方法建立了风险评估模型，以更准确地识别单细胞类型的肺腺癌肿瘤细胞，该模型的特异性和敏感性均接近90％。本发明的识别肺腺癌肿瘤细胞的基因标志物，为临床上研发诊断肺腺癌的方法和治疗肺腺癌的药物提供了新的分子靶标。
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公开(公告)号：CN113736888B
公开(公告)日：2024-02-23
申请号：CN202111161269.4
申请日：2021-09-30
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886
摘要： 本发明提供了一种检测肺鳞癌抗氧化应激驱动通路相关基因突变的试剂、试剂盒和方法，本发明通过运用RNA测序、Lasso套索算法特征筛选抗氧化应激通路相关的基因，通过构建评分RiskScore，运用二分类logistic回归构建模型，并通过ROC曲线得到肺鳞癌中评分RiskScore的最佳截断值，可用于肺鳞癌中抗氧化应激通路相关基因(KEAP1、NFE2L2、CUL3)突变的预测；本发明通过利用各个基因组合得到的表达量来预测肺鳞癌特定驱动通路基因突变，经TCGA数据库验证，该方法具有灵敏度高、特异性好的优点，可以有效指导肺鳞癌患者的个体化治疗，为精准治疗和个体化治疗添加更多重要的希冀，提高临床获益。
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公开(公告)号：CN115354079A
公开(公告)日：2022-11-18
申请号：CN202211076209.7
申请日：2022-09-05
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/6851
摘要： 本发明涉及一种用于检测EGFR靶向药物治疗适用性的试剂盒，属于生物医药技术领域。本发明提供一种用于检测EGFR靶向药物治疗适用性的试剂盒，其中包括检测ZNF263基因表达量的试剂，试剂通过检测ZNF263基因表达量的高低判断患者对EGFR靶向药物治疗的敏感性。本发明可用于在治疗前和治疗中判断肺腺癌患者是否适合采用EGFR靶向药物治疗方案，从而实现精准医疗，有效指导肺腺癌患者的个体化治疗，提高临床获益，同时避免不必要的医疗资源的浪费。本发明具有操作简单，经济实惠，准确性高、灵敏度和特异性好的优点。
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公开(公告)号：CN115261481A
公开(公告)日：2022-11-01
申请号：CN202211113982.6
申请日：2022-09-14
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种检测肺腺癌铁死亡敏感性的试剂盒，其包括：用于从肺腺癌患者肿瘤组织中提取分离mRNA的mRNA提取分离系统；用于MAFF基因的mRNA表达量的MAFF基因检测系统；记载用于确定MAFF表达量高/低分界标准的数学模型载体，当肺腺癌患者肿瘤组织中MAFF表达量高于所述分界标准时，提示患者对铁死亡诱导剂药物治疗敏感；反之当低于所述分界标准时，提示患者对铁死亡诱导剂药物治疗不敏感、或者出现治疗抵抗。
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公开(公告)号：CN112626216B
公开(公告)日：2022-11-01
申请号：CN202011639585.3
申请日：2020-12-31
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886
摘要： 本发明涉及分子诊断技术领域，具体是一种检测肿瘤微卫星不稳定性状态的组合物及其应用，所述组合物由PTMAP4、H3F3AP6、RPL22L1、RP11‑267J23.4、MSH4、LYG1、RP11‑372B4.3、TLE6、RP11‑819M15.2、CIRBP‑AS1、FAM151B、EIF5A、SUMO2P17、FECH、MNX1‑AS1组成。本发明通过运用GSVA算法进行差异分析，获取得到各肿瘤相应的截断值，可用于多种肿瘤的微卫星不稳定性(MSI)状态的检测。通过实验验证，发现该方法具有准确性高、特异性好的优点，有很好的应用前景。
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